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马鹿CDK8基因生物信息学分析与组织表达
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作者 唐成怡 吴玄烨 +2 位作者 吴尽 杨帆 刘学东 《野生动物学报》 北大核心 2023年第3期572-579,共8页
为探究细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8基因(CDK8)在马鹿(Cervus elaphus)鹿茸的皮、间充质、前软骨和软骨组织中的m RNA表达水平和该基因编码蛋白的生物学特性,采用PCR方法克隆马鹿CDK8基因编码区(CDS)全长序列,并连入p MD-18T载体,测得... 为探究细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶8基因(CDK8)在马鹿(Cervus elaphus)鹿茸的皮、间充质、前软骨和软骨组织中的m RNA表达水平和该基因编码蛋白的生物学特性,采用PCR方法克隆马鹿CDK8基因编码区(CDS)全长序列,并连入p MD-18T载体,测得核苷酸序列,进行相似性比对和系统进化树构建;利用生物信息学方法分析CDK8蛋白的组成、结构和理化性质;利用实时荧光定量PCR技术检测CDK8基因m RNA在鹿茸组织中的表达水平。结果表明:马鹿CDK8的CDS全长1254 bp,共编码417个氨基酸;所编码的蛋白相对分子质量为47744.11,理论等电点(p I)为7.28,是一种无信号肽、定位于细胞核的亲水性不稳定蛋白,共38个磷酸化位点,蛋白的二级结构以无规则蜷曲和α螺旋为主。CDK8的mRNA在茸皮组织中表达量最高,其后依次是间充质、软骨和前软骨。CDK8是转录机器中介体复合物的重要组成部分,研究克隆获得马鹿CDK8的CDS全长序列,可为了解鹿茸再生过程中CDK8的作用机制与功能提供重要的基础数据。 展开更多
关键词 鹿茸 CDK8 生物信息学 组织表达
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马鹿SCAI基因的克隆、生物信息学及组织表达分析 被引量:1
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作者 吴玄烨 吴尽 +3 位作者 杨帆 唐成怡 郑冬 刘学东 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2023年第17期128-133,142,共7页
为探究细胞侵袭抑制因子(suppressor of cancer cell invasion,SCAI)基因编码蛋白的生物学特性及基因mRNA在马鹿(Cervus canadensis)鹿茸组织中的表达水平,试验采用PCR方法克隆马鹿SCAI基因编码序列区(CDS区)全长序列,测序后进行核苷酸... 为探究细胞侵袭抑制因子(suppressor of cancer cell invasion,SCAI)基因编码蛋白的生物学特性及基因mRNA在马鹿(Cervus canadensis)鹿茸组织中的表达水平,试验采用PCR方法克隆马鹿SCAI基因编码序列区(CDS区)全长序列,测序后进行核苷酸序列同源性比对并构建系统进化树;通过生物信息学方法分析SCAI蛋白的组成、结构和理化性质等;利用实时荧光定量PCR方法检测SCAI基因mRNA在鹿茸组织中的表达水平。结果表明:马鹿SCAI基因CDS全长1821 bp,与白尾鹿亲缘关系较近;与鸡亲缘关系较远。SCAI基因编码606个氨基酸,相对分子质量为70337.48。理论等电点为8.85,平均亲水性为-0.433,为亲水性蛋白。SCAI蛋白中存在57个潜在磷酸化位点,不存在信号肽,亚细胞主要定位于细胞核中,不属于分泌蛋白。SCAI蛋白的二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比最大,为不稳定蛋白。马鹿SCAI基因在茸皮层中的相对表达量最高,其次为软骨层,在间充质和前软骨层中相对表达量最低。说明SCAI基因参与了马鹿鹿茸的生长发育。 展开更多
关键词 马鹿 SCAI基因 克隆 组织表达 生物信息学
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