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大鼠与小鼠内含子中插入、缺失与替换的速度与模式
1
作者
范彦辉
师奇
+4 位作者
陈金锋
王文娟
庞红侠
唐教伟
陶士珩
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第16期1916-1922,共7页
研究了啮齿类动物大鼠与小鼠内含子中插入(insertion)、缺失(deletion)和替换(substitution)发生的速度与模式.结果表明,缺失比插入发生的频率高,在大鼠和小鼠中单个碱基的插入与缺失发生频率最高.插入与缺失发生次数随长度的增加而迅...
研究了啮齿类动物大鼠与小鼠内含子中插入(insertion)、缺失(deletion)和替换(substitution)发生的速度与模式.结果表明,缺失比插入发生的频率高,在大鼠和小鼠中单个碱基的插入与缺失发生频率最高.插入与缺失发生次数随长度的增加而迅速减少,二者的理论分布都符合幂次法则(power-law).在大鼠内含子中,AT→GC的替换频率高于GC→AT,但在小鼠内含子中GC→AT的替换频率高于AT→GC.大鼠与小鼠内含子中存在的缺失偏好表明,由于可能降低转录与剪切的效率,内含子中的插入比缺失更容易受到自然选择的制约.此外,大鼠与小鼠内含子中的替换模式表明,其内含子的组成及GC含量都处于非平衡状态.
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关键词
插入
缺失
替换
内含子
原文传递
题名
大鼠与小鼠内含子中插入、缺失与替换的速度与模式
1
作者
范彦辉
师奇
陈金锋
王文娟
庞红侠
唐教伟
陶士珩
机构
西北农林科技大学生物信息学研究中心
西北农林科技大学生命科学学院
中国科学院遗传与发育生物学研究所
Biology Education Centre
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第16期1916-1922,共7页
文摘
研究了啮齿类动物大鼠与小鼠内含子中插入(insertion)、缺失(deletion)和替换(substitution)发生的速度与模式.结果表明,缺失比插入发生的频率高,在大鼠和小鼠中单个碱基的插入与缺失发生频率最高.插入与缺失发生次数随长度的增加而迅速减少,二者的理论分布都符合幂次法则(power-law).在大鼠内含子中,AT→GC的替换频率高于GC→AT,但在小鼠内含子中GC→AT的替换频率高于AT→GC.大鼠与小鼠内含子中存在的缺失偏好表明,由于可能降低转录与剪切的效率,内含子中的插入比缺失更容易受到自然选择的制约.此外,大鼠与小鼠内含子中的替换模式表明,其内含子的组成及GC含量都处于非平衡状态.
关键词
插入
缺失
替换
内含子
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大鼠与小鼠内含子中插入、缺失与替换的速度与模式
范彦辉
师奇
陈金锋
王文娟
庞红侠
唐教伟
陶士珩
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
0
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