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基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
1
作者
郭晖
陈鹏
+3 位作者
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
《中国生漆》
2023年第3期51-54,共4页
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(S...
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。
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关键词
漆树(Toxicodendron
vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.)
基因组大小
流式细胞术
K-mer分析
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职称材料
基于广泛靶向代谢组学揭示不同时期漆树生漆中代谢物变化规律
2
作者
商慧颖
翟云雁
+4 位作者
鬲晓敏
刘帅
王尚林
周涛
柏国清
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期66-74,共9页
生漆是一种重要的天然涂料,具有耐热、耐腐蚀和抗酸等优良特性,已广泛应用于各领域。揭示漆树(Toxicodendron vernicifluum)生长过程中生漆代谢物的变化规律是充分挖掘其应用潜力的关键。利用广泛靶向代谢组学技术,通过主成分分析、正...
生漆是一种重要的天然涂料,具有耐热、耐腐蚀和抗酸等优良特性,已广泛应用于各领域。揭示漆树(Toxicodendron vernicifluum)生长过程中生漆代谢物的变化规律是充分挖掘其应用潜力的关键。利用广泛靶向代谢组学技术,通过主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析和聚类热图分析等方法,对不同发育阶段(基于割漆时间)漆树的韧皮部汁液进行分析,探讨不同时期漆树生漆中代谢物的差异和变化规律。结果显示,在不同时期生漆中共鉴定出529种代谢物,包括黄酮类、酚酸类、生物碱、鞣质、糖和醇类及脂质等13类。多元统计分析表明,第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ期生漆的代谢特征相似,且与第Ⅰ期存在较大差异。对不同发育时期生漆代谢物进行比较分析,鉴定出92种共同差异代谢物,其中黄酮类化合物主要积累于第I期生漆中,而氨基酸及其衍生物、糖和醇类在后期生漆中含量较高。研究结果为全面了解不同时期漆树生漆的代谢特征提供了依据,对漆树资源的开发利用具有重要意义。
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关键词
漆树
代谢组学
生漆
差异代谢物
原文传递
单片机技术在通信机房环境监控系统开发中的应用
被引量:
2
3
作者
商慧颖
《信息与电脑(理论版)》
2015年第12期28-29 34,共3页
国内的通信运营商为了确保通信网络的稳定与安全,进一步提高通信网络维护质量、适应通信网络维护改革的实际发展需要,必须不断提升企业各方面的服务质量,采取相应保障措施努力降低通信网络维护运营成本,才能让企业在市场竞争中立于不败...
国内的通信运营商为了确保通信网络的稳定与安全,进一步提高通信网络维护质量、适应通信网络维护改革的实际发展需要,必须不断提升企业各方面的服务质量,采取相应保障措施努力降低通信网络维护运营成本,才能让企业在市场竞争中立于不败之地。基于此,以单片机技术在通信机房环境监控系统开发中的应用为研究对象,对其进行全面深入的探讨与分析。
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关键词
单片机
通信机房
环境监控系统
系统开发
原文传递
牡丹花茶品种的筛选及SSR分子身份证的构建
被引量:
2
4
作者
李程
杨云尧
+3 位作者
张克中
李珊珊
商慧颖
吴静
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第20期6724-6735,共12页
本研究以45个牡丹品种为材料,对其盛花期花瓣中的茶多酚、黄酮、还原糖、可溶性蛋白及维生素C含量进行测定,并用模糊数学隶属函数法综合评价其营养品质,以期筛选出营养综合评价优良的品种,为牡丹花茶的开发和利用提供参考。在此基础上,...
本研究以45个牡丹品种为材料,对其盛花期花瓣中的茶多酚、黄酮、还原糖、可溶性蛋白及维生素C含量进行测定,并用模糊数学隶属函数法综合评价其营养品质,以期筛选出营养综合评价优良的品种,为牡丹花茶的开发和利用提供参考。在此基础上,利用12对多态性好的SSR分子标记构建优良花茶品种的分子身份证。结果表明:‘Hillary’和‘新日月锦’综合营养品质突出,‘花二乔’、‘莲台’、‘太阳’、‘Renow’、‘墨冠玉珠’、‘京云冠’、‘京玉天成’、‘朱砂金点’、‘花王’、‘本地红’、‘皇冠’和‘京墨洒金’这12个品种综合营养品质居上,而‘景玉’、‘Prince Desire’、‘香玉’和‘银红巧对’综合营养品质最差;12对SSR引物共检测到70个等位位点和92个带型,平均每对引物扩增5.83个等位位点和7.67个带型,14个优良牡丹花茶品种SSR分子身份证互不相同,能够达到区分各品种的目的。本研究结果对牡丹花茶的营养品质进行了综合评价,同时DNA分子身份证的构建为牡丹花茶种质资源的鉴定和保护提供了重要作用。
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关键词
牡丹(Paeonia
suffruticosa
Andr.)
花茶
品种筛选
SSR标记
分子身份证
原文传递
题名
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
1
作者
郭晖
陈鹏
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
机构
陕西省林业科学院
陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心
出处
《中国生漆》
2023年第3期51-54,共4页
文摘
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。
关键词
漆树(Toxicodendron
vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.)
基因组大小
流式细胞术
K-mer分析
Keywords
Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.
genome size
flow cytometry
K-mer analysis
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
基于广泛靶向代谢组学揭示不同时期漆树生漆中代谢物变化规律
2
作者
商慧颖
翟云雁
鬲晓敏
刘帅
王尚林
周涛
柏国清
机构
陕西省西安植物园(陕西省植物研究所)
西安交通大学药学院
中华全国供销合作总社西安生漆涂料研究所
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期66-74,共9页
基金
国家自然科学基金(No.32201588,No.31800554)
陕西省重点研发计划(No.2020NY-083)。
文摘
生漆是一种重要的天然涂料,具有耐热、耐腐蚀和抗酸等优良特性,已广泛应用于各领域。揭示漆树(Toxicodendron vernicifluum)生长过程中生漆代谢物的变化规律是充分挖掘其应用潜力的关键。利用广泛靶向代谢组学技术,通过主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析和聚类热图分析等方法,对不同发育阶段(基于割漆时间)漆树的韧皮部汁液进行分析,探讨不同时期漆树生漆中代谢物的差异和变化规律。结果显示,在不同时期生漆中共鉴定出529种代谢物,包括黄酮类、酚酸类、生物碱、鞣质、糖和醇类及脂质等13类。多元统计分析表明,第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ期生漆的代谢特征相似,且与第Ⅰ期存在较大差异。对不同发育时期生漆代谢物进行比较分析,鉴定出92种共同差异代谢物,其中黄酮类化合物主要积累于第I期生漆中,而氨基酸及其衍生物、糖和醇类在后期生漆中含量较高。研究结果为全面了解不同时期漆树生漆的代谢特征提供了依据,对漆树资源的开发利用具有重要意义。
关键词
漆树
代谢组学
生漆
差异代谢物
Keywords
Toxicodendron vernicifluum
metabolomics
raw lacquer
differentially abundant metabolites
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
单片机技术在通信机房环境监控系统开发中的应用
被引量:
2
3
作者
商慧颖
机构
山东理工大学国防教育学院
出处
《信息与电脑(理论版)》
2015年第12期28-29 34,共3页
文摘
国内的通信运营商为了确保通信网络的稳定与安全,进一步提高通信网络维护质量、适应通信网络维护改革的实际发展需要,必须不断提升企业各方面的服务质量,采取相应保障措施努力降低通信网络维护运营成本,才能让企业在市场竞争中立于不败之地。基于此,以单片机技术在通信机房环境监控系统开发中的应用为研究对象,对其进行全面深入的探讨与分析。
关键词
单片机
通信机房
环境监控系统
系统开发
分类号
TN80 [电子电信—信息与通信工程]
TP277 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
原文传递
题名
牡丹花茶品种的筛选及SSR分子身份证的构建
被引量:
2
4
作者
李程
杨云尧
张克中
李珊珊
商慧颖
吴静
机构
北京农学院园林学院城乡生态环境北京实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第20期6724-6735,共12页
基金
北京市优秀人才培养资助青年骨干个人项目(2017000020124G120)
大北农青年教师科研基金项目(16ZK-008)
+1 种基金
北京市属高等学校创新团队建设与教师职业发展计划项目(IDHT20180509)
人才培养质量建设—高水平人才交叉培养-实培计划项目(PXM2017014207000070)共同资助
文摘
本研究以45个牡丹品种为材料,对其盛花期花瓣中的茶多酚、黄酮、还原糖、可溶性蛋白及维生素C含量进行测定,并用模糊数学隶属函数法综合评价其营养品质,以期筛选出营养综合评价优良的品种,为牡丹花茶的开发和利用提供参考。在此基础上,利用12对多态性好的SSR分子标记构建优良花茶品种的分子身份证。结果表明:‘Hillary’和‘新日月锦’综合营养品质突出,‘花二乔’、‘莲台’、‘太阳’、‘Renow’、‘墨冠玉珠’、‘京云冠’、‘京玉天成’、‘朱砂金点’、‘花王’、‘本地红’、‘皇冠’和‘京墨洒金’这12个品种综合营养品质居上,而‘景玉’、‘Prince Desire’、‘香玉’和‘银红巧对’综合营养品质最差;12对SSR引物共检测到70个等位位点和92个带型,平均每对引物扩增5.83个等位位点和7.67个带型,14个优良牡丹花茶品种SSR分子身份证互不相同,能够达到区分各品种的目的。本研究结果对牡丹花茶的营养品质进行了综合评价,同时DNA分子身份证的构建为牡丹花茶种质资源的鉴定和保护提供了重要作用。
关键词
牡丹(Paeonia
suffruticosa
Andr.)
花茶
品种筛选
SSR标记
分子身份证
Keywords
Tree peony(Paeonia suffruticosa Andr.)
Scented tea
Varieties screening
SSR marker
Molecular identification
分类号
TS2 [轻工技术与工程—食品科学与工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
郭晖
陈鹏
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
《中国生漆》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
基于广泛靶向代谢组学揭示不同时期漆树生漆中代谢物变化规律
商慧颖
翟云雁
鬲晓敏
刘帅
王尚林
周涛
柏国清
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
3
单片机技术在通信机房环境监控系统开发中的应用
商慧颖
《信息与电脑(理论版)》
2015
2
原文传递
4
牡丹花茶品种的筛选及SSR分子身份证的构建
李程
杨云尧
张克中
李珊珊
商慧颖
吴静
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
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