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计算机辅助CRISPR向导RNA设计 被引量:1
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作者 王远立 啜国晖 +2 位作者 闫继芳 石雷 刘琦 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1744-1756,共13页
基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑已被成功应用于多种细胞类型中。计算机辅助的向导RNA(Guide RNA)设计是使用CRISPR系统成功进行基因编辑的关键步骤之一。目前的计算工作主要致力于利用计算模型来提高sgRNA的打靶效率并降低其脱靶。文中... 基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑已被成功应用于多种细胞类型中。计算机辅助的向导RNA(Guide RNA)设计是使用CRISPR系统成功进行基因编辑的关键步骤之一。目前的计算工作主要致力于利用计算模型来提高sgRNA的打靶效率并降低其脱靶。文中对于目前存在的sgRNA设计工具进行综述,并且说明可以通过建立高效的计算模型,对当前的异质基因编辑数据进行整合挖掘,以获得无偏差的sgRNA设计规则,并预测影响sgRNA设计的关键特征。笔者认为,对于sgRNA打靶和脱靶效果的系统总结和评价,将有助于使用CRISPR系统进行更加精准的基因编辑和基因治疗。 展开更多
关键词 CRISPR 基因编辑 计算机辅助向导RNA设计 脱靶
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Toward a molecular mechanism-based prediction of CRISPR-Cas9 targeting effects 被引量:2
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作者 Qinchang Chen Guohui Chuai +2 位作者 Chao Zhang Qing Zhang Qi Liu 《Science Bulletin》 SCIE EI CSCD 2022年第12期1201-1204,共4页
The CRISPR-Cas9 system,serving as a powerful genome-editing technology,has revolutionized the life sciences.However,it exhibits off-target activities that may present severe problems in clinical applications.Although ... The CRISPR-Cas9 system,serving as a powerful genome-editing technology,has revolutionized the life sciences.However,it exhibits off-target activities that may present severe problems in clinical applications.Although a great number of in silico models have been developed to predict CRISPR targeting efficiency and specificity,they are running into a bottleneck with the lack of a mechanistic understanding of the on-and off-target activities of Cas9. 展开更多
关键词 SPECIFICITY clinical EDITING
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