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题名日本血吸虫成虫的非编码RNA高通量测序分析
被引量:4
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作者
喻祎哲
杨杰
曾凡胜
王红梅
秦志强
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机构
湖南省益阳市第一中学
湖南省益阳医学高等专科学校
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
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出处
《热带病与寄生虫学》
2017年第1期31-35,共5页
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基金
湖南省教育厅科研课题(项目编号:16C1598)
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文摘
目的通过对日本血吸虫成虫做高通量测序分析,鉴定已知miRNA的表达水平,预测新miRNA的序列结构及生物学功能。方法首先提取日本血吸虫成虫miRNA进行深度测序,其次对miRNA做数据分析、统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA表达水平,最后对发现的新miRNA序列进行结构和功能的预测。结果将构建文库中日本血吸虫表达的miRNA与最新Sanger miRBase数据库中的miRNA比对。结果显示,在鉴定的miRNA中,sja-mir-125b是表达量最高的miRNA,另外sjabantam,sja-mir-10,sja-mir-71a,sja-mir-36,sja-mir-61的表达量也较高,上述六种miRNA表达量占到已知miRNA表达量的94.6%。本研究发现了十种在日本血吸虫表达量最高的新miRNA,并对新miRNA进行序列及结构的预测。结论日本血吸虫成虫新miRNAs例如sja-mir-125b的发现将为深入研究其在血吸虫发育与致病的生物学功能打下基础。
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关键词
非编码核糖核酸
miRNA
高通量测序
日本血吸虫病
成虫
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Keywords
Non-coding RNAs
microRNA
High-throughput sequencing
Schistosoma japonicum
Adult worm
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分类号
R383.24
[医药卫生—医学寄生虫学]
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