2015-2020年北京市怀柔区11种呼吸道病原体流行特征分析

目的探索北京市怀柔区11种常见呼吸道传染病病原体的流行规律。方法从哨点医院每月收集约20例急性呼吸道感染病例,采集呼吸道样本,进行11种常见呼吸道病原体的核酸检测,并对病例进行个案调查。结果2015-2020年,共监测到急性呼吸道感染病例1579例,11种病原体总阳性率为24.00%(95%CI:21.90%~26.10%),检出率前3位分别为:流感病毒6.08%(95%CI:4.90%~7.26%)、副流感病毒3.74%(95%CI:2.80%~4.68%)、肺炎支原体3.29%(95%CI:2.41%~4.17%);大多数病原体每年呈单峰模式流行,流感病毒、呼吸道合胞病毒的流行季主要为冬春季;副流感病毒的流行季主要为夏秋季;肺炎支原体的流行季主要为秋冬季。8.18%(95%CI:5.42%~10.94%)的阳性病例为2种及以上病原体的混合感染。对患者的外周血淋巴细胞计数进行分析,发现28.00%(95%CI:10.30%~35.60%)的鼻病毒阳性病例,24.32%(95%CI:14.54%~34.10%)的流感病毒阳性病例,22.22%(95%CI:3.01%~41.43%)的冠状病毒阳性病例,外周血淋巴细胞计数减少(低于0.8×10^(9)/L)。结论本研究初步摸清怀柔区2015-2020年11种呼吸道病原体(特别是流感病毒之外的病原体)流行强度、流行季节、好发人群等特征,对怀柔区呼吸道传染病防控工作具有重要意义。

我们清澈的爱

2020年1月,我和同事们共同肩负起全区的新型冠状病毒核酸检测工作。每一次操作,都要全神贯注,在三级生物安全防护下,任由汗水肆意地流下。突如其来的北京本土疫情,要求限时完成全民检测,从实验室人员角度以及仪器设备承载量考虑,在当时几乎是不可能完成的任务。

2014-2017年北京市怀柔区急性呼吸道病毒感染病例流行病学分析

目的了解怀柔地区呼吸道病毒感染的病原学和流行病学特征,为临床诊断和治疗提供参考。方法选取2014年8月至2017年12月北京怀柔医院就诊的门诊或住院呼吸道感染患者的咽拭子,应用实时荧光PCR方法对8种呼吸道病毒(包括亚型共14种)进行检测和分析。结果对911份样本进行检测,检出阳性样本244例,阳性率26.78%;病毒感染率前五位的依次为季节性甲型H3N2流感病毒71份(7.79%)、乙型流感病毒34份(3.73%)、副流感病毒31份(3.40%)、鼻病毒25份(2.74%)、呼吸道合胞病毒23份(2.52%)。≤14岁儿童中呼吸道病毒阳性检出率较高,其中2~岁组阳性率最高,为35.66%,不同年龄组人群呼吸道病毒检出率差异有统计学意义(χ~2=21.31,P=0.00)。不同季节吸道病毒检出率不同(χ~2=43.96,P<0.01),冬季最高(42.41%),其次是春季和秋季。流感病毒、RSV和人偏肺病毒感染主要发生在每年的冬春季,PIV感染主要发生在夏秋季。呼吸道病毒在上呼吸道感染病例(31.76%)中的检出率高于下呼吸道感染病例(24.71%)(χ~2=4.44,P=0.04)。结论 14岁及以下儿童呼吸道病毒感染率较高,是防控的重点人群;呼吸道病毒感染呈现一定的季节性特征,冬春季高发。

北京市怀柔区2013-2018年流感监测结果分析

目的分析北京市怀柔区2013-2018年流行性感冒(流感)病原学监测结果和流行特征,为怀柔区流感防治提供科学依据。方法对怀柔区2013-2018年流感样病例(influenza-like illness,ILI)数据和病原学监测结果进行统计分析,分析流感流行变化情况。结果 2013年9月-2018年8月,怀柔区两家哨点医院累计报告ILI 13 313例,ILI就诊百分比为0.37%。采集ILI呼吸道标本11 983份,流感病毒核酸检测阳性2 627例,阳性率为21.92%,其中甲型H3N2亚型(H3N2)1 124例(占42.79%)、新甲型H1N1亚型(甲型H1N1)511例(占19.45%)、乙型Victoria系253例(占9.63%)、乙型Yamagada系739例(占28.13%)。流感呈现冬春季高峰流行,2013-2014年甲型H1N1、H3N2、乙型Yamagata系同时流行,2014-2015年优势流行株主要为H3N2和乙型Yamagata系,2015-2016年为乙型Victoria系,2016-2017年为H3N2,2017-2018年为甲型H1N1和乙型Yamagata系。结论怀柔区2013-2018年各监测年度流感病毒亚型交替流行或者同时流行,流行强度各异,应做好流感病毒的长期监测工作,以便早期发现流感流行变化情况。

2013-2018年北京市怀柔区甲型H3N2流感病毒HA基因分子特征分析

目的分析怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒血凝素(HA)基因的遗传变异特征。方法选取怀柔区2013年9月-2018年8月50株甲型H3N2流感病毒,进行HA基因扩增和测序,运用MEGA6.0软件分析HA的分子特征,并构建系统进化树。结果怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒优势流行株分别为3c.3系(2013年9月-2014年8月)、3c.3a系(2013年9月-2015年8月)和3c.2a系(2015年9月-2018年8月)。系统进化树分析显示,同一监测年度的流行株基本呈现集中分布,各监测年度流行株与当年推荐流感疫苗株距离均较远。分子特征显示HA蛋白5个抗原决定簇均发生变异,有29处氨基酸位点发生变异,变异频率逐年增加;受体结合位点发生N225D、T131K和T135K/N变异;糖基化位点自2015年9月-2018年8月变化增加,144NSS消失,部分流行株新增了142NSS、158NYT和135NSS。结论怀柔区2013-2018年甲型H3N2流感病毒HA基因不断发生突变,变异频率增加,可能出现了抗原漂移,与当年推荐疫苗株匹配程度降低,近期应加强对流感病毒分子变异的监测。

2014-2022年北京市怀柔区流感样病例流行情况及病原学监测分析

目的分析2014—2022年北京市怀柔区流行性感冒(流感)流行情况和病原学特征,为流感防控提供科学依据。方法收集2014—2022年北京市怀柔区流感样病例(ILI)数据和病原学监测结果进行描述及统计分析。结果2014年9月至2022年8月,怀柔区两家哨点医院累计报告ILI 49716例,占门/急诊总数的0.35%。8年共采集ILI咽拭子标本17156份,其中流感病毒阳性标本3091份,阳性率为18.02%。25~岁年龄组阳性占比较高,为20.21%。各监测年度流感阳性率高峰均集中于当年12月至次年3月,各年度流感病毒亚型构成比差异有统计学意义(χ^(2)=1785.065,P<0.001),主要亚型为甲型H3N2和乙型Victoria系。2020年后流感病毒阳性率明显降低。结论2014—2022年北京市怀柔区流感病毒流行季节主要为冬春季,流感病毒各亚型交替流行或同时流行,流行强度不同。25~岁人群是重点防控人群。综合疫情防控措施也可以显著降低流感的流行强度。

北京市怀柔区2013—2018年间甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析

目的分析北京市怀柔区2013—2018年间甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因的变异情况,了解其遗传进化特征.方法选取北京市怀柔区2013—2018年间不同监测年度、明确鉴定为甲型H1N1流感病毒亚型的细胞培养阳性毒株42株,通过RT-PCR扩增、测序并获得HA基因序列.运用MEGA 6.0软件分析HA的分子特征,构建系统进化树.结果 2013—2018年间各监测年度流感病毒株与疫苗株A/California/07/2009的HA基因核苷酸的平均遗传距离分别为0.017、0.020、0.028、0.027、0.033.系统进化树结果显示,甲型H1N1流感病毒有两大分支:2013—2015年聚集至A/California/07/2009分支;2016—2018聚集至A/Michigan/45/2015(6B.1)分支.HA抗原位点发生变异的有10处,包括S220T、P154S、H155Y、E252G、S91R、K180Q、S181T、S179N、S202T、A203V.结论北京市怀柔区2013—2018年甲型H1N1流感病毒HA基因在不断地发生变异,与2009年疫苗株的距离在逐渐增加,抗原决定簇变异频率增高、基因的多样性增加,均提示监测流感病毒分子特征的重要性.