病原菌分子分型监测在早期识别伤寒聚集性疫情中的应用

目的应用全基因组测序(WGS)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术鉴别新疆一起疑似聚集性伤寒疫情。方法通过新疆维吾尔自治区传染病报告系统收集5例伤寒病例,对5例病例的流行病学史进行回顾性调查,重点针对病例的诊断过程以及疑似感染来源进行调查,同时对5株分离到的伤寒沙门菌进行WGS和PFGE分析和聚类,最后结合流行病学调查结果,判定疫情性质。结果5株伤寒沙门菌的基因组序列、PFGE图谱、耐药表型和耐药基因高度一致;流行病学调查发现,5例病例曾于同一天在同一家餐馆就餐。结论结合伤寒最长潜伏期、病原菌分子分型和流行病学调查结果,可初步判定此次疫情为一起通过就餐食物而感染伤寒沙门菌的聚集性疫情。

2003-2013年新疆维吾尔自治区哨点医院的志贺菌菌型分布及变迁分析

细菌性痢疾（菌痢）是新疆维吾尔自治区（新疆自治区）主要的肠道传染病之一。随着人们生活水平的提高、卫生习惯的改变以及改水等基础设施的改善，菌痢发病率呈逐年下降趋势。但就全国范围来看，新疆自治区菌痢发病率排序靠前，仍然是影响新疆自治区人群健康的重要传染病之一。由于志贺菌属菌型较多，且较为复杂，易变迁，是影响着菌痢流行特征的主要因素之一。