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基于16S rRNA测序技术分析圈养黑叶猴肠道微生物
1
作者
木仁
夏张琴
+2 位作者
韩朝恒
格根图雅
徐文斌
《现代畜牧兽医》
2024年第7期17-23,共7页
研究旨在明确圈养黑叶猴(Trachypithecus francoisi)肠道菌群结构及功能,采用16S rRNA高通量测序技术对3只圈养成年个体(雄性记为M,雌性记为Fa和Fb)的粪便样品进行分析。结果显示,3只个体共注释到10个门,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes...
研究旨在明确圈养黑叶猴(Trachypithecus francoisi)肠道菌群结构及功能,采用16S rRNA高通量测序技术对3只圈养成年个体(雄性记为M,雌性记为Fa和Fb)的粪便样品进行分析。结果显示,3只个体共注释到10个门,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),M个体厚壁菌门和螺旋体门(Spirochaetes)的相对丰度显著低于Fa和Fb个体(P<0.05),WPS-2相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01)。3只个体共注释到76个属,M个体毛螺菌科未分类属和f_鼠杆菌科_未分类属的相对丰度显著高于Fa和Fb个体(P<0.05),f_uncultured_rumen_bacterium_unclassified的相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01)。M个体瘤胃球菌UCG-005、密螺旋体科_2相对丰度显著低于Fa和Fb个体(P<0.05),瘤胃球菌UCG-002、瘤胃球菌UCG-013、f_瘤胃球菌_未分类属和瘤胃球菌UCG-014相对丰度极显著低于Fa和Fb个体(P<0.01)。M个体中未发现dgA-11_gut_group,Fa和Fb个体中未发现梭杆菌属(Fusobacterium)。KEGG分析发现,M个体新陈代谢通路富集基因相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01),但细胞过程通路富集基因相对丰度极显著低于Fa和Fb个体(P<0.01)。研究表明,圈养黑叶猴的雄性个体M与雌性个体Fa和Fb间肠道菌群组成及功能存在较大差异,可能主要与性别间的生理差异有关。
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关键词
16S
rRNA
圈养黑叶猴
肠道菌群
厚壁菌门
拟杆菌门
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职称材料
题名
基于16S rRNA测序技术分析圈养黑叶猴肠道微生物
1
作者
木仁
夏张琴
韩朝恒
格根图雅
徐文斌
机构
黔南民族师范学院生物科学与农学院
黔南州特色畜禽分子技术应用重点实验室
黔南民族师范学院图书馆
浙江大学动物科学学院
出处
《现代畜牧兽医》
2024年第7期17-23,共7页
基金
贵州省科技计划项目(黔科合支撑〔2017〕2853)
黔南民族师范学院教育质量提升工程(2021xjg016)
贵州省大学生创新创业训练计划项目(S202210670057、S202310670033)。
文摘
研究旨在明确圈养黑叶猴(Trachypithecus francoisi)肠道菌群结构及功能,采用16S rRNA高通量测序技术对3只圈养成年个体(雄性记为M,雌性记为Fa和Fb)的粪便样品进行分析。结果显示,3只个体共注释到10个门,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),M个体厚壁菌门和螺旋体门(Spirochaetes)的相对丰度显著低于Fa和Fb个体(P<0.05),WPS-2相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01)。3只个体共注释到76个属,M个体毛螺菌科未分类属和f_鼠杆菌科_未分类属的相对丰度显著高于Fa和Fb个体(P<0.05),f_uncultured_rumen_bacterium_unclassified的相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01)。M个体瘤胃球菌UCG-005、密螺旋体科_2相对丰度显著低于Fa和Fb个体(P<0.05),瘤胃球菌UCG-002、瘤胃球菌UCG-013、f_瘤胃球菌_未分类属和瘤胃球菌UCG-014相对丰度极显著低于Fa和Fb个体(P<0.01)。M个体中未发现dgA-11_gut_group,Fa和Fb个体中未发现梭杆菌属(Fusobacterium)。KEGG分析发现,M个体新陈代谢通路富集基因相对丰度极显著高于Fa和Fb个体(P<0.01),但细胞过程通路富集基因相对丰度极显著低于Fa和Fb个体(P<0.01)。研究表明,圈养黑叶猴的雄性个体M与雌性个体Fa和Fb间肠道菌群组成及功能存在较大差异,可能主要与性别间的生理差异有关。
关键词
16S
rRNA
圈养黑叶猴
肠道菌群
厚壁菌门
拟杆菌门
Keywords
16S rRNA
Captive Trachypithecus francoisi
Gut microbiota
Firmicutes
Bacteroidetes
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于16S rRNA测序技术分析圈养黑叶猴肠道微生物
木仁
夏张琴
韩朝恒
格根图雅
徐文斌
《现代畜牧兽医》
2024
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