高通量测序揭示系统性红斑狼疮B细胞异常的研究进展

系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种以致病性自身抗体和免疫复合物形成并介导多器官损伤的急性或慢性自身免疫病,好发于育龄期女性,具有显著异质性。自身反应性B细胞过度活化产生自身抗体是SLE全身免疫病理损伤的重要原因,靶向B细胞治疗SLE的显著疗效提示其在疾病发生和进展中的重要作用。由于自身反应性B细胞参与疾病进展的具体机制和标志分子尚不明确,目前,B细胞耗竭疗法均是针对总的B细胞群体,无法靶向清除自身反应性B细胞。随着科学技术手段的进步,高通量测序技术为研究SLE B细胞异常提供了新思路。本综述重点就高通量测序揭示B细胞受体新的异常、新的B细胞亚群和B细胞相关治疗靶点等在SLE中的作用进展进行总结和讨论,为深入了解SLE的发病机制和探讨治疗方法提供借鉴。

单细胞测序揭示B细胞在慢阻肺病中作用机制的研究

目的基于单细胞测序数据及蛋白质相互作用分析探究B细胞在慢阻肺病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发病机制中的可能作用。方法在基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中获取COPD和类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)模型小鼠外周血的单细胞测序数据,通过降维聚类及人工注释的方法筛选出B细胞,采用R软件以差异倍数(fold change,FC)≥1.2且P<0.05为条件筛选差异基因,比对COPD和RA模型小鼠数据获得共同差异基因,形成蛋白通路,并利用基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和蛋白质互作网络分析对人类COPD肺组织单细胞测序数据进行验证。结果COPD模型小鼠的B细胞单细胞测序结果显示,与RA模型小鼠B细胞数据共同的差异基因为Cd74(log_(2)FC=0.26,P<0.001)、Ctla2a(log_(2)FC=-0.33,P<0.001)、H2-Ab1(log_(2)FC=0.33,P<0.001)、H2-Aa(log_(2)FC=0.36,P<0.001)、Rpl14(log_(2)FC=0.28,P<0.001)、Akap12(log_(2)FC=-0.58,P<0.001)、H2-Eb1(log_(2)FC=0.42,P<0.001)、Bcl2(log_(2)FC=0.29,P<0.001),所形成的蛋白通路涉及MHCⅡ类分子介导的抗原加工和呈递、自身免疫、淋巴细胞活化等。上述差异基因在人类COPD肺组织单细胞测序数据中也表现出趋势相同的差异表达,形成类似蛋白通路,其中Cd74、H2-Aa、H2-Eb1、Bcl2分别对应人类同源基因CD74(log_(2)FC=0.80,P<0.001)、HLA-DQA1(log_(2)FC=0.84,P<0.001)、HLA-DRB1(log_(2)FC=0.49,P<0.001)、BCL2(log_(2)FC=0.40,P=0.034)。且与对照组相比,人类COPD肺组织数据中B细胞的占比明显增高。结论B细胞过度增殖/活化及B细胞抗原提呈作用增强可能导致自身免疫应答,进而参与COPD的发生、发展,并导致肺组织不可逆性的损伤。