优良黄皮品种的全基因组Survey分析

黄皮是一种富有多种营养价值和药用价值南方小宗水果,本研究挑选优良的三个黄皮品种,分别是鸡心黄皮、无籽黄皮、贵妃黄皮,通过对测序数据的质量控制和组装,完成了三个不同品种黄皮的基因组特征评估,获得了不同品种黄皮基因组特征,这些特征包含基因组大小、杂合度、重复序列以及GC含量信息,同时,通过这些特征对三个品种黄皮基因组进行了初步组装。预估基因组结果表明:(1)三个不同品种预估基因组大小介于252~275 Mb,杂合度介于0.22%~0.58%,GC含量介于33.21%~43.16%;(2)初步组装三个品种黄皮基因组大小在310 Mb左右,N50均超过1000 bp,通过基因组调查分析为后续相关品种黄皮全基因组测序提供重要理论依据,也为黄皮分子机理研究及黄皮育种提供有用的材料。

UPLC-MS/MS法测定海南益智果实挥发油成分

为研究海南野生益智果实代谢产物与代谢差异,于5月份果实成熟期早期采集海南益智来研究其挥发油化合物特征。本研究选取20组表型差异较大的海南典型野生益智果实为研究对象,利用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)的代谢组学技术分析其代谢产物。共鉴定出239种代谢物成分,其中共有代谢物202种,差异代谢物37种。与成熟期益智果实挥发油化合物以倍半萜类和黄酮类为主不同,本研究发现在益智果实发育早期其果实挥发油化合物中特征性化合物大多为萜类和杂环化合物,其中相对含量高的为特征化合物包括4-(2-氨基乙基)吡啶、异-3-叔丁基乙酸酯等。通过KEGG富集分析发现,所有化合物共富集到了8条不同的代谢通路,其中6,6-二甲基-双环(3.1.1)庚-2-烯-2-甲醛、柠檬醛B、(-)-β-双萜烯和月桂烯4种化合物在不同代谢通路的富集中发挥着更重要的作用。本研究对采集的益智果实挥发油进行分析,比较了其中的代谢物成分,获得的结果可为后续益智人工栽培研究、育种和其在医药、食品等行业中的进一步开发应用提供科学依据。