基于网络药理学和分子对接技术探究知柏地黄汤治疗膀胱癌的作用机制

通过建立“组分-靶点-生物学通路”,探寻知柏地黄汤主要活性成分治疗膀胱癌的物质基础.建立知柏地黄汤组分库,借助TCMSP数据库获得中药作用靶点.基于GeneCards数据库检索与膀胱癌相关靶点并与中药靶点映射得到关键靶点,通过STRING平台构建关键靶点互作网络.采用Cytoscape 3.7.2软件识别Hub靶点,借助DAVID 6.8数据库探寻组分抗膀胱癌的关键通路并对关键靶点进行GO富集分析,采用Schr?dinger进行Hub靶点与知柏地黄汤组分的分子对接验证.获得包括VEGFA,FOS,MYC,CASP3,CCND1,HIF1A在内的Hub靶点9个,映射GO结果759条,集中在生物过程.映射KEGG通路56条,如PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、p53信号通路等.分子对接筛选出毛蕊花糖苷、梓醇、知母皂苷BII等先导化合物.知柏地黄汤治疗膀胱癌的潜在机制可能与参与抗炎、调节糖脂代谢及氧化应激等过程有关,为阐明知柏地黄汤对膀胱癌的作用机制提供了科学依据.

基于系统虚拟药理学与归经理论研究归大肠经中药抗结直肠癌药效物质基础

目的:基于系统虚拟药理学与归经理论研究归大肠经中药抗结直肠癌(CRC)药效物质基础,对该类中药在分子网络层面上进行探析。方法:选择了10个CRC相关靶点,构建归大肠经中药化学成分分子数据库,探讨数据库分子与CRC靶点间相互作用关系,并应用Western blot对部分数据进行了验证。结果:共筛选出30个归大肠经中药活性分子与10个CRC靶点有一定的潜在协同效应。结论:本实验从分子层次上阐释了归大肠经中药抗CRC药效物质基础,为该类中药的临床应用提供了科学依据,同时也为寻找抗CRC药物提供一定的参考和借鉴。

基于系统药理学方法探究荆花胃康胶丸干预幽门螺杆菌所致炎症反应机制

目的:探究荆花胃康胶丸(Jinghua Weikang capsule, JWC)干预幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)所致炎症反应的作用机制。方法:采用Schr9dinger(2018)平台的QikProp模块过滤不符合ADME参数的JWC成分,用R语言factoextra和Facto MineR包对剩余成分进行主成分分析。借助Pharm Mapper Server和SwissTarget Prediction平台预测阳性药的作用靶点,并与OMIM、Genecards和DisGeNET数据库获得的Hp感染靶点取交集,获得阳性药对Hp感染的治疗靶点。采用Schr9dinger软件探究潜在活性成分对Hp感染治疗靶点的作用效果,借助R语言的pheatmap包构建对接结果的聚类分析热图。利用Cytoscape软件构建"药效成分-疾病靶点"网络模型,借助CluoGO插件分析JWC治疗Hp感染的作用通路。将水团花主要成分与BabA进行分子对接,探究水团花对Hp粘附的抑制作用。结果:13个候选活性化合物主要来自于土荆芥,分别作用于核心靶点TAK1、TAB1、RELB、MAPK14、MAPK11、JNK1、IKKB和ERK1。靶点映射得到KEGG通路28条,其中NF-κB/MAPK信号通路的富集靶点数最多。对接结果显示,水团花可能通过竞争性抑制黏附素BabA发挥抗Hp疗效。结论:JWC可能通过调控黏附素-MAPK/NF-kB信号通路干预Hp感染所致炎症反应。