目的建立鱼胶种属鉴别的DNA条形码方法。方法使用不同试剂盒对鱼胶核酸提取效果进行评价和优化,筛选出适用于鱼胶的核酸提取方法,选取3对引物进行扩增对比,建立鱼胶种属鉴别的DNA条形码方法。基于建立的方法,对44份鱼胶样品进行特异性扩...目的建立鱼胶种属鉴别的DNA条形码方法。方法使用不同试剂盒对鱼胶核酸提取效果进行评价和优化,筛选出适用于鱼胶的核酸提取方法,选取3对引物进行扩增对比,建立鱼胶种属鉴别的DNA条形码方法。基于建立的方法,对44份鱼胶样品进行特异性扩增,并根据生命条形码系统(barcode of life data system,BOLD)进行物种鉴定,同时进行系统进化分析。结果对44份鱼胶样品的鉴定结果显示,样品分属8科,11属,15种,石首鱼科(15个)和尖吻鲈科(20个)占比79.5%。系统发育分析表明,同物种的不同个体都聚在了一起,同属以及同科不同属的物种也聚在一支,界限分明。序列比对和系统发育分析较一致确认鱼胶所属的鱼类种类。结论建立的方法能高效、准确地对鱼胶进行种属鉴定,研究结果可有效预防和降低鱼胶产品交易中的欺诈行为,也为促进我国鱼胶产品的高质量发展和进出口贸易的稳定发展提供有利的技术支持。展开更多
基于微滴式数字PCR平台,建立了一种在同一个微滴反应体系中同时检测油菜样品中两种靶标序列的双重微滴式数字PCR(duplex-ddPCR)定量分析方法。试验结果表明,内参基因和品系特异性基因均能特异性扩增出来,所建立的RF1品系duplex-ddPCR方...基于微滴式数字PCR平台,建立了一种在同一个微滴反应体系中同时检测油菜样品中两种靶标序列的双重微滴式数字PCR(duplex-ddPCR)定量分析方法。试验结果表明,内参基因和品系特异性基因均能特异性扩增出来,所建立的RF1品系duplex-ddPCR方法特异性好。在单位体系内参和外源基因拷贝数位于18~23077的区间内可以呈现出良好的线性,r2=0.999。经验证,本方法的定量检测限(LOQ)和最低检测限(LOD)分别为18拷贝/反应和3.7拷贝/反应。精密度试验结果表明两组浓度的DNA样品所得到的平行试验结果的标准偏差(relative standard deviations,RSD)介于8.40%~24.50%,准确度试验结果显示标准偏差RSD值介于5.97%~12.64%,均达到了对方法精密度RSD和准确度RSD小于25%的要求。综上所述,本研究所建立的duplex-ddPCR定量分析方法可用于转基因油菜RF1的定量检测。展开更多
文摘目的建立鱼胶种属鉴别的DNA条形码方法。方法使用不同试剂盒对鱼胶核酸提取效果进行评价和优化,筛选出适用于鱼胶的核酸提取方法,选取3对引物进行扩增对比,建立鱼胶种属鉴别的DNA条形码方法。基于建立的方法,对44份鱼胶样品进行特异性扩增,并根据生命条形码系统(barcode of life data system,BOLD)进行物种鉴定,同时进行系统进化分析。结果对44份鱼胶样品的鉴定结果显示,样品分属8科,11属,15种,石首鱼科(15个)和尖吻鲈科(20个)占比79.5%。系统发育分析表明,同物种的不同个体都聚在了一起,同属以及同科不同属的物种也聚在一支,界限分明。序列比对和系统发育分析较一致确认鱼胶所属的鱼类种类。结论建立的方法能高效、准确地对鱼胶进行种属鉴定,研究结果可有效预防和降低鱼胶产品交易中的欺诈行为,也为促进我国鱼胶产品的高质量发展和进出口贸易的稳定发展提供有利的技术支持。
文摘基于微滴式数字PCR平台,建立了一种在同一个微滴反应体系中同时检测油菜样品中两种靶标序列的双重微滴式数字PCR(duplex-ddPCR)定量分析方法。试验结果表明,内参基因和品系特异性基因均能特异性扩增出来,所建立的RF1品系duplex-ddPCR方法特异性好。在单位体系内参和外源基因拷贝数位于18~23077的区间内可以呈现出良好的线性,r2=0.999。经验证,本方法的定量检测限(LOQ)和最低检测限(LOD)分别为18拷贝/反应和3.7拷贝/反应。精密度试验结果表明两组浓度的DNA样品所得到的平行试验结果的标准偏差(relative standard deviations,RSD)介于8.40%~24.50%,准确度试验结果显示标准偏差RSD值介于5.97%~12.64%,均达到了对方法精密度RSD和准确度RSD小于25%的要求。综上所述,本研究所建立的duplex-ddPCR定量分析方法可用于转基因油菜RF1的定量检测。