运用EMBOSS(The european molecular biology open software suite)软件包中的CHIPS(Condonheterozygosity in a protein coding sequence)和CUSP(Create a condon usage table)程序对红豆杉属的52个基因的密码子偏性进行综合分析,并与...运用EMBOSS(The european molecular biology open software suite)软件包中的CHIPS(Condonheterozygosity in a protein coding sequence)和CUSP(Create a condon usage table)程序对红豆杉属的52个基因的密码子偏性进行综合分析,并与大肠杆菌、酵母、拟南芥和水稻的密码子偏性进行比较。结果表明,红豆杉属基因的Nc(有效密码子数)为45~58,大部分密码子使用频率较为一致。部分氨基酸密码子使用频率存在较大差异,如Ala、Asp、Phe、Gly、His、Asn、Arg、Thr、Tyr等。红豆杉属基因密码子偏性与拟南芥等双子叶植物较接近,与原核生物和单子叶植物相差较远。展开更多
文摘运用EMBOSS(The european molecular biology open software suite)软件包中的CHIPS(Condonheterozygosity in a protein coding sequence)和CUSP(Create a condon usage table)程序对红豆杉属的52个基因的密码子偏性进行综合分析,并与大肠杆菌、酵母、拟南芥和水稻的密码子偏性进行比较。结果表明,红豆杉属基因的Nc(有效密码子数)为45~58,大部分密码子使用频率较为一致。部分氨基酸密码子使用频率存在较大差异,如Ala、Asp、Phe、Gly、His、Asn、Arg、Thr、Tyr等。红豆杉属基因密码子偏性与拟南芥等双子叶植物较接近,与原核生物和单子叶植物相差较远。