目的本文采用网络药理学和分子对接方法研究黄芪-丹参治疗脓毒症的作用机制。方法分别在中药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)平台中检索并得到黄芪和丹参...目的本文采用网络药理学和分子对接方法研究黄芪-丹参治疗脓毒症的作用机制。方法分别在中药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)平台中检索并得到黄芪和丹参的活性成分及相关作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库筛选出脓毒症的相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-疾病-靶点"网络图,运用String数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图。对药物-疾病的交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的富集分析。再通过Cystoscap 3.7.2软件的NetworkAnalyzer工具对PPI网络进行拓扑分析,并采用AutoDock Tools 1.5.6软件对核心成分和关键靶点进行分子对接验证。结果通过筛选得到药物有效成分142个。黄芪-丹参与疾病交集的靶点共83个。GO功能富集分析共富集到1 748条生物过程,94项分子功能相关,54项细胞组成相关(P<0.05)。KEGG通路富集分析筛选得到141条信号通路(P<0.05),主要包括流体剪切应力和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、白介素-17信号通路及肿瘤坏死因子信号通路等。结论黄芪-丹参可能通过抗动脉粥样硬化、抗炎、抗感染及调节免疫功能等来治疗脓毒症,为其临床应用提供了理论依据。展开更多
文摘目的本文采用网络药理学和分子对接方法研究黄芪-丹参治疗脓毒症的作用机制。方法分别在中药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)平台中检索并得到黄芪和丹参的活性成分及相关作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库筛选出脓毒症的相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-疾病-靶点"网络图,运用String数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图。对药物-疾病的交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的富集分析。再通过Cystoscap 3.7.2软件的NetworkAnalyzer工具对PPI网络进行拓扑分析,并采用AutoDock Tools 1.5.6软件对核心成分和关键靶点进行分子对接验证。结果通过筛选得到药物有效成分142个。黄芪-丹参与疾病交集的靶点共83个。GO功能富集分析共富集到1 748条生物过程,94项分子功能相关,54项细胞组成相关(P<0.05)。KEGG通路富集分析筛选得到141条信号通路(P<0.05),主要包括流体剪切应力和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、白介素-17信号通路及肿瘤坏死因子信号通路等。结论黄芪-丹参可能通过抗动脉粥样硬化、抗炎、抗感染及调节免疫功能等来治疗脓毒症,为其临床应用提供了理论依据。