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黄瓜绿斑驳花叶病毒海南分离物基因组测定与毒源分析 被引量:13
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作者 王峰 任春梅 +5 位作者 季英华 缪倩 姚恋秋 周益军 徐冬青 程兆榜 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期75-81,共7页
为分析2012年采自海南西瓜上具黄瓜绿斑驳花叶病毒侵染典型症状的病毒分离物CGMMV-HaiN12的分子特征和可能来源,以病叶总RNA为模板,分3段进行RT-PCR扩增,测定了该分离物基因组全长序列。结果表明CGMMV-HaiN12基因组全长为6425 bp(Ge... 为分析2012年采自海南西瓜上具黄瓜绿斑驳花叶病毒侵染典型症状的病毒分离物CGMMV-HaiN12的分子特征和可能来源,以病叶总RNA为模板,分3段进行RT-PCR扩增,测定了该分离物基因组全长序列。结果表明CGMMV-HaiN12基因组全长为6425 bp(GenBank登录号KC852074),与已报道的CGMMV分离物相比,除5′和3′端非编码区核苷酸数目略有不同外,编码区的基因结构完全相同。CGMMV-HaiN12全基因组序列与韩国分离物AF417242的相似性为99.6%、遗传距离为0.004,在进化树的末端两者聚为一支。将CGMMV-HaiN12与已发布的中日韩分离物的外壳蛋白基因序列进行遗传进化分析,所有分离物在0.000~0.027的遗传距离上聚为一支,显示这些分离物具有高度的相关性,而与欧洲的西班牙和俄罗斯的2个代表分离物具有较大差别。在进化树末端,CGMMV-HaiN12与3个韩国分离物(AJ245440、JF838188、AF417242)、2个我国湖南分离物(JQ715592、JQ715595)聚为一支,表明CGMMV-HaiN12可能由韩国传入,并且与传入我国湖南的分离物高度同源。在海南本地不进行西瓜制种的情况下,为控制CGMMV在海南的危害应加强对进入海南的西瓜和砧木种子的检疫工作。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 基因组结构 遗传距离 进化树
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基于江苏省近20年土地利用数据的信息挖掘与分析 被引量:2
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作者 姚恋秋 李杨 +2 位作者 施歌 梁鸣霄 江南 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第24期262-267,共6页
从统计学、时间序列和空间地理位置3个角度,对江苏省20世纪80年代末至2010年共20年(分5期:20世纪80年代末及1995、2000、2005、2010年)的土地利用数据进行空间数据挖掘。首先计算每2期数据之间的土地利用转移概率矩阵,对20年来江苏省土... 从统计学、时间序列和空间地理位置3个角度,对江苏省20世纪80年代末至2010年共20年(分5期:20世纪80年代末及1995、2000、2005、2010年)的土地利用数据进行空间数据挖掘。首先计算每2期数据之间的土地利用转移概率矩阵,对20年来江苏省土地利用变化情况进行统计学分析;再使用代码融合的方法合成4期土地利用变化图谱;最后分别对4期图像提取主要变化类别的土地利用变化图斑重心,从空间和时间上对土地利用变化方式进行分析。结果发现,从时间上来看,前15年土地类型大体稳定,最后5年土地类型变化剧烈;从统计学角度上看,土地利用变化类型趋于多元化,变化面积增大,各种土地利用类型之间的变化越来越活跃;从空间位置上看,土地利用变化程度苏南大于苏北。江苏省土地利用的变化与经济发展的趋势相吻合,两者相互影响,有着正反馈关系。 展开更多
关键词 土地利用 变化重心 信息图谱 数据挖掘 转移概率矩阵 江苏省
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基于GIS和兴趣点(POI)数据的城市中心体系识别方法研究——以上海市为例 被引量:11
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作者 施歌 江南 姚恋秋 《现代测绘》 2017年第6期27-30,共4页
城市公共中心高度聚集了各类城市公共管理与公共服务设施。近年来城市建设发展迅速,传统的抽样调查等方法已不能满足新时代需要。互联网与计算机技术的发展给城市研究提供了新思路:城市兴趣点(POI)数据涵盖了广泛的地理空间和位置属性... 城市公共中心高度聚集了各类城市公共管理与公共服务设施。近年来城市建设发展迅速,传统的抽样调查等方法已不能满足新时代需要。互联网与计算机技术的发展给城市研究提供了新思路:城市兴趣点(POI)数据涵盖了广泛的地理空间和位置属性并且对公众开放。本研究使用POI数据,结合核密度估算(KED)模型定量研究其空间分布规律并对上海市城市中心体系的识别。结果显示,根据POI数据分析识别的上海市城市中心体系整体呈现单中心发展态势,城市副中心与郊区中心发展力度不足,尚有待进一步建设。将结果与《上海市城市总体规划(1999—2020年)》确定的城市公共中心体系进行对比,提出优化建议。 展开更多
关键词 GIS 大数据 城市兴趣点 城市中心体系 上海市
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大数据背景下基于兴趣点(POI)数据的城市功能区识别——以南京市主城区为例
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作者 施歌 何彬 +1 位作者 姚恋秋 江南 《城市地理┿城乡规划》 2018年第2期17-22,31,共7页
本文以南京市主城区的322000条POI数据为基础,利用基于知识的决策树分类方法对南京市的城市功能区进行识别,探索城市功能类型.结果显示1.南京市都市区构建形成以主城为核心,以放射性交通走廊为发展轴,以生态空间为绿楔的现代都市区空间... 本文以南京市主城区的322000条POI数据为基础,利用基于知识的决策树分类方法对南京市的城市功能区进行识别,探索城市功能类型.结果显示1.南京市都市区构建形成以主城为核心,以放射性交通走廊为发展轴,以生态空间为绿楔的现代都市区空间格局.2.南京市结合自然条件、交通走廊布局和区域联系主要方向,都市区内形成了“一带五轴”的城镇布局结构.3.与南京市城市总体规划进行对比分析,显示基于POI数据的城市功能区识别结果精度较高,与规划分区基本吻合.为城市规划的编制提供了实际的参考依据,且为利用开放数据进行规划应用提供了新的思路和方法. 展开更多
关键词 南京市 兴趣点数据 数据挖掘 城市功能区 决策树
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苏辽粳稻区稻瘟病菌群体多样性比较 被引量:3
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作者 史明乐 刘志恒 +6 位作者 陈毓苓 田薆楠 姚恋秋 任春梅 缪倩 于汉寿 程兆榜 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期158-166,共9页
采用四套鉴别品种对苏辽稻瘟菌进行鉴定,结果表明:257株菌被中国鉴别品种分为7群23个小种,其中苏辽菌株分别为5群12个小种、7群21个小种,江苏优势小种ZG1占其菌株数的52.92%;辽宁优势小种ZG1、ZC15占其菌株数的30.84%、19.63%。苏辽菌... 采用四套鉴别品种对苏辽稻瘟菌进行鉴定,结果表明:257株菌被中国鉴别品种分为7群23个小种,其中苏辽菌株分别为5群12个小种、7群21个小种,江苏优势小种ZG1占其菌株数的52.92%;辽宁优势小种ZG1、ZC15占其菌株数的30.84%、19.63%。苏辽菌株分别含37、46个日本小种,江苏优势小种011、011.2、000占其菌株数的25.33%、14.67%、12.67%,辽宁优势小种011.2占其菌株数的28.97%;LTH近等基因系将苏、辽菌株划分为27、23个反应型。利用Pot2-rep-PCR技术进行遗传多样性分析,在75%相似水平上可将参试菌株划分为13个系谱,江苏12个系谱中优势系谱L11、L12、L4分别占其菌株数的22.67%、16.67%、17.33%,辽宁6个系谱中优势系谱L12占其菌株数的55.14%。苏辽相比,辽宁菌株毒力普遍强于江苏,两地稻瘟菌株的毒性多样性与遗传多样性的丰富度相反。综合分析显示,苏辽两地稻瘟菌是两个在致病型和遗传结构上相近而又异质性明显的不同群体。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 江苏 辽宁 致病性 遗传多样性
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