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基于网络药理学及实验验证探讨枸杞子治疗干眼的作用机制
被引量:
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作者
穆玉雪
胡名状
+4 位作者
危冬昱
许馨月
姚李凌萱
张作明
陈涛
《国际眼科杂志》
CAS
北大核心
2023年第5期738-746,共9页
目的:基于网络药理学及实验验证探讨枸杞子治疗干眼(DE)的作用机制。方法:以“枸杞子”为关键词,通过采用TCMSP数据库与分析平台,搜索枸杞子的药物活性成分及作用靶点,以GeneCards和OMIM数据库搜索Dry eye(DE)相关的基因靶点,将枸杞子...
目的:基于网络药理学及实验验证探讨枸杞子治疗干眼(DE)的作用机制。方法:以“枸杞子”为关键词,通过采用TCMSP数据库与分析平台,搜索枸杞子的药物活性成分及作用靶点,以GeneCards和OMIM数据库搜索Dry eye(DE)相关的基因靶点,将枸杞子与DE的靶点基因导入Venn软件,可获得两者交集的靶点图,后将数据导入String数据库获得PPI蛋白与蛋白相互作用网络图,借助于Cytoscape3.7.2软件构建枸杞子活性成分-作用靶点-相关疾病的网络图;再利用Bioconductor平台及R语言GO富集分析、KEGG富集分析;通过实验验证干眼发病机制中的关键靶标。结果:通过TCMSP数据库与分析平台筛选得到枸杞子的有效化学成分45种,活性成分对应的靶点基因174个,与DE共同的靶点基因131个,根据“药物-成分-疾病-靶点”网络拓扑图,枸杞子治疗DE的主要有效成分27个。分析PPI网络,根据度值较高,即枸杞子治疗DE的关键靶点主要包括AKT1、VEGFA、CASP3、IL1B、JUN、PTGS2、CXCL8等,根据GO富集分析获得枸杞子治疗DE的166种生物学功能与过程,KEGG富集分析显示涉及31条信号通路,此外,通过实验验证发现DE模型组的结膜组织中AKT1、IL-6、TNF-α及IL-17蛋白表达量显著升高。结论:枸杞子治疗DE是多成分-多靶点-多途径的复杂过程,且枸杞子治疗DE主要通过抗炎及抑制细胞凋亡相关分子参与调控。
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关键词
枸杞子
干眼
网络药理学
AKT1
白细胞介素-6
肿瘤坏死因子-Α
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基于网络药理学及实验验证探讨枸杞子治疗干眼的作用机制
被引量:
1
1
作者
穆玉雪
胡名状
危冬昱
许馨月
姚李凌萱
张作明
陈涛
机构
空军军医大学航空航天医学系航空航天临床医学中心
中国人民解放军
空军军医大学基础医学院学员三大队
空军军医大学西京医院空勤科
出处
《国际眼科杂志》
CAS
北大核心
2023年第5期738-746,共9页
基金
全军实验动物专项课题{No.SYDW[2020]22}
陕西省重点研发计划一般项目(No.2022SF-236)。
文摘
目的:基于网络药理学及实验验证探讨枸杞子治疗干眼(DE)的作用机制。方法:以“枸杞子”为关键词,通过采用TCMSP数据库与分析平台,搜索枸杞子的药物活性成分及作用靶点,以GeneCards和OMIM数据库搜索Dry eye(DE)相关的基因靶点,将枸杞子与DE的靶点基因导入Venn软件,可获得两者交集的靶点图,后将数据导入String数据库获得PPI蛋白与蛋白相互作用网络图,借助于Cytoscape3.7.2软件构建枸杞子活性成分-作用靶点-相关疾病的网络图;再利用Bioconductor平台及R语言GO富集分析、KEGG富集分析;通过实验验证干眼发病机制中的关键靶标。结果:通过TCMSP数据库与分析平台筛选得到枸杞子的有效化学成分45种,活性成分对应的靶点基因174个,与DE共同的靶点基因131个,根据“药物-成分-疾病-靶点”网络拓扑图,枸杞子治疗DE的主要有效成分27个。分析PPI网络,根据度值较高,即枸杞子治疗DE的关键靶点主要包括AKT1、VEGFA、CASP3、IL1B、JUN、PTGS2、CXCL8等,根据GO富集分析获得枸杞子治疗DE的166种生物学功能与过程,KEGG富集分析显示涉及31条信号通路,此外,通过实验验证发现DE模型组的结膜组织中AKT1、IL-6、TNF-α及IL-17蛋白表达量显著升高。结论:枸杞子治疗DE是多成分-多靶点-多途径的复杂过程,且枸杞子治疗DE主要通过抗炎及抑制细胞凋亡相关分子参与调控。
关键词
枸杞子
干眼
网络药理学
AKT1
白细胞介素-6
肿瘤坏死因子-Α
Keywords
Fructus Lycii
dry eye
network pharmacology
AKT1
IL-6
tumor necrosis factor-α
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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1
基于网络药理学及实验验证探讨枸杞子治疗干眼的作用机制
穆玉雪
胡名状
危冬昱
许馨月
姚李凌萱
张作明
陈涛
《国际眼科杂志》
CAS
北大核心
2023
1
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