基于ERNIE-Bi-GRU-Attention的医疗实体关系抽取模型

医疗信息文本信息处理存在文本长、专业术语多、实体间关系复杂等问题,因此,提出一种基于ERNIEBi-GRU-Attention的医疗实体关系抽取模型。首先通过预训练模型ERNIE使向量获得丰富的语义信息和医疗先验知识,解决医疗专业术语问题;其次通过Bi-GRU-Attention进行语句编码,捕获有效上下文信息,有利于关系抽取;然后使用经典CRF输出实体标签;将实体标签特征和语句编码向量特征拼接进行一阶和二阶特征融合;最后通过分类器获得最终关系标签输出。通过在医疗数据集上验证,结果表明与其他模型相比,使用此模型医疗实体关系抽取的效果有所提升。

融合MacBERT和Talking⁃Heads Attention实体关系联合抽取模型

针对现有的医学文本关系抽取任务模型在训练过程中存在语义理解能力不足,可能导致关系抽取的效果不尽人意的问题,文中提出一种融合MacBERT和Talking⁃Heads Attention的实体关系联合抽取模型。该模型首先利用MacBERT语言模型来获取动态字向量表达,MacBERT作为改进的BERT模型,能够减少预训练和微调阶段之间的差异,从而提高模型的泛化能力;然后,将这些动态字向量表达输入到双向门控循环单元(BiGRU)中,以便提取文本的上下文特征。BiGRU是一种改进的循环神经网络(RNN),具有更好的长期依赖捕获能力。在获取文本上下文特征之后,使用Talking⁃Heads Attention来获取全局特征。Talking⁃Heads Attention是一种自注意力机制,可以捕获文本中不同位置之间的关系,从而提高关系抽取的准确性。实验结果表明,与实体关系联合抽取模型GRTE相比,该模型F1值提升1%,precision值提升0.4%,recall值提升1.5%。

新型冠状病毒核酸检测假阴性和假阳性案例分析

在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情暴发流行期间,新型冠状病毒变异株不断出现。面对病毒的演变及其传播特点,对阳性感染者采取“早发现”的措施是有效控制疫情传播的关键。新型冠状病毒核酸检测阳性是COVID-19确诊的首要标准,假阴性和假阳性结果都将给临床诊断和疫情防控带来一定的困扰。确保检测结果的准确性和可靠性至关重要。文章就临床实验室在新型冠状病毒核酸检测实际工作中发现的假阴性和假阳性案例进行总结和分析,为未来可能发生的相关场景的疫情防控工作提供参考。

新型冠状病毒核酸快速检测与常规PCR检测的结果比较

目的对新型冠状病毒(以下简称新冠病毒)核酸快速检测(以下简称快检)系统和常规聚合酶链反应(PCR)检测的结果进行比较分析,为临床核酸快检系统的应用及结果判断提供参考。方法参照CNAS-CL039《分子诊断检验程序性能验证指南》,对新冠病毒核酸快检和常规PCR检测两种方法的检出限进行评价;收集2022年2—8月在该实验室采用快检和常规PCR两种方法平行检测临床新冠病毒核酸样本的结果,计算符合率。结果新冠病毒核酸快检系统在检出限500 copy/mL水平时重复测定20次,N基因全部检出,ORF lab基因检出率为65%;常规PCR方法检测N基因和ORF lab基因均可达到厂家声明的检出限;快检和常规PCR两种方法检测临床新冠病毒核酸样本的阳性符合率为76.16%,阴性符合率为100.00%,总符合率为99.96%。结论新冠病毒核酸快检和常规PCR两种方法的检测结果一致性总体较好,但对弱阳性样本快检的阳性检出率低于常规PCR检测,常规PCR检测的灵敏度较快检更高。

新型冠状病毒核酸检测弱阳性质控失控分析及影响因素

新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎,COVID-19)疫情在世界范围内持续流行,引发疫情的新型冠状病毒(新冠病毒,2019-nCoV)基因组不断变异,影响病毒的生物学特性。根据《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》(试行第九版),新冠病毒核酸检测阳性为确诊的首要标准[1]。各医疗机构应当加强核酸检测的质量控制,确保检测结果准确可靠。按照《新型冠状病毒核酸检测工作手册(试行第二版)》要求[2],实验室应开展室内质控。

新型冠状病毒核酸快速检测单靶标阳性结果分析

目的 对新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸快速检测(快检)的单靶标阳性结果进行分析,为临床实验室检测和结果判读提供参考。方法 收集2021年1月1日至2022年8月16日在深圳市罗湖医院集团医学检验实验室采用快检试剂进行新冠病毒核酸检测的标本,严格按照国家相关文件要求进行标本采集、送检、保存、检测和结果判读,并采用常规PCR方法进行平行检测。对检出的快检单靶标阳性结果进行分析,并与常规检测结果进行比较。结果 38例快检单靶标阳性结果中,单靶标N基因阳性有20例,单靶标ORF1ab基因阳性18例;12例为复阳,其中单靶标N阳性10例,单靶标ORF1ab阳性2例;经常规试剂平行检测,有24例为双靶标阳性,14例为单靶标阳性。结论 新冠病毒核酸快检单靶标阳性结果应及时采用灵敏度更高的常规检测试剂进行复检,复核阳性方可报告结果,必要时需重新采样复核。