基于Nano SIMS表征荧蒽在单体微生物体内运移研究的实验数据处理方法

利用纳米二次离子技术(Nano SIMS)对荧蒽在盐单胞菌BDG-3体内的代谢过程进行观测,对选中区域中质量数为12、13、16、26的信号进行收集;并结合Image J和Python软件对所获得的数据进行分析.结果表明:菌体内12C^-与13C^-呈正相关,相关系数极强,为0.998.^16O-与^26(^12C^14N)^-呈正相关,相关系数较强,为0.813.并且,通过构建雷达图对不同元素进行综合性评价,计算了不同时间点下的假单胞菌BDG-3平均面积、平均周长、协调性Vi.结果表明在3h时,菌体的平均面积最大,达到1.39,3h后又迅速下降,6h达到最低为0.003 1,评价函数f(Si,Vi)显示加入荧蒽3h左右,盐单胞菌BDG-3生长状态最佳.本研究结合Python与Image J软件,建立了一套完整、直观的微生物Nano SIMS图像处理与评价的方法,从而为研究在微生物体内更为复杂的环境污染物质的降解代谢过程提供了全新、可靠的分析手段.

共代谢条件下荧蒽降解菌的差异蛋白质组学分析

以课题组筛选出的多环芳烃高效降解菌--蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)DQ01菌株为研究对象,以荧蒽为目标污染物,以牛肉膏蛋白胨培养基(LB培养基)为共代谢基质,基于同位素相对和绝对定量技术(iTRAQ)比较细菌在无机盐培养基(MSM培养基)和MSM-LB培养环境中降解荧蒽的全蛋白表达水平,旨在揭示蜡样芽孢杆菌在共代谢过程中分子代谢水平上的变化.结果共检测到64个差异表达蛋白质,其中上调表达的蛋白质有28个,下调表达的蛋白质36个.鉴定到差异蛋白的功能集中在代谢、应激反应、信息传递和调控等方面,同时对比KEGG通路富集分析的结果,也显示细菌有关能量代谢和信息传递、调控的通路产生的变化.比较细菌在是否处于共代谢下的差异蛋白表达,推测细菌在降解多环芳烃过程中的关键环节是小分子代谢和适应外界环境的通路.

我国与ISO土壤质量监测标准体系比较研究

本文介绍了中国国家标准《土壤环境质量 农用地土壤污染风险管控标准(试行)》 (GB15618-2018)和《土壤环境质量 建设用地土壤污染风险管控标准(试行)》 (GB36600-2018),并与国际标准化组织(ISO)土壤质量标准体系进行了比较,重点研究了土壤环境质量关注污染物项目和相应的法定土壤监测方法标准,特别是土壤化学特征监测标准。我们发现,在新型化学污染物监测,土壤物理、土壤生物、土壤水文指标监测,可提取态重金属监测,以及快速筛选监测等方面可借鉴ISO的经验,进一步完善我国土壤质量监测标准体系,以满足我国土壤调查、评价、修复、监管等需求。