高毒力碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的院内播散与分子进化

高毒力碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(Hv-CRKP)已成为全球公共卫生领域的重大挑战.该研究报告了2017年至2022年浙江一家三甲医院Hv-CRKP分离株的定植和传播情况.对来自72名患者的90个不同的CRKP菌株进行测序分析,发现院内感染Hv-CRKP的流行主要依赖于ST11-K64克隆传播.对11个代表性分离株进行了全基因组测序,得到了31个完整的质粒基因序列,其中包括12个携带KPC-2耐药基因的质粒和10个携带rmpA毒力基因的质粒.除了二元质粒外,还发现了两种可介导rmpA和KPC-2共同传播的融合质粒.研究人员通过捕获其祖先质粒,提出了该融合质粒的形成机制.此外,发现了五种rmpA启动子变异体(P9T到P13T),其活力与地理分布存在差异.通过CRISPR/Cas9基因编辑技术,证实活跃的“P11T-rmpA”调控子是“高风险”ST11-K64/CRKP克隆群的生物标志物.该研究拓展了对ST11-K64/Hv-CRKP流行性克隆的播散和临床演进的认知.