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凡纳滨对虾6个国内群体的遗传背景分析
被引量:
3
1
作者
李旭鹏
栾生
+5 位作者
曹宝祥
罗坤
谭建
孔张伟
孟宪红
孔杰
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第3期103-110,共8页
本研究选取了来自国内6个不同育苗场的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体,对8个SSR位点的基因型信息进行分析。结果显示,观察等位基因数(Na)平均值为3.67~9.33,有效等位基因数(Ne)平均值为2.20~5.67,观察杂合度(Ho)平均值为0.12~0....
本研究选取了来自国内6个不同育苗场的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体,对8个SSR位点的基因型信息进行分析。结果显示,观察等位基因数(Na)平均值为3.67~9.33,有效等位基因数(Ne)平均值为2.20~5.67,观察杂合度(Ho)平均值为0.12~0.71,期望杂合度(He)平均值为0.41~0.81,多态性信息含量(PIC)平均值为0.36~0.76。聚类分析结果显示,来自于同一个育苗场的对虾聚在一个分支。不同品牌来源的对虾分别聚在几个不同分支。6个群体间的遗传一致度为0.4229~0.8265,遗传距离为0.1905~0.8607。遗传分化系数(FST)是0.1837,群体内近交系数(FIS)是0.2514,Ho<He,研究表明,6个群体总的遗传多态性较高,但也提示品牌内不同群体间的遗传距离可能较近,近交情况可能存在。
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关键词
凡纳滨对虾
遗传多态性
遗传距离
SSR
下载PDF
职称材料
题名
凡纳滨对虾6个国内群体的遗传背景分析
被引量:
3
1
作者
李旭鹏
栾生
曹宝祥
罗坤
谭建
孔张伟
孟宪红
孔杰
机构
中国水产科学研究院黄海水产研究所
青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020年第3期103-110,共8页
基金
国家自然科学基金联合基金项目(U1706203)
泰山学者种业人才团队项目、国家自然科学基金面上项目(41676148,31572616)
+1 种基金
现代农业产业技术体系专项资金(CARS-48)
山东省农业良种工程(2017LZN011)共同资助。
文摘
本研究选取了来自国内6个不同育苗场的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体,对8个SSR位点的基因型信息进行分析。结果显示,观察等位基因数(Na)平均值为3.67~9.33,有效等位基因数(Ne)平均值为2.20~5.67,观察杂合度(Ho)平均值为0.12~0.71,期望杂合度(He)平均值为0.41~0.81,多态性信息含量(PIC)平均值为0.36~0.76。聚类分析结果显示,来自于同一个育苗场的对虾聚在一个分支。不同品牌来源的对虾分别聚在几个不同分支。6个群体间的遗传一致度为0.4229~0.8265,遗传距离为0.1905~0.8607。遗传分化系数(FST)是0.1837,群体内近交系数(FIS)是0.2514,Ho<He,研究表明,6个群体总的遗传多态性较高,但也提示品牌内不同群体间的遗传距离可能较近,近交情况可能存在。
关键词
凡纳滨对虾
遗传多态性
遗传距离
SSR
Keywords
Litopenaeus vannamei
Genetic diversity
Genetic distance
SSR
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
凡纳滨对虾6个国内群体的遗传背景分析
李旭鹏
栾生
曹宝祥
罗坤
谭建
孔张伟
孟宪红
孔杰
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2020
3
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参考文献
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