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基于网络药理学探究刺老苞治疗肌肉减少症的作用机制
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作者 孙九许 燕梦云 +3 位作者 翟晋娜 丁凌 孙雅嘉 裴凌鹏 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期980-986,共7页
目的结合液质联用和网络药理学探讨刺老苞治疗肌肉减少症可能的作用机制。方法通过液质联用鉴定刺老苞化学成分,利用TCMSP和STITCH数据库预测其潜在靶点。应用GeneCards、OMIM数据库筛选疾病相关靶点,采用Cytoscape软件构建交集靶点蛋白... 目的结合液质联用和网络药理学探讨刺老苞治疗肌肉减少症可能的作用机制。方法通过液质联用鉴定刺老苞化学成分,利用TCMSP和STITCH数据库预测其潜在靶点。应用GeneCards、OMIM数据库筛选疾病相关靶点,采用Cytoscape软件构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图,最后利用DAVID数据库进行基因功能的基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析。结果共筛选出7个活性成分,预测相关靶点185个,与疾病有关的靶点64个;根据PPI网络得到JUN、IL6、AKT1、TP53等核心靶点,根据药物-活性成分-靶点-疾病网络图得到槲皮素等核心成分;GO分析得到556个条目,涉及106条作用通路,通过分析得到HIF-1、TNF、FoxO以及PI3K-Akt等主要信号通路。结论通过液质联用和网络药理学初步预测了刺老苞治疗肌肉减少症的潜在成分和可能的作用机制,为进一步研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 刺老苞 肌肉减少症 网络药理学 活性成分 作用机制
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白术-白芍活性成分治疗肠易激综合征的网络药理学研究 被引量:3
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作者 丁凌 孙九许 +3 位作者 侯思瀚 乌恩奇 令亚琴 裴凌鹏 《化学试剂》 CAS 北大核心 2022年第2期195-202,共8页
基于网络药理学的方法预测白术-白芍中活性成分治疗肠易激综合征的作用靶点、信号通路、分子机制。检索TCMSP数据库查找白术、白芍活性成分及其作用靶点。检索OMIM、Genecard和Drugbank数据库富集疾病靶点并筛查交集靶点。采用String数... 基于网络药理学的方法预测白术-白芍中活性成分治疗肠易激综合征的作用靶点、信号通路、分子机制。检索TCMSP数据库查找白术、白芍活性成分及其作用靶点。检索OMIM、Genecard和Drugbank数据库富集疾病靶点并筛查交集靶点。采用String数据库与Cytoscape软件进行蛋白相互作用分析、靶点网络构建。通过Metascape数据库进行通路富集分析与GO功能注释。最终筛选出活性成分20个,作用靶点73个,交集靶点61个。活性成分包括3β-乙酰氧基苍术酮、β-谷甾醇、山萘酚等。作用到的核心靶点包括白细胞介素6(IL6)、蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)等。通路富集分析得到121条信号通路,包括肿瘤坏死因子信号通路、白介素17(IL17)信号通路、Toll样受体信号通路等,以晚期糖基化终产物及其胞膜受体(AGE-RAGE)信号通路最为显著。功能注释分析得到生物进程条目261个,以调节蛋白同源二聚体的活性最为显著;分子功能条目62个,以对脂多糖、细菌来源分子等成分的反应为主。白术-白芍发挥治疗肠易激综合征的作用是多成分、多靶点、多途径作用的结果。 展开更多
关键词 网络药理学 活性成分 肠易激综合征 白术 白芍 潜在靶点 信号通路
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基于网络药理学和分子对接探讨刺老苞防治骨质疏松症的作用机制 被引量:1
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作者 孙雅嘉 孙九许 +2 位作者 侯思瀚 燕梦云 裴凌鹏 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2022年第8期11-21,共11页
目的:基于网络药理学和分子对接探讨刺老苞防治骨质疏松症的作用机制。方法:通过色谱-质谱联用得到刺老苞药材的化学成分信息,然后利用Stitch数据库预测其作用的靶点。应用GeneCards等数据库获取与骨质疏松症相关的疾病靶点。通过去异... 目的:基于网络药理学和分子对接探讨刺老苞防治骨质疏松症的作用机制。方法:通过色谱-质谱联用得到刺老苞药材的化学成分信息,然后利用Stitch数据库预测其作用的靶点。应用GeneCards等数据库获取与骨质疏松症相关的疾病靶点。通过去异存同得出两者之间的交集靶点,对交集靶点进行基因本体注释(GO)及通路富集分析(KEGG),分子对接对预测出的核心靶点与关联化合物进行验证。结果:经色谱-质谱联用分析和数据库预测,获得159个活性成分及525个作用靶点,与1636个骨质疏松症相关靶点取交集得到150个交集靶点。通过PPI网络筛选出IL6、AKT1、MAPK1等10个关键靶点。GO分析显示生物功能578个,涉及基因调控、细胞增殖与凋亡、炎症反应等。KEGG分析显示通路127条,PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等可能为关键通路,乙肝、肺结核、类风湿关节炎、癌症等疾病也可能间接导致骨质疏松症。分子对接表明多数成分与关联靶点具有较好的对接能力,说明预测结果具有一定的可靠性。结论:刺老苞多种有效成分可通过促进成骨细胞的存活、增殖与分化,抑制破骨细胞的骨吸收,发挥对骨质疏松症的防治作用,PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路以及HIF-1信号通路在此过程中可能发挥重要作用,为今后分子机制的深入研究以及相应膳食补充剂的开发提供了参考。 展开更多
关键词 刺老苞 骨质疏松症 网络药理学 分子对接
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风流草黄酮对大鼠骨折愈合的作用研究
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作者 孙雅嘉 孙九许 +2 位作者 燕梦云 丁凌 裴凌鹏 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1081-1084,共4页
目的:探究风流草黄酮对胫骨骨折模型大鼠骨折愈合过程中骨质变化的影响。方法:将300只6周龄SD大鼠按照给药周期(4,7,14,21,28 d)随机分为5大组,每大组60只。再将每大组按处理方式分为对照组、模型组、风流草黄酮低剂量组(15 mg/kg)、中... 目的:探究风流草黄酮对胫骨骨折模型大鼠骨折愈合过程中骨质变化的影响。方法:将300只6周龄SD大鼠按照给药周期(4,7,14,21,28 d)随机分为5大组,每大组60只。再将每大组按处理方式分为对照组、模型组、风流草黄酮低剂量组(15 mg/kg)、中剂量组(30 mg/kg)以及高剂量组(60 mg/kg)各12只,分别于给药4、7、14、21、28 d后用Elisa法测定相应组别大鼠胫骨中碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)活性、总胶原蛋白及羟脯氨酸(hydroxyproline,Hyp)含量,放射免疫法测定骨钙素(osteocalcin,OCN)含量,电感耦合等离子体质谱法(inductively coupled plasma mass spectrometry,ICP-MS)测定骨钙、骨磷含量,并比较组间差异。结果:与对照组比较,模型组不同时间点的骨代谢相关参数均有所降低(P<0.01)。与模型组比较,风流草黄酮不同剂量组不同时间点的骨代谢相关参数均有所升高(P<0.05,P<0.01),且呈时间、剂量依赖性。结论:风流草黄酮可改善胫骨骨折大鼠的骨代谢状况,促进骨形成,有助于骨折愈合。 展开更多
关键词 风流草 黄酮 骨折愈合 骨质代谢
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刺老苞不同炮制品对成肌细胞C2C12增殖活性和成分的影响
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作者 孙九许 燕梦云 +1 位作者 翟晋娜 裴凌鹏 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1833-1838,共6页
目的:基于刺老苞不同炮制品对成肌细胞C2C12增殖活性的影响,利用UPLC-ESI-MS/MS方法探究不同炮制品存在药效差异的物质基础。方法:MTT法检测不同浓度(25、50、100、200μg/mL)刺老苞生品、清炒品、盐炙品对成肌细胞C2C12增殖的影响。采... 目的:基于刺老苞不同炮制品对成肌细胞C2C12增殖活性的影响,利用UPLC-ESI-MS/MS方法探究不同炮制品存在药效差异的物质基础。方法:MTT法检测不同浓度(25、50、100、200μg/mL)刺老苞生品、清炒品、盐炙品对成肌细胞C2C12增殖的影响。采用UPLC-ESI-MS/MS方法分析3种刺老苞炮制品的化学成分,并对其进行主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析、聚类分析等多元统计分析,初步推断不同刺老苞炮制品的成分差异。结果:MTT检测结果显示,在一定浓度范围内3种刺老苞炮制品均促进成肌细胞C2C12增殖,除了50μg/mL刺老苞生品和清炒品外,其余各浓度刺老苞生品、清炒品、盐炙品两两比较均具有显著性差异(P<0.01,P<0.05)。多元统计分析显示,3种炮制品存在药效差异可能与酚酸类、萜类、生物碱、黄酮类等成分有关。结论:该研究从药物的药效差异出发,结合代谢组学,初步阐述了刺老苞不同炮制品存在药效差异的物质基础,为民族药的进一步开发和应用奠定理论基础。 展开更多
关键词 刺老苞 炮制品 超高效液相色谱-电喷雾串联四极杆质谱 药效物质基础 代谢组学 主成分分析 正交偏最小二乘法判别分析 聚类分析
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