大豆凝集素类受体激酶家族全基因组学分析

植物凝集素类受体激酶(LecRLKs)是一种重要的类受体蛋白激酶,广泛参与植物激素信号转导、胁迫反应、植株生长发育、生物固氮等多种生理生化反应。本研究对大豆中的GmLecRLKs基因家族进行了全基因组水平上的分析,在大豆中共找到205个GmLecRLKs家族成员,分布在19条染色体上;根据其含有的特征结构域不同,这些成员被分为L型、G型和C型三个亚家族;每个亚家族成员在结构域类型上有其各自的特点;GmLecRLKs基因在进化过程中比较保守,但在个别位点氨基酸受到了正选择作用。该研究结果对于深入了解LecRLKs家族在大豆中的进化规律和生物学功能具有十分重要的意义。

豆科植物ARF基因家族的比较基因组学分析

生长素反应因子(auxin response factors,ARF)是一类重要的调控植物生长发育的转录因子,参与生长素响应基因的表达和生长素信号转导途径等多种发育过程。本研究采用比较基因组学方法对大豆、百脉根、蒺藜苜蓿的生长素反应因子(ARF)家族的理化性质、系统发育关系、结构特性、多倍化与基因家族的关联性,以及重复基因进行分析。3个物种中共鉴定出129个ARF家族基因,理化性质差异较大;系统发育分析显示全部基因被分为4个亚族,亲缘关系较近的基因表现出相似的结构和基序组成,选择压力分析发现有26个位点受到正选择;另外,大豆基因组内ARF同源基因对的数量大于其它物种,表明全基因组加倍导致产生大量的重复基因,百脉根ARF同源基因对数量少于蒺藜苜蓿,证明了加倍事件伴随着重复基因的差异性丢失。这些结果将为豆科或其它物种ARF基因的深入研究提供一定的参考依据。