生鲜乳样品及环境中微生物多样性研究

文章研究了生鲜乳样品及奶牛场环境中微生物群落结构及多样性。试验分别采集正常牛乳、乳房炎牛乳、集乳杯、榨乳间平台表面、牛乳房周围、卧床表面及粪污7种样本,采用16S扩增子测序技术对各样本的微生物群落结构及多样性进行分析。结果表明,7组样本共获得1420536条有效序列,产生28607条ASVs。乳房炎牛乳、奶厅转盘表面及奶牛乳头采样点Chao1指数、Shannon指数显著高于其他样本(P<0.05),卧床和正常牛乳Simpson指数显著低于其他样本(P<0.05);粪便、集乳杯与转盘表面样本中细菌的优势菌门是厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门,原料乳样本的优势菌门是变形菌门,且也有大量的厚壁菌门,表明牛体及不同环境取样点微生物群落多样性存在统计学差异。环境样本的共同优势菌属是肉杆菌属、UCG-005,牛乳优势菌属为罗尔斯通菌属、假单胞菌属,各采样点微生物群落结构存在一定差异,且菌群结构与丰度明显不同。