河南省猪伪狂犬病病毒gC、gE基因组的克隆与遗传变异分析

为了解近几年河南省猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)的遗传进化情况,本研究对2018-2020年采自河南省部分地区的307份病料样品进行双重PCR检测,并进行gC、gE全基因组克隆和序列分析。结果显示307份样品中有14份呈阳性,其阳性率为4.56%,且从14份阳性样品中分别克隆了gC、gE全基因组。核苷酸序列分析结果显示,gC基因之间的核苷酸同源性为99.6%~100.0%,与国内变异毒株HeN1-2012等的核苷酸同源性为99.8%~100.0%,与国外经典毒株Bartha等的核苷酸同源性为94.7%~95.8%;gE基因之间核苷酸同源性为98.7%~100%,与国内变异毒株HeN1-2012等的核苷酸同源性为98.7%~99.9%,与国外经典毒株Bartha等的核苷酸同源性为96.6%~97.7%。氨基酸序列对比结果显示,本研究测序14株PRV与国内经典毒株Ea株相比,gC基因有3处氨基酸突变(N34T、K99E、E194G),gE基因存在自6处氨基酸突变(G54D、P403A、V450I、496D(插入)、G510S、S518P);与国内变异毒株HeN1-2012相比,均没有发生氨基酸位点突变;与国外经典毒株Bartha等经典毒株相比gC全基因均存在第63位点处连续插入7个氨基酸(AAASTPA),并且存在30处氨基酸的替换,gE全基因存在23处氨基酸变异位点。氨基酸序列分析显示本研究测序14株PRV与国内变异毒株HeN1-2012处于同一分支,亲缘关系最近,且这些特征性变异位点可作为分子诊断依据,为河南省猪场PRV的净化提供了参考依据。