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河南省猪伪狂犬病病毒gC、gE基因组的克隆与遗传变异分析
被引量:
2
1
作者
孔令昊
苗信永
+7 位作者
赵士杰
李闻
徐朋丽
孙杨扬
崔志莹
夏平安
张宜娜
吴斌
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期858-864,共7页
为了解近几年河南省猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)的遗传进化情况,本研究对2018-2020年采自河南省部分地区的307份病料样品进行双重PCR检测,并进行gC、gE全基因组克隆和序列分析。结果显示307份样品中有14份呈阳性,其阳性率...
为了解近几年河南省猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)的遗传进化情况,本研究对2018-2020年采自河南省部分地区的307份病料样品进行双重PCR检测,并进行gC、gE全基因组克隆和序列分析。结果显示307份样品中有14份呈阳性,其阳性率为4.56%,且从14份阳性样品中分别克隆了gC、gE全基因组。核苷酸序列分析结果显示,gC基因之间的核苷酸同源性为99.6%~100.0%,与国内变异毒株HeN1-2012等的核苷酸同源性为99.8%~100.0%,与国外经典毒株Bartha等的核苷酸同源性为94.7%~95.8%;gE基因之间核苷酸同源性为98.7%~100%,与国内变异毒株HeN1-2012等的核苷酸同源性为98.7%~99.9%,与国外经典毒株Bartha等的核苷酸同源性为96.6%~97.7%。氨基酸序列对比结果显示,本研究测序14株PRV与国内经典毒株Ea株相比,gC基因有3处氨基酸突变(N34T、K99E、E194G),gE基因存在自6处氨基酸突变(G54D、P403A、V450I、496D(插入)、G510S、S518P);与国内变异毒株HeN1-2012相比,均没有发生氨基酸位点突变;与国外经典毒株Bartha等经典毒株相比gC全基因均存在第63位点处连续插入7个氨基酸(AAASTPA),并且存在30处氨基酸的替换,gE全基因存在23处氨基酸变异位点。氨基酸序列分析显示本研究测序14株PRV与国内变异毒株HeN1-2012处于同一分支,亲缘关系最近,且这些特征性变异位点可作为分子诊断依据,为河南省猪场PRV的净化提供了参考依据。
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关键词
猪伪狂犬病毒
序列分析
GC
gE
原文传递
题名
河南省猪伪狂犬病病毒gC、gE基因组的克隆与遗传变异分析
被引量:
2
1
作者
孔令昊
苗信永
赵士杰
李闻
徐朋丽
孙杨扬
崔志莹
夏平安
张宜娜
吴斌
机构
河南农业大学动物医学学院
华中农业大学动物医学学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期858-864,共7页
基金
“十三五”国家重点研发计划资助项目(2018YFD0500800)。
文摘
为了解近几年河南省猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)的遗传进化情况,本研究对2018-2020年采自河南省部分地区的307份病料样品进行双重PCR检测,并进行gC、gE全基因组克隆和序列分析。结果显示307份样品中有14份呈阳性,其阳性率为4.56%,且从14份阳性样品中分别克隆了gC、gE全基因组。核苷酸序列分析结果显示,gC基因之间的核苷酸同源性为99.6%~100.0%,与国内变异毒株HeN1-2012等的核苷酸同源性为99.8%~100.0%,与国外经典毒株Bartha等的核苷酸同源性为94.7%~95.8%;gE基因之间核苷酸同源性为98.7%~100%,与国内变异毒株HeN1-2012等的核苷酸同源性为98.7%~99.9%,与国外经典毒株Bartha等的核苷酸同源性为96.6%~97.7%。氨基酸序列对比结果显示,本研究测序14株PRV与国内经典毒株Ea株相比,gC基因有3处氨基酸突变(N34T、K99E、E194G),gE基因存在自6处氨基酸突变(G54D、P403A、V450I、496D(插入)、G510S、S518P);与国内变异毒株HeN1-2012相比,均没有发生氨基酸位点突变;与国外经典毒株Bartha等经典毒株相比gC全基因均存在第63位点处连续插入7个氨基酸(AAASTPA),并且存在30处氨基酸的替换,gE全基因存在23处氨基酸变异位点。氨基酸序列分析显示本研究测序14株PRV与国内变异毒株HeN1-2012处于同一分支,亲缘关系最近,且这些特征性变异位点可作为分子诊断依据,为河南省猪场PRV的净化提供了参考依据。
关键词
猪伪狂犬病毒
序列分析
GC
gE
Keywords
PRV
sequence analysis
gC
gE
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
河南省猪伪狂犬病病毒gC、gE基因组的克隆与遗传变异分析
孔令昊
苗信永
赵士杰
李闻
徐朋丽
孙杨扬
崔志莹
夏平安
张宜娜
吴斌
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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