牛基因组研究进展

本文分牛基因组遗传图谱、物理图谱、全基因组序列图与转录组研究四个部分介绍了牛基因组学研究进展。最新的牛遗传连锁图谱由4 585个标记组成,平均图距精确到1．2 cM,是研究牛数量性状位点、定位克隆生产性状相关基因进行分子辅助育种的蓝图。基于限制性酶切指纹图与末端测序技术对294 651个BAC克隆分析拼接成的物理图谱,覆盖约15．8倍基因组,为牛全基因组测序和组装提供了框架。融合了全基因组鸟枪法和逐步克隆法绘制的牛基因组草图,包含了26 052 388个可用测序读长,覆盖约7．0倍基因组,拼接成2．87 Gb的基因组序列。牛各个组织器官的cDNA文库构建和EST测序以及基因芯片方面的基因转录和表达的研究,将阐释更多的泌乳、繁殖、产肉和疾病抵御力等重要性状相关功能基因,从而将更多的基因应用到牛的分子辅助育种上。

西洋参cDNA文库构建及表达序列标签(EST)分析

为研究西洋参根的基因表达谱和挖掘其功能基因,采用表达序列标签(EST)技术首次建立了四年生西洋参根的EST文库。通过BLAST与Gene Ontology分析获得与人参皂苷生物合成相关、编码P450和糖基转移酶等的基因序列11个,与生长素调节生长发育相关、编码生长素响应因子4和生长素调节蛋白等的基因6个,与水分胁迫相关、编码蛋白dehydrin和DC2.15 like蛋白等的基因7个,与编码抗氧化酶如peroxidase和catalase相关的基因6个。另外,从西洋参根的EST文库获得抗病基因12个,分别编码转录因子WRKY家族蛋白和ribonuclease蛋白家族,62个EST是其他物种尚未报道的新基因。可见,EST技术作为功能基因组研究的重要手段可在西洋参功能基因的开发与研究中发挥重要作用,这些基因的发现为进一步克隆基因全长、研究基因功能、改良西洋参品质、阐明西洋参生长缓慢的分子机制等方面奠定了基础。

影响电转化效率的几个因素探讨

目的 :探讨大规模DNA测序技术平台中影响电转化效率的几个因素。方法 :电转化法测定经稀释或乙醇沉淀处理后连接反应混合物的转化效率。结果 :电转化电压在 2 .1～ 2 .5kV之间可获得高转化效率 ;乙醇沉淀法虽能降低盐浓度 ,但同时使微量质粒DNA丢失 ,不能提高电转化效率 ;稀释法能提高转化效率 5倍左右 ;连接反应物转化时 ,感受态细胞悬浮于无菌去离子水中的转化效率比悬浮于 10 %甘油无菌去离子水中的高。结论 :降低连接反应混合物的盐浓度能有效提高电转化效率 ,在大规模DNA测序技术平台中 。

葡萄糖酸钠发酵废弃菌丝体提取壳聚糖的研究

以产葡萄糖酸钠的废弃菌丝体为原料,探究了从废弃黑曲霉(Aspergillus niger)菌丝体提取壳聚糖的工艺条件。对废弃菌丝体进行了各组分分析后,在单因素的基础上对提取工艺进行优化,得出了碱法提取壳聚糖的最佳优化条件:料液比为1∶30(g∶mL),6%NaOH处理2 h,反应温度为95℃时,菌体蛋白去除率达到77.26%;碱(NaOH)浓度为30%,处理温度为120℃,脱蛋白处理后样品采用重复碱处理的方式脱乙酰,样品分两次重复用30%NaOH溶液在120℃下各处理1 h,得到壳聚糖的脱乙酰度为78.85%,壳聚糖得率为10.53%;后续用12%醋酸纯化处理,得到脱乙酰度为84.49%的壳聚糖,得率为9.56%。

家蚕(Bombyx mori)全基因组框架图

我们在此报告了家蚕(Bombyx mori)的基因组序列框架图,它覆盖了所有已知家蚕基因的90.9%。我们估计的基因数是18510,超过黑腹果蝇报道的13379个基因。我们将家蚕基因组与果蝇、蚊子、蜘蛛和蝴蝶等进行了比较分析,揭示了它们在基因组成上同时具有相似性和差异性。

牛基因组研究进展

本文分牛基因组遗传图谱、物理图谱、全基因组序列图与转录组研究四个部分介绍了牛基因组学研究进展。最新的牛遗传连锁图谱由4585个标记组成,平均图距精确到1.2cM,是研究牛数量性状位点。