为提高上海水牛的育种效率和遗传种质资源丰富度,采用基因测序分型(genotyping by sequencing,GBS)技术对80头上海水牛进行基因组测序,质控后获得高质量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),进行群体亲缘关系以及近...为提高上海水牛的育种效率和遗传种质资源丰富度,采用基因测序分型(genotyping by sequencing,GBS)技术对80头上海水牛进行基因组测序,质控后获得高质量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),进行群体亲缘关系以及近交系数分析。结果显示:从80头上海水牛的24条常染色体和1条性染色体上共检出的99963个高质量SNP位点、874个连续纯合片段(runs of homozygosity,ROH);80头上海水牛分为2个大支(家系),A1和A2属于第一大支(家系A),包含9头公水牛、18头母水牛;B1、B2和B3属于第二大支(家系B),包含16头公水牛、37头母水牛。基于ROH测算近交系数的结果显示:25头公水牛和55头母水牛的平均近交系数分别为0.0145和0.0114。本研究构建了上海水牛家系,揭示了上海水牛的近交状态,为上海水牛繁育工作提供了科学依据。展开更多
应用生物核磁共振技术结合主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析法(OPLS-DA)分别分析奶牛在患有临床酮病和亚临床酮病时内源性代谢产物的变化,研究酮病对奶牛代谢过程的影响,寻找差异表达的代谢物。运用1 H核磁共振(1 H NMR)技术获...应用生物核磁共振技术结合主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析法(OPLS-DA)分别分析奶牛在患有临床酮病和亚临床酮病时内源性代谢产物的变化,研究酮病对奶牛代谢过程的影响,寻找差异表达的代谢物。运用1 H核磁共振(1 H NMR)技术获得临床酮病组、亚临床酮病组与健康对照组3组奶牛血浆代谢组谱。所采集的数据经过模式分析获得差异代谢物。结果显示:临床酮病组、亚临床酮病组与健康对照组相比,差异性代谢物均为23个,其中临床酮病组6个表达上调,17个表达下调;而亚临床酮病组13个表达上调,10个表达下调。临床酮病组与亚临床酮病组相比,差异性代谢物为28个,其中4个表达上调,24个表达下调。结果表明1 H NMR谱结合模式识别分析技术能有效获得区别奶牛临床酮病和亚临床酮病的差异代谢物,并全景式地揭示了酮病发生过程中机体发生的广泛代谢紊乱,为今后深入探究酮病发生机理和新的防治策略奠定了基础。展开更多
文摘为提高上海水牛的育种效率和遗传种质资源丰富度,采用基因测序分型(genotyping by sequencing,GBS)技术对80头上海水牛进行基因组测序,质控后获得高质量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),进行群体亲缘关系以及近交系数分析。结果显示:从80头上海水牛的24条常染色体和1条性染色体上共检出的99963个高质量SNP位点、874个连续纯合片段(runs of homozygosity,ROH);80头上海水牛分为2个大支(家系),A1和A2属于第一大支(家系A),包含9头公水牛、18头母水牛;B1、B2和B3属于第二大支(家系B),包含16头公水牛、37头母水牛。基于ROH测算近交系数的结果显示:25头公水牛和55头母水牛的平均近交系数分别为0.0145和0.0114。本研究构建了上海水牛家系,揭示了上海水牛的近交状态,为上海水牛繁育工作提供了科学依据。
文摘应用生物核磁共振技术结合主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析法(OPLS-DA)分别分析奶牛在患有临床酮病和亚临床酮病时内源性代谢产物的变化,研究酮病对奶牛代谢过程的影响,寻找差异表达的代谢物。运用1 H核磁共振(1 H NMR)技术获得临床酮病组、亚临床酮病组与健康对照组3组奶牛血浆代谢组谱。所采集的数据经过模式分析获得差异代谢物。结果显示:临床酮病组、亚临床酮病组与健康对照组相比,差异性代谢物均为23个,其中临床酮病组6个表达上调,17个表达下调;而亚临床酮病组13个表达上调,10个表达下调。临床酮病组与亚临床酮病组相比,差异性代谢物为28个,其中4个表达上调,24个表达下调。结果表明1 H NMR谱结合模式识别分析技术能有效获得区别奶牛临床酮病和亚临床酮病的差异代谢物,并全景式地揭示了酮病发生过程中机体发生的广泛代谢紊乱,为今后深入探究酮病发生机理和新的防治策略奠定了基础。