铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析

多糖是药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)的主要成分之一。鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶(rhamnogalacturonⅠrhamnosyltransferase,RRT)在Ⅰ型鼠李半乳糖醛酸聚糖的合成中起重要作用。利用生物信息学在全基因组水平鉴定出4个铁皮石斛RRT家族基因(DoRRT1、DoRRT2、DoRRT3、DoRRT4),通过逆转录定量PCR检测该基因家族在不同组织和胁迫下的表达情况。结果表明:在系统发育上DoRRT1、DoRRT3被聚为一组,DoRRT2、DoRRT4被聚为一组;DoRRT蛋白均为亲水蛋白质,可定位于高尔基体;DoRRT蛋白的α-螺旋和无规卷曲较多;4个DoRRT蛋白均有O-FucT保守结构域;组织表达显示DoRRT1、DoRRT2、DoRRT4在根、茎、叶中均有表达,且在地上部的转录水平较高;胁迫表达表明DoRRT2、DoRRT4在高温胁迫下表达显著下调,DoRRT2在PEG模拟干旱条件下表达显著下调,说明DoRRT2、DoRRT4参与非生物胁迫响应。以上结果为深入研究DoRRT的生物学功能提供数据支撑。