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低温诱导稻曲病菌菌核形成的转录组学分析 被引量:3
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作者 吕楚阳 邓平川 +3 位作者 张晓丽 孙钰超 梁五生 胡东维 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第22期4571-4583,共13页
【目的】近40年来,稻曲病在世界各主要水稻栽培区均表现出发生规模不断扩大、严重程度不断增加的趋势,并逐渐发展成为水稻主要病害之一。前期对低温诱导初期的稻曲球进行切片,发现稻曲球内含有大量隐含菌核。本研究通过转录组高通量测... 【目的】近40年来,稻曲病在世界各主要水稻栽培区均表现出发生规模不断扩大、严重程度不断增加的趋势,并逐渐发展成为水稻主要病害之一。前期对低温诱导初期的稻曲球进行切片,发现稻曲球内含有大量隐含菌核。本研究通过转录组高通量测序鉴定低温诱导稻曲病菌(Villosiclava virens)菌核形成的潜在调控基因,阐释菌核形成的分子机制,为揭示稻曲病发生规律及有效防治打下基础。【方法】利用高通量测序技术,对低温诱导处理的稻曲球进行转录组测序(对照组:TL9111、TL9112、TL9113;低温处理组:FH10161、FH10162、FH10163)。以稻曲病菌基因组(UV-8b)作为参考基因组进行序列比对,利用FPKM法计算基因表达量,设定参数(|log2 fold change|≥1且q-value≤0.05)筛选差异表达基因。结合基因差异表达分析、基因家族分析和富集分析(Gene Ontology/KEGG Pathway),鉴定稻曲病菌菌核形成关键基因,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对其表达量进行验证。【结果】转录组测序共获得59.78 G高质量数据,其中,近93.2%的数据能够比对到稻曲病菌基因组。数据分析共鉴定到8 426个基因存在不同程度表达,占总体基因的97.13%。与对照相比,低温处理可诱导793个基因显著差异表达,分别有398和395个基因表现为上调、下调表达,随机挑选6个基因进行qRT-PCR验证,试验结果与转录组分析一致。在差异表达基因中,共注释到180个(22.7%)基因家族,其中61.67%的基因家族表现为上调表达,主要包括MFS转运蛋白、糖转运蛋白、锌指转录因子等。GO富集分析发现,差异表达基因显著富集于碳水化合物代谢、氧化还原过程、氧化还原酶活性等。KEGG分析发现,差异表达基因显著富集于次生代谢产物生物合成、淀粉蔗糖代谢、糖酵解/糖异生等代谢通路,暗示营养物质代谢和能量代谢途径相关基因表达对于低温诱导菌核形成至关重要。【结论】低温可诱导稻曲病菌菌核形成。低温使机体内部处于氧化应激状态,可通过信号转导途径放大,该过程由多个基因参与并调控多个基因家族成员,最终促使跨膜运输、细胞形态、生物合成等基因的上调表达,使得在形成菌核过程中蛋白表达活跃,达到合成细胞及物质的高峰期,进而促进菌核形成。 展开更多
关键词 稻曲病菌 菌核 转录组 低温胁迫 氧化应激反应 差异表达基因
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舟山市农村居家养老服务多元协同供给路径
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作者 孙钰超 《农村经济与科技》 2024年第11期225-228,共4页
人口老龄化的加剧及劳动力人口的大量迁移,使得农村地区养老问题凸显。同时,农村家庭养老模式的转变也令社会化养老成为历史的必然趋势。居家养老服务作为农村社会化养老的重要内容,其供给模式成为研究的重要方向。目前舟山市虽然采取... 人口老龄化的加剧及劳动力人口的大量迁移,使得农村地区养老问题凸显。同时,农村家庭养老模式的转变也令社会化养老成为历史的必然趋势。居家养老服务作为农村社会化养老的重要内容,其供给模式成为研究的重要方向。目前舟山市虽然采取了一系列的居家养老服务促进措施,但依然存在养老资源分配不均,服务体系不完善、养老服务监管缺失的情况。为提升舟山市农村居家养老服务的品质,应以信息化为依托,构建一个供需平衡、多元协同的居家养老服务供给路径。 展开更多
关键词 居家养老 多元协同 供给路径 舟山市
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稻曲病菌有性生殖中光诱导基因的转录组分析 被引量:1
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作者 孙钰超 邓平川 +1 位作者 邓启得 胡东维 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期899-912,共14页
稻曲病菌(Villosiclava virens)能够以菌核的形式安全越冬并在来年萌发产生子囊孢子,成为稻曲病菌的重要初侵染源;而菌核产生子实体的过程需要光的诱导。为了探索光诱导的分子机制,本文对不同光照处理条件下稻曲病菌菌核萌发过程的转录... 稻曲病菌(Villosiclava virens)能够以菌核的形式安全越冬并在来年萌发产生子囊孢子,成为稻曲病菌的重要初侵染源;而菌核产生子实体的过程需要光的诱导。为了探索光诱导的分子机制,本文对不同光照处理条件下稻曲病菌菌核萌发过程的转录组学进行了比较分析。结果发现,与黑暗条件下菌核的萌发相比,光照处理后542个基因显著差异表达,其中上调359个,下调183个。GO富集分析发现,DEGs显著富集于糖基水解酶活性、细胞壁生物合成、氧化还原酶活性等。KEGG分析发现,DEGs显著富集于脂质代谢、氨基酸代谢、次生代谢产物合成等代谢通路。DEGs中子实体独有基因组氨酸激酶为光感受器,其响应光信号引起下游基因的表达,同时,与有性生殖过程相关的水通道蛋白和甲基转移酶蛋白编码基因表达活跃,共同调控了菌核萌发产生子实体过程。 展开更多
关键词 稻曲病菌 菌核 转录组 光照 有性生殖 差异表达基因
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博物主题背景下的儿童户外游戏创设
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作者 孙钰超 《作家天地》 2020年第22期195-196,共2页
随着《幼儿园教育指导纲要》的颁布与实施,许多幼儿园都加入了博物主题课程的研究和探索,而我们园所遵循了赫尔巴特提出的集中和相关的原则,围绕一个主题进行深挖和拓展,以妙思、妙探、妙寻、妙享、妙品五步流程为课程实施过程。鼓励幼... 随着《幼儿园教育指导纲要》的颁布与实施,许多幼儿园都加入了博物主题课程的研究和探索,而我们园所遵循了赫尔巴特提出的集中和相关的原则,围绕一个主题进行深挖和拓展,以妙思、妙探、妙寻、妙享、妙品五步流程为课程实施过程。鼓励幼儿大胆的猜测与质疑,在求证中主动建构对于这个世界的认知,它渗透于幼儿教育的各个领域和一日生活中,是幼儿自主学习和创造分享的奇妙探索之旅。 展开更多
关键词 博物课程 户外活动 游戏创设 幼儿教育
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