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胃腺癌的关键基因及通路的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
孙铭博
陈水兵
《浙江医学》
CAS
2022年第20期2165-2172,共8页
目的通过生物信息学方法探索胃腺癌的关键基因及相关通路并进行初步验证,为确定胃腺癌相关的新型生物标志物提供候选基因。方法分析GSE103236、GSE79973和GSE54129数据集以获得差异表达基因,进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组...
目的通过生物信息学方法探索胃腺癌的关键基因及相关通路并进行初步验证,为确定胃腺癌相关的新型生物标志物提供候选基因。方法分析GSE103236、GSE79973和GSE54129数据集以获得差异表达基因,进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过基因集富集分析(GSEA)GSE118916数据集以验证生物学过程。使用癌症基因组图谱(TCGA)胃腺癌数据库分析这些关键基因与预后的关联。通过在MKN45胃腺癌细胞系中加入5-氟脲嘧啶(5-Fu)以探索上述关键基因在化疗后的变化。结果从GSE103236、GSE79973和GSE54129分别鉴定出289、576和763个差异表达基因,其共有的差异表达基因有205个。这些差异基因主要富集在消化过程和细胞外基质形成等生物学过程和细胞色素P450对异生物质的代谢和药物代谢-细胞色素P450等通路上。通过Cytoscape的CytoHubba插件获得了9个关键基因,分别是Ⅰ型胶原α1亚基(COL1A1)、Ⅱ型胶原α1亚基(COL1A2)、Ⅳ型胶原α1亚基(COL4A1)、Ⅵ型胶原α3亚基(COL6A3)、血小板反应蛋白1(THBS1)、血小板反应蛋白2(THBS2)、双糖链蛋白多糖(BGN)、纤维连接蛋白1(FN1)和半胱氨酸的分泌性酸性蛋白(SPARC)。GSEA分析GSE118916数据集,发现与胃腺癌相关的主要富集通路是细胞外基质-受体相互作用通路和药物代谢-细胞色素P450通路等通路,与KEGG分析的结果基本一致。且COL1A1、COL4A1、THBS1、FN1和SPARC与预后显著相关。在MKN45细胞系中加入5-FU后,COL1A1、COL4A1、THBS1、FN1和SPARC mRNA表达水平均降低,与前述结果一致。结论本研究筛选出COL1A1、COL4A1、THBS1、FN1和SPARC等关键基因,这些关键基因有望成为胃腺癌发生与发展的新型预后生物标志物。
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关键词
胃腺癌
关键基因
生物信息学
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职称材料
基于MATLAB的颜色识别系统在油田联合站中的应用
被引量:
1
2
作者
孙利军
孙铭博
盛哲
《油气田地面工程》
2022年第7期104-108,共5页
油田联合站的主要作用是将油井采出含水原油进行脱水处理,得到合格含水指标的原油进行外输,脱水后的含油污水经过过滤工艺处理得到合格的污水进行外注。脱水后的原油含水指标、过滤后的污水水质指标都需要取样后到化验室使用化验仪器才...
油田联合站的主要作用是将油井采出含水原油进行脱水处理,得到合格含水指标的原油进行外输,脱水后的含油污水经过过滤工艺处理得到合格的污水进行外注。脱水后的原油含水指标、过滤后的污水水质指标都需要取样后到化验室使用化验仪器才能获取。现基于MATLAB(矩阵实验室)软件设计了一套颜色识别系统,利用电脑对原油、污水进行颜色识别并与数据库比对就可得到所需指标。该系统未来有望移植到手机等移动设备上,以实现现场取样快速获取原油含水、外注污水含油指标结果。
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关键词
颜色识别系统
MATLAB软件
原油含水处理
外输污水
化验
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职称材料
硬膜外镇痛泵与静脉镇痛泵在子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时镇痛效果和安全性的对比研究
被引量:
1
3
作者
陈水兵
孙铭博
+2 位作者
黄璜
姚红响
金诗湘
《中国基层医药》
CAS
2023年第3期388-392,共5页
目的比较硬膜外镇痛泵与静脉镇痛泵在子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时的镇痛效果及安全性。方法选取温州医科大学附属第二医院育英儿童医院2019年1月至2021年12月收治的行子宫动脉栓塞术的子宫肌瘤患者50例作为观察对象,采用随机数字表法分...
目的比较硬膜外镇痛泵与静脉镇痛泵在子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时的镇痛效果及安全性。方法选取温州医科大学附属第二医院育英儿童医院2019年1月至2021年12月收治的行子宫动脉栓塞术的子宫肌瘤患者50例作为观察对象,采用随机数字表法分为观察组和对照组各25例。观察组使用硬膜外镇痛泵镇痛,对照组使用静脉镇痛泵镇痛。在术后1 h、6 h、12 h、24 h,采用疼痛视觉模拟(visual analogue scale,VAS)评分比较两组疼痛程度,采用舒适评分量表(bruggrmann comfort scale,BCS)评分比较两组舒适程度,并比较两组患者手术前后的呼吸、心率、血压及术后不良反应发生情况。结果术后1 h,观察组VAS评分[3.00(2.00,5.50)]低于对照组[7.00(6.00,8.00)](Z=-3.84,P<0.05);术后6 h、12 h、24 h,两组VAS评分差异均无统计学意义(均P>0.05)。术后24 h内,观察组使用的阿片类镇痛药物[16.00%(4/25)]少于对照组[88.00%(22/25)](χ^(2)=25.96,P<0.001)。术后1 h,观察组BCS评分[0.00(0.00,0.50)]高于对照组[0.00(0.00,0.00)](Z=2.08,P<0.05);术后6 h、12 h、24 h,两组BCS评分差异均无统计学意义(均P>0.05)。两组术后心率均较术前明显下降(均P<0.05)。两组手术前后的呼吸频率、平均动脉压差异均无统计学意义(均P>0.05)。两组术后恶心呕吐、发热的发生率差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时使用硬膜外镇痛泵比静脉镇痛泵具有更好的镇痛效果、舒适程度及安全性,值得临床推广。
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关键词
镇痛
硬膜外
输注泵
平滑肌瘤
子宫动脉栓塞术
镇痛药
阿片类
疼痛
手术后
手术后并发症
患者舒适度
原文传递
题名
胃腺癌的关键基因及通路的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
孙铭博
陈水兵
机构
温州医科大学附属第二医院、育英儿童医院介入医学科
出处
《浙江医学》
CAS
2022年第20期2165-2172,共8页
文摘
目的通过生物信息学方法探索胃腺癌的关键基因及相关通路并进行初步验证,为确定胃腺癌相关的新型生物标志物提供候选基因。方法分析GSE103236、GSE79973和GSE54129数据集以获得差异表达基因,进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过基因集富集分析(GSEA)GSE118916数据集以验证生物学过程。使用癌症基因组图谱(TCGA)胃腺癌数据库分析这些关键基因与预后的关联。通过在MKN45胃腺癌细胞系中加入5-氟脲嘧啶(5-Fu)以探索上述关键基因在化疗后的变化。结果从GSE103236、GSE79973和GSE54129分别鉴定出289、576和763个差异表达基因,其共有的差异表达基因有205个。这些差异基因主要富集在消化过程和细胞外基质形成等生物学过程和细胞色素P450对异生物质的代谢和药物代谢-细胞色素P450等通路上。通过Cytoscape的CytoHubba插件获得了9个关键基因,分别是Ⅰ型胶原α1亚基(COL1A1)、Ⅱ型胶原α1亚基(COL1A2)、Ⅳ型胶原α1亚基(COL4A1)、Ⅵ型胶原α3亚基(COL6A3)、血小板反应蛋白1(THBS1)、血小板反应蛋白2(THBS2)、双糖链蛋白多糖(BGN)、纤维连接蛋白1(FN1)和半胱氨酸的分泌性酸性蛋白(SPARC)。GSEA分析GSE118916数据集,发现与胃腺癌相关的主要富集通路是细胞外基质-受体相互作用通路和药物代谢-细胞色素P450通路等通路,与KEGG分析的结果基本一致。且COL1A1、COL4A1、THBS1、FN1和SPARC与预后显著相关。在MKN45细胞系中加入5-FU后,COL1A1、COL4A1、THBS1、FN1和SPARC mRNA表达水平均降低,与前述结果一致。结论本研究筛选出COL1A1、COL4A1、THBS1、FN1和SPARC等关键基因,这些关键基因有望成为胃腺癌发生与发展的新型预后生物标志物。
关键词
胃腺癌
关键基因
生物信息学
Keywords
Gastric adenocarcinoma
Key genes
Bioinformatics
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
基于MATLAB的颜色识别系统在油田联合站中的应用
被引量:
1
2
作者
孙利军
孙铭博
盛哲
机构
大庆油田有限责任公司第三采油厂
青岛鼎信通讯股份有限公司
长庆油田分公司技术监测中心
出处
《油气田地面工程》
2022年第7期104-108,共5页
文摘
油田联合站的主要作用是将油井采出含水原油进行脱水处理,得到合格含水指标的原油进行外输,脱水后的含油污水经过过滤工艺处理得到合格的污水进行外注。脱水后的原油含水指标、过滤后的污水水质指标都需要取样后到化验室使用化验仪器才能获取。现基于MATLAB(矩阵实验室)软件设计了一套颜色识别系统,利用电脑对原油、污水进行颜色识别并与数据库比对就可得到所需指标。该系统未来有望移植到手机等移动设备上,以实现现场取样快速获取原油含水、外注污水含油指标结果。
关键词
颜色识别系统
MATLAB软件
原油含水处理
外输污水
化验
Keywords
color recognition system
Matlab software
crude oil bearing water
external sewage test
分类号
TE624.1 [石油与天然气工程—油气加工工程]
TB115 [理学—应用数学]
下载PDF
职称材料
题名
硬膜外镇痛泵与静脉镇痛泵在子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时镇痛效果和安全性的对比研究
被引量:
1
3
作者
陈水兵
孙铭博
黄璜
姚红响
金诗湘
机构
温州医科大学附属第二医院育英儿童医院介入科
温州医科大学附属第二医院育英儿童医院麻醉科
出处
《中国基层医药》
CAS
2023年第3期388-392,共5页
基金
浙江省温州市科技局基础性科研项目(Y20180768)。
文摘
目的比较硬膜外镇痛泵与静脉镇痛泵在子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时的镇痛效果及安全性。方法选取温州医科大学附属第二医院育英儿童医院2019年1月至2021年12月收治的行子宫动脉栓塞术的子宫肌瘤患者50例作为观察对象,采用随机数字表法分为观察组和对照组各25例。观察组使用硬膜外镇痛泵镇痛,对照组使用静脉镇痛泵镇痛。在术后1 h、6 h、12 h、24 h,采用疼痛视觉模拟(visual analogue scale,VAS)评分比较两组疼痛程度,采用舒适评分量表(bruggrmann comfort scale,BCS)评分比较两组舒适程度,并比较两组患者手术前后的呼吸、心率、血压及术后不良反应发生情况。结果术后1 h,观察组VAS评分[3.00(2.00,5.50)]低于对照组[7.00(6.00,8.00)](Z=-3.84,P<0.05);术后6 h、12 h、24 h,两组VAS评分差异均无统计学意义(均P>0.05)。术后24 h内,观察组使用的阿片类镇痛药物[16.00%(4/25)]少于对照组[88.00%(22/25)](χ^(2)=25.96,P<0.001)。术后1 h,观察组BCS评分[0.00(0.00,0.50)]高于对照组[0.00(0.00,0.00)](Z=2.08,P<0.05);术后6 h、12 h、24 h,两组BCS评分差异均无统计学意义(均P>0.05)。两组术后心率均较术前明显下降(均P<0.05)。两组手术前后的呼吸频率、平均动脉压差异均无统计学意义(均P>0.05)。两组术后恶心呕吐、发热的发生率差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时使用硬膜外镇痛泵比静脉镇痛泵具有更好的镇痛效果、舒适程度及安全性,值得临床推广。
关键词
镇痛
硬膜外
输注泵
平滑肌瘤
子宫动脉栓塞术
镇痛药
阿片类
疼痛
手术后
手术后并发症
患者舒适度
Keywords
Analgesia,epidural
Infusion pumps
Smooth muscle tumours
Uterine artery embolisation
Analgesics,opioids
Pain,post-operative
Post-operative complications
Patient comfort
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
R614 [医药卫生—麻醉学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胃腺癌的关键基因及通路的生物信息学分析
孙铭博
陈水兵
《浙江医学》
CAS
2022
1
下载PDF
职称材料
2
基于MATLAB的颜色识别系统在油田联合站中的应用
孙利军
孙铭博
盛哲
《油气田地面工程》
2022
1
下载PDF
职称材料
3
硬膜外镇痛泵与静脉镇痛泵在子宫动脉栓塞治疗子宫肌瘤时镇痛效果和安全性的对比研究
陈水兵
孙铭博
黄璜
姚红响
金诗湘
《中国基层医药》
CAS
2023
1
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