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栖牙普雷沃菌的代糖产酸与致龋关系研究
1
作者
司远
孙雁斐
+3 位作者
宋雪娇
万俊丽
李敏
杨芳
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期753-758,共6页
目的:探究栖牙普雷沃菌的代糖产酸与牙本质脱矿及龋病形成的潜在关系。方法:观察栖牙普雷沃菌的形态学特征;在无糖或有糖以及不同pH的培养条件下,紫外分光光度计和pH计检测栖牙普雷沃菌的生长特性,高效液相色谱法(HPLC)检测栖牙普雷沃...
目的:探究栖牙普雷沃菌的代糖产酸与牙本质脱矿及龋病形成的潜在关系。方法:观察栖牙普雷沃菌的形态学特征;在无糖或有糖以及不同pH的培养条件下,紫外分光光度计和pH计检测栖牙普雷沃菌的生长特性,高效液相色谱法(HPLC)检测栖牙普雷沃菌上清液的有机酸含量;将牙本质切片分为对照组、磷酸组和栖牙普雷沃菌组,分别在相应分组培养基中培养1周和2周,SEM,VHM检测各组共培养牙本质的脱矿程度。结果:栖牙普雷沃菌能够发酵蔗糖、葡萄糖产酸,使其最终pH值低至4.7,琥珀酸和乙酸是其主要代谢产物。栖牙普雷沃菌具有一定的耐酸性。此外,栖牙普雷沃菌能够导致牙本质脱矿,与对照组相比,栖牙普雷沃菌组牙本质的维氏硬度值显著降低(P<0.05)。结论:栖牙普雷沃菌的致龋能力可能与其代糖产酸有关。
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关键词
龋病
栖牙普雷沃菌
糖代谢
产酸
脱矿
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职称材料
基于微生物组新颖指数构建龋病菌群诊断模型
2
作者
孙雁斐
卢洁
+6 位作者
杨加震
刘育含
刘璐
曾飞
牛玉芬
董磊
杨芳
《华西口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期208-217,共10页
目的探讨基于口腔菌群16S核糖体RNA(rRNA)数据的龋病菌群分析与诊断模型的构建及优化。方法检索NCBI、MG-RAST、EMBL-EBI、QIITA等微生物组公开数据库,收集全球范围内人类口腔微生物组的相关研究中所涉及的微生物组数据。通过口腔微生...
目的探讨基于口腔菌群16S核糖体RNA(rRNA)数据的龋病菌群分析与诊断模型的构建及优化。方法检索NCBI、MG-RAST、EMBL-EBI、QIITA等微生物组公开数据库,收集全球范围内人类口腔微生物组的相关研究中所涉及的微生物组数据。通过口腔微生物组搜索引擎(MSE)将龋病测试数据集中的样本(1703例)与健康样本(20540例)进行比对,得到微生物组新颖指数(MNS)并基于该指数构建龋病诊断模型。最后使用非参数多元方差分析比较不同宿主因素对口腔菌群MNS的影响大小,通过控制相关因素优化模型,并利用受试者工作特征(ROC)曲线评价模型效果。结果1)相比于健康样本,龋病样本的微生物多样性降低且菌群结构变异增大;2)ROC曲线对龋病测试数据集进行评估,计算ROC曲线下面积(AUC)为0.67;3)分析表明龋病状态、国家、年龄、龋失补指数(DMFT)及取样位点这5类宿主因素对微生物组MNS有显著影响(P=0.001);4)控制相关宿主因素后的优化诊断模型在中国儿童高龋、中龋、低龋以及混合牙菌斑样本数据集AUC达到0.87、0.74、0.74和0.75。结论基于口腔菌群龋病数据分析构建的龋病诊断模型具有良好的诊断效能。
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关键词
口腔菌群
大数据
龋病
高通量测序
微生物组
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职称材料
基于单细胞拉曼技术的口腔病原微生物快速鉴别研究
被引量:
1
3
作者
李姗姗
孙雁斐
+1 位作者
郭艺
杨芳
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期794-799,共6页
目的:评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法:(1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森...
目的:评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法:(1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森林分析方法分析光谱。结果:(1)3个菌株的对数期和稳定期均可被拉曼技术快速区分。准确率分别为:99.6%、99.86%、99.60%;(2)单细胞拉曼技术能够快速精确区分稳定期的3种实验菌株,准确率高达99.68%;(3)通过随机森林算法分析得到3种稳定期实验菌株之间的拉曼差异峰分别为:1126~1128 cm^(-1)、736~744 cm^(-1)、1330~1440 cm^(-1)、778~785 cm^(-1)、1001~1003 cm^(-1)和1431~1481 cm^(-1)。其生物学标志分别为:蛋白质、胸腺嘧啶、脂质、胞嘧啶、尿嘧啶、苯丙氨酸、蛋白质。结论:单细胞拉曼光谱可高效区分物种的生长时期和菌株类别。
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关键词
单细胞拉曼
口腔病原微生物
鉴定
随机森林
主成分分析
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职称材料
基于重水拉曼技术评价口腔抑菌剂对粪肠球菌抑菌效能的研究
4
作者
刘育含
马玉莹
+6 位作者
张利娟
李修珍
杨加震
牛玉芬
孙雁斐
曾飞
杨芳
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期989-993,共5页
目的:开发有效且对患者副作用小的口腔抑菌剂配方,系统评价过氧化氢(hydrogen peroxide,H_(2)O_(2))、次氯酸钠(Sodium hypochlorite,NaClO)对粪肠球菌(Enterococcus faecalis ATCC29212)的抑菌效能。方法:分别采用肉汤稀释法和重水拉...
目的:开发有效且对患者副作用小的口腔抑菌剂配方,系统评价过氧化氢(hydrogen peroxide,H_(2)O_(2))、次氯酸钠(Sodium hypochlorite,NaClO)对粪肠球菌(Enterococcus faecalis ATCC29212)的抑菌效能。方法:分别采用肉汤稀释法和重水拉曼技术(D_(2)O-labeled single-cell Raman micro-spectroscopy),通过最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)和最低抑制代谢浓度(minimum inhibitory concentration based on metabolic activity,MIC-MA)定量评价了抑菌剂对粪肠球菌的生长和代谢抑制作用。结果:对于过氧化氢和次氯酸钠,MIC分别为110 mg/L和0.45 g/L,尽管生长完全停止,但细菌细胞的代谢活性在8 h平均降低了71%、70%,显示出一种“非生长但代谢活跃”(NGMA)的状态,这种状态可能导致潜在的难治性反复感染。而MIC-MA分别为220 mg/L和0.9 g/L时,所有细胞的代谢活动在暴露8 h后完全停止。此外,NaClO+H_(2)O_(2)的组合使用优于单独使用次氯酸钠、过氧化氢。结论:MIC-MA有利于严格评估抗细菌疗效,NaClO+H_(2)O_(2)可作为细菌病原体更有效的抑菌剂方案。
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关键词
拉曼显微光谱
重水
粪肠球菌
单细胞技术
临床抑菌剂
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职称材料
题名
栖牙普雷沃菌的代糖产酸与致龋关系研究
1
作者
司远
孙雁斐
宋雪娇
万俊丽
李敏
杨芳
机构
青岛大学口腔医学院
青岛市市立医院
山东第二医科大学口腔医学院
大连医科大学口腔医学院
出处
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期753-758,共6页
基金
国家自然科学基金(编号:81670979)。
文摘
目的:探究栖牙普雷沃菌的代糖产酸与牙本质脱矿及龋病形成的潜在关系。方法:观察栖牙普雷沃菌的形态学特征;在无糖或有糖以及不同pH的培养条件下,紫外分光光度计和pH计检测栖牙普雷沃菌的生长特性,高效液相色谱法(HPLC)检测栖牙普雷沃菌上清液的有机酸含量;将牙本质切片分为对照组、磷酸组和栖牙普雷沃菌组,分别在相应分组培养基中培养1周和2周,SEM,VHM检测各组共培养牙本质的脱矿程度。结果:栖牙普雷沃菌能够发酵蔗糖、葡萄糖产酸,使其最终pH值低至4.7,琥珀酸和乙酸是其主要代谢产物。栖牙普雷沃菌具有一定的耐酸性。此外,栖牙普雷沃菌能够导致牙本质脱矿,与对照组相比,栖牙普雷沃菌组牙本质的维氏硬度值显著降低(P<0.05)。结论:栖牙普雷沃菌的致龋能力可能与其代糖产酸有关。
关键词
龋病
栖牙普雷沃菌
糖代谢
产酸
脱矿
Keywords
Dental caries
Prevotella denticola
Sugar metabolism
Acid production
Demineralization
分类号
R780.2 [医药卫生—口腔医学]
下载PDF
职称材料
题名
基于微生物组新颖指数构建龋病菌群诊断模型
2
作者
孙雁斐
卢洁
杨加震
刘育含
刘璐
曾飞
牛玉芬
董磊
杨芳
机构
青岛大学口腔医学院
青岛市市立医院口腔医学中心儿童口腔科
浦江口腔医院口腔内科
青岛市口腔医院儿童口腔科
青岛市口腔医院中心实验室
中国科学院青岛生物能源与过程研究所
济宁医学院附属医院口腔内科
大连医科大学口腔医学院
出处
《华西口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期208-217,共10页
基金
国家自然科学基金(81670979,31300424)。
文摘
目的探讨基于口腔菌群16S核糖体RNA(rRNA)数据的龋病菌群分析与诊断模型的构建及优化。方法检索NCBI、MG-RAST、EMBL-EBI、QIITA等微生物组公开数据库,收集全球范围内人类口腔微生物组的相关研究中所涉及的微生物组数据。通过口腔微生物组搜索引擎(MSE)将龋病测试数据集中的样本(1703例)与健康样本(20540例)进行比对,得到微生物组新颖指数(MNS)并基于该指数构建龋病诊断模型。最后使用非参数多元方差分析比较不同宿主因素对口腔菌群MNS的影响大小,通过控制相关因素优化模型,并利用受试者工作特征(ROC)曲线评价模型效果。结果1)相比于健康样本,龋病样本的微生物多样性降低且菌群结构变异增大;2)ROC曲线对龋病测试数据集进行评估,计算ROC曲线下面积(AUC)为0.67;3)分析表明龋病状态、国家、年龄、龋失补指数(DMFT)及取样位点这5类宿主因素对微生物组MNS有显著影响(P=0.001);4)控制相关宿主因素后的优化诊断模型在中国儿童高龋、中龋、低龋以及混合牙菌斑样本数据集AUC达到0.87、0.74、0.74和0.75。结论基于口腔菌群龋病数据分析构建的龋病诊断模型具有良好的诊断效能。
关键词
口腔菌群
大数据
龋病
高通量测序
微生物组
Keywords
oral microbiome
big-data
caries
high-throughput sequencing
microbiome
分类号
R781.1 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
基于单细胞拉曼技术的口腔病原微生物快速鉴别研究
被引量:
1
3
作者
李姗姗
孙雁斐
郭艺
杨芳
机构
青岛大学口腔医学院
同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室
青岛市市立医院口腔医学中心
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第9期794-799,共6页
文摘
目的:评价单细胞拉曼技术对3种口腔病原微生物的快速分类效能。方法:(1)培养变异链球菌UA159、白色念珠菌ATCC10231和粪肠球菌ATCC29212至稳定期,绘制生长曲线评估生长状态;(2)测量对数和稳定期菌株单细胞拉曼图谱,使用主成分和随机森林分析方法分析光谱。结果:(1)3个菌株的对数期和稳定期均可被拉曼技术快速区分。准确率分别为:99.6%、99.86%、99.60%;(2)单细胞拉曼技术能够快速精确区分稳定期的3种实验菌株,准确率高达99.68%;(3)通过随机森林算法分析得到3种稳定期实验菌株之间的拉曼差异峰分别为:1126~1128 cm^(-1)、736~744 cm^(-1)、1330~1440 cm^(-1)、778~785 cm^(-1)、1001~1003 cm^(-1)和1431~1481 cm^(-1)。其生物学标志分别为:蛋白质、胸腺嘧啶、脂质、胞嘧啶、尿嘧啶、苯丙氨酸、蛋白质。结论:单细胞拉曼光谱可高效区分物种的生长时期和菌株类别。
关键词
单细胞拉曼
口腔病原微生物
鉴定
随机森林
主成分分析
Keywords
single-cell raman spectroscopy
oral pathogens microorganism
identification
random forest
PCA
分类号
O65 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
基于重水拉曼技术评价口腔抑菌剂对粪肠球菌抑菌效能的研究
4
作者
刘育含
马玉莹
张利娟
李修珍
杨加震
牛玉芬
孙雁斐
曾飞
杨芳
机构
青岛大学口腔医学院
青岛市市立医院口腔医学中心
临沂市妇幼保健院口腔科
大连医科大学口腔医学院
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期989-993,共5页
基金
国家自然科学基金(编号:81670979,31300424)。
文摘
目的:开发有效且对患者副作用小的口腔抑菌剂配方,系统评价过氧化氢(hydrogen peroxide,H_(2)O_(2))、次氯酸钠(Sodium hypochlorite,NaClO)对粪肠球菌(Enterococcus faecalis ATCC29212)的抑菌效能。方法:分别采用肉汤稀释法和重水拉曼技术(D_(2)O-labeled single-cell Raman micro-spectroscopy),通过最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)和最低抑制代谢浓度(minimum inhibitory concentration based on metabolic activity,MIC-MA)定量评价了抑菌剂对粪肠球菌的生长和代谢抑制作用。结果:对于过氧化氢和次氯酸钠,MIC分别为110 mg/L和0.45 g/L,尽管生长完全停止,但细菌细胞的代谢活性在8 h平均降低了71%、70%,显示出一种“非生长但代谢活跃”(NGMA)的状态,这种状态可能导致潜在的难治性反复感染。而MIC-MA分别为220 mg/L和0.9 g/L时,所有细胞的代谢活动在暴露8 h后完全停止。此外,NaClO+H_(2)O_(2)的组合使用优于单独使用次氯酸钠、过氧化氢。结论:MIC-MA有利于严格评估抗细菌疗效,NaClO+H_(2)O_(2)可作为细菌病原体更有效的抑菌剂方案。
关键词
拉曼显微光谱
重水
粪肠球菌
单细胞技术
临床抑菌剂
Keywords
raman micro-spectroscopy
heavy water
Enterococcus faecalis
single-cell technology
clinical disinfectants
分类号
TS2 [轻工技术与工程—食品科学与工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
栖牙普雷沃菌的代糖产酸与致龋关系研究
司远
孙雁斐
宋雪娇
万俊丽
李敏
杨芳
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
基于微生物组新颖指数构建龋病菌群诊断模型
孙雁斐
卢洁
杨加震
刘育含
刘璐
曾飞
牛玉芬
董磊
杨芳
《华西口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
3
基于单细胞拉曼技术的口腔病原微生物快速鉴别研究
李姗姗
孙雁斐
郭艺
杨芳
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
下载PDF
职称材料
4
基于重水拉曼技术评价口腔抑菌剂对粪肠球菌抑菌效能的研究
刘育含
马玉莹
张利娟
李修珍
杨加震
牛玉芬
孙雁斐
曾飞
杨芳
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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