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菊花rbcL基因电子克隆及生物信息学、适应性进化分析
被引量:
5
1
作者
丁帅
熊勇
+4 位作者
李正涛
王忠诚
孟亚媛
李乐
肖焱波
《种子》
北大核心
2015年第10期24-30,共7页
目的:利用电子克隆技术获得菊花叶绿体中编码核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶大亚基rbcL基因,并对该电子克隆的菊花rbcL基因序列、编码氨基酸的特性及适应性进化进行分析。方法:根据相关文献,利用电子克隆方法克隆出菊花rbcL完整基因序列,...
目的:利用电子克隆技术获得菊花叶绿体中编码核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶大亚基rbcL基因,并对该电子克隆的菊花rbcL基因序列、编码氨基酸的特性及适应性进化进行分析。方法:根据相关文献,利用电子克隆方法克隆出菊花rbcL完整基因序列,对其进行生物信息学分析、结构建模和评价。结果:通过电子克隆获得菊花rbcL基因完整的开放阅读框序列,该系列长1 452bp,编码氨基酸483个。在预测电子克隆菊花rbcL基因编码蛋白的二级结构中,主要有α螺旋19个,β折叠18个。通过适应性进化分析找到7个氨基酸正选择位点(228S,255V,279T,309M,328S,439T,449T)。结论:电子克隆获得菊花rbcL基因的完整序列为以后实验研究提供一定的参考数据,对所编码的蛋白质适应性研究有利于探究对菊科植物适应环境的机制。
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关键词
菊花
RBCL基因
电子克隆
生物信息学
适用性进化分析
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职称材料
滇池表层沉积物氮污染特征及其潜在矿化能力
被引量:
25
2
作者
孟亚媛
王圣瑞
+6 位作者
焦立新
刘文斌
肖焱波
祖维美
徐天敏
丁帅
周童
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期471-480,共10页
利用滇池53个表层沉积物样品,研究了其不同形态氮含量及空间分布特征,探讨了滇池沉积物氮潜在矿化能力及其污染特征,以期揭示滇池沉积物氮污染影响因素及沉积物氮释放风险.结果表明:1滇池全湖表层沉积物总氮(TN)平均含量为3 515.60 mg...
利用滇池53个表层沉积物样品,研究了其不同形态氮含量及空间分布特征,探讨了滇池沉积物氮潜在矿化能力及其污染特征,以期揭示滇池沉积物氮污染影响因素及沉积物氮释放风险.结果表明:1滇池全湖表层沉积物总氮(TN)平均含量为3 515.60 mg·kg-1,其中草海北部疏挖区、盘龙江入湖口及海口入湖区域含量较高,宝象河河口疏挖区域TN含量相对较低;总有机氮(TON)含量较高,占TN的85.86%;溶解态无机氮(DIN)含量较低,占TN的14.10%,TON与TN空间分布趋势一致,而DIN则不同;与我国其他湖泊相比,滇池沉积物氮含量已经处于较高水平,其污染程度仅低于污染严重的城市湖泊;2滇池全湖表层沉积物潜在可矿化氮(PMN)平均含量1 154.76 mg·kg-1,占TN的32.90%,潜在释放风险较大;其中草海湖区、外海北部盘龙江入湖口湖区、中部洛龙河和梁王河入湖口湖区及白鱼口湖区显著高于其它湖区;目前滇池p H值有利于其沉积物氮矿化,有机质通过释放NH+4-N影响其沉积物氮矿化;污染较重的水域,滇池上覆水氮浓度受其沉积物氮矿化影响较大,而污染较轻水域,则受影响较小.
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关键词
氮形态
空间分布
矿化能力
滇池
表层沉积物
原文传递
题名
菊花rbcL基因电子克隆及生物信息学、适应性进化分析
被引量:
5
1
作者
丁帅
熊勇
李正涛
王忠诚
孟亚媛
李乐
肖焱波
机构
云南民族大学化学与生物技术学院
中北大学化工与环境学院
出处
《种子》
北大核心
2015年第10期24-30,共7页
基金
研究生创新基金项目(编号:2014YJY 77)
文摘
目的:利用电子克隆技术获得菊花叶绿体中编码核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶大亚基rbcL基因,并对该电子克隆的菊花rbcL基因序列、编码氨基酸的特性及适应性进化进行分析。方法:根据相关文献,利用电子克隆方法克隆出菊花rbcL完整基因序列,对其进行生物信息学分析、结构建模和评价。结果:通过电子克隆获得菊花rbcL基因完整的开放阅读框序列,该系列长1 452bp,编码氨基酸483个。在预测电子克隆菊花rbcL基因编码蛋白的二级结构中,主要有α螺旋19个,β折叠18个。通过适应性进化分析找到7个氨基酸正选择位点(228S,255V,279T,309M,328S,439T,449T)。结论:电子克隆获得菊花rbcL基因的完整序列为以后实验研究提供一定的参考数据,对所编码的蛋白质适应性研究有利于探究对菊科植物适应环境的机制。
关键词
菊花
RBCL基因
电子克隆
生物信息学
适用性进化分析
Keywords
Chrysanthemum morifolium
rbcLgene
in silico cloning
bioinformatics
adaptive evolution analysis
分类号
S682.11 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
滇池表层沉积物氮污染特征及其潜在矿化能力
被引量:
25
2
作者
孟亚媛
王圣瑞
焦立新
刘文斌
肖焱波
祖维美
徐天敏
丁帅
周童
机构
云南民族大学化学与生物技术学院
中国环境科学研究院
中国环境科学研究院国家环境保护湖泊污染控制重点实验室
云南民族大学植物营养与新型肥料研究所
出处
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015年第2期471-480,共10页
基金
国家自然科学基金项目(U1202235)
国家水体污染控制与治理科技重大专项(2012ZX07102-004)
文摘
利用滇池53个表层沉积物样品,研究了其不同形态氮含量及空间分布特征,探讨了滇池沉积物氮潜在矿化能力及其污染特征,以期揭示滇池沉积物氮污染影响因素及沉积物氮释放风险.结果表明:1滇池全湖表层沉积物总氮(TN)平均含量为3 515.60 mg·kg-1,其中草海北部疏挖区、盘龙江入湖口及海口入湖区域含量较高,宝象河河口疏挖区域TN含量相对较低;总有机氮(TON)含量较高,占TN的85.86%;溶解态无机氮(DIN)含量较低,占TN的14.10%,TON与TN空间分布趋势一致,而DIN则不同;与我国其他湖泊相比,滇池沉积物氮含量已经处于较高水平,其污染程度仅低于污染严重的城市湖泊;2滇池全湖表层沉积物潜在可矿化氮(PMN)平均含量1 154.76 mg·kg-1,占TN的32.90%,潜在释放风险较大;其中草海湖区、外海北部盘龙江入湖口湖区、中部洛龙河和梁王河入湖口湖区及白鱼口湖区显著高于其它湖区;目前滇池p H值有利于其沉积物氮矿化,有机质通过释放NH+4-N影响其沉积物氮矿化;污染较重的水域,滇池上覆水氮浓度受其沉积物氮矿化影响较大,而污染较轻水域,则受影响较小.
关键词
氮形态
空间分布
矿化能力
滇池
表层沉积物
Keywords
nitrogen forms
spatial distribution
mineralization capacity
Dianchi Lake
surface sediment
分类号
X524 [环境科学与工程—环境工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
菊花rbcL基因电子克隆及生物信息学、适应性进化分析
丁帅
熊勇
李正涛
王忠诚
孟亚媛
李乐
肖焱波
《种子》
北大核心
2015
5
下载PDF
职称材料
2
滇池表层沉积物氮污染特征及其潜在矿化能力
孟亚媛
王圣瑞
焦立新
刘文斌
肖焱波
祖维美
徐天敏
丁帅
周童
《环境科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2015
25
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