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马铃薯AQP基因家族鉴定及表达分析
被引量:
1
1
作者
满全财
孟姿诺
+5 位作者
李伟
蔡心汝
苏润东
付长青
高顺娟
崔江慧
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期51-63,共13页
【目的】水通道蛋白(Aquaporins,AQPs)在植物非生物胁迫下的植物生长发育、水分运输和应激反应等生理过程中至关重要,本研究旨在揭示马铃薯StAQP家族的特性及功能。【方法】对马铃薯StAQP基因家族进行全基因组鉴定,利用生物信息学手段...
【目的】水通道蛋白(Aquaporins,AQPs)在植物非生物胁迫下的植物生长发育、水分运输和应激反应等生理过程中至关重要,本研究旨在揭示马铃薯StAQP家族的特性及功能。【方法】对马铃薯StAQP基因家族进行全基因组鉴定,利用生物信息学手段对基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位以及基因共线性等进行分析,并结合转录组数据以及RT-qPCR对基因表达模式进行验证。【结果】马铃薯StAQP基因家族的44个成员分布在PIP、TIP、NIP、SIP和XIP五个亚族中,相同亚族的家族成员的基因结构和保守基序基本一致,同时马铃薯AQP家族成员大多数分布在质膜上;马铃薯StAQP家族成员中含有大量和光反应以及胁迫响应有关的顺式作用元件;共线性结果表明,马铃薯AQP家族与拟南芥、烟草、番茄和辣椒4个物种的AQP家族之间存在大量同源基因对;转录组和RT-qPCR验证结果表明,马铃薯StAQP家族成员在干旱胁迫和盐胁迫下高度表达,不同家族成员表达存在差异,同时相同基因在不同胁迫下的表达情况也存在差异,其中StAQP7、StAQP28和StAQP31这3个基因是StAQP家族响应非生物胁迫的关键基因。【结论】StAQPs基因在马铃薯的生长发育和非生物胁迫响应中发挥重要作用。
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关键词
马铃薯
水通道蛋白
生物信息学
非生物胁迫
表达分析
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职称材料
题名
马铃薯AQP基因家族鉴定及表达分析
被引量:
1
1
作者
满全财
孟姿诺
李伟
蔡心汝
苏润东
付长青
高顺娟
崔江慧
机构
河北农业大学农学院河北省作物种质资源重点实验室华北作物种质资源研究与利用教育部重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期51-63,共13页
基金
河北省承德市科技计划项目(202305B040)
河北省脱毒马铃薯繁育技术创新中心(SG2012016)
河北(承德)马铃薯种薯产业技术研究院创新能力提升(202206F013)。
文摘
【目的】水通道蛋白(Aquaporins,AQPs)在植物非生物胁迫下的植物生长发育、水分运输和应激反应等生理过程中至关重要,本研究旨在揭示马铃薯StAQP家族的特性及功能。【方法】对马铃薯StAQP基因家族进行全基因组鉴定,利用生物信息学手段对基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位以及基因共线性等进行分析,并结合转录组数据以及RT-qPCR对基因表达模式进行验证。【结果】马铃薯StAQP基因家族的44个成员分布在PIP、TIP、NIP、SIP和XIP五个亚族中,相同亚族的家族成员的基因结构和保守基序基本一致,同时马铃薯AQP家族成员大多数分布在质膜上;马铃薯StAQP家族成员中含有大量和光反应以及胁迫响应有关的顺式作用元件;共线性结果表明,马铃薯AQP家族与拟南芥、烟草、番茄和辣椒4个物种的AQP家族之间存在大量同源基因对;转录组和RT-qPCR验证结果表明,马铃薯StAQP家族成员在干旱胁迫和盐胁迫下高度表达,不同家族成员表达存在差异,同时相同基因在不同胁迫下的表达情况也存在差异,其中StAQP7、StAQP28和StAQP31这3个基因是StAQP家族响应非生物胁迫的关键基因。【结论】StAQPs基因在马铃薯的生长发育和非生物胁迫响应中发挥重要作用。
关键词
马铃薯
水通道蛋白
生物信息学
非生物胁迫
表达分析
Keywords
potato
aquaporins
bioinformatics
abiotic stress
expression analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S532 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
马铃薯AQP基因家族鉴定及表达分析
满全财
孟姿诺
李伟
蔡心汝
苏润东
付长青
高顺娟
崔江慧
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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参考文献
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