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bta-miR-27a-5p的生物信息学分析及其对3T3-L1前脂肪细胞分化的影响
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作者 李鑫 乔俊杰 +6 位作者 吴金瑞 侯中一 孟聖博 杜志龙 许会芬 李明 蔡含芳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第13期1-9,111,共10页
为了探究bta-miR-27a-5p的生物学特性及其对3T3-L1前脂肪细胞分化的影响,试验利用miRBase数据库对不同物种间miR-27a-5p的保守性进行分析,并构建了miR-27a-5p的系统进化树;利用TargetScan和miRWalk在线网站预测bta-miR-27a-5p的靶基因,... 为了探究bta-miR-27a-5p的生物学特性及其对3T3-L1前脂肪细胞分化的影响,试验利用miRBase数据库对不同物种间miR-27a-5p的保守性进行分析,并构建了miR-27a-5p的系统进化树;利用TargetScan和miRWalk在线网站预测bta-miR-27a-5p的靶基因,并对靶基因进行GO功能注释和KEGG信号通路分析;利用实时荧光定量PCR方法检测在不同月龄夏南牛不同器官中bta-miR-27a-5p基因的相对表达量;最后通过实时荧光定量PCR方法、Western-blot检测、三酰甘油浓度测定和油红O染色探究过表达bta-miR-27a-5p后对3T3-L1前脂肪细胞分化的影响。结果表明:不同物种miR-27a-5p的成熟序列保守性较高;牛miR-27a-5p基因与山羊的亲缘关系最近,与非洲爪蟾的亲缘关系最远;bta-miR-27a-5p靶基因主要在细胞过程、生物过程、细胞、细胞部分、结合等GO条目上富集,并富集在胰岛素抵抗、细胞衰老、脂肪细胞因子等信号通路中;bta-miR-27a-5p基因可在夏南牛的多个器官中表达,且12月龄夏南牛脂肪组织中的相对表达量均显著低于0月龄和24月龄(P<0.05);过表达bta-miR-27a-5p基因可显著或极显著抑制C/EBPα、PPARγ和FABP4基因和蛋白质表达(P<0.05或P<0.01),并显著或极显著降低3T3-L1前脂肪细胞内脂滴和三酰甘油浓度(P<0.05或P<0.01)。说明bta-miR-27a-5p在不同物种间高度保守,在不同月龄夏南牛脂肪组织中显著差异表达,并且能抑制3T3-L1前脂肪细胞分化,bta-miR-27a-5p基因可能是调控牛脂肪生成的候选miRNA。 展开更多
关键词 bta-miR-27a-5p 靶基因 生物信息学分析 夏南牛 表达分析 3T3-L1前脂肪细胞
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基于深度学习的遥感影像时空融合及冬小麦种植面积提取 被引量:1
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作者 张娟娟 谢一敏 +4 位作者 董萍 司海平 王晓平 马新明 《遥感技术与应用》 CSCD 北大核心 2023年第3期578-587,共10页
利用遥感技术快速、准确地进行冬小麦种植面积提取对农作物估产和粮食安全具有重要意义。由于中高分辨率时序影像受重访周期、云雨天气等影响难以获取,而低分辨率遥感数据在作物种植信息提取上精度低等问题,以河南省长葛市为例,获取2015... 利用遥感技术快速、准确地进行冬小麦种植面积提取对农作物估产和粮食安全具有重要意义。由于中高分辨率时序影像受重访周期、云雨天气等影响难以获取,而低分辨率遥感数据在作物种植信息提取上精度低等问题,以河南省长葛市为例,获取2015~2020年间的Landsat 8和MODIS影像为数据集,基于优化后的卷积神经网络时空融合模型对2种数据进行融合,构建30 m分辨率的NDVI时间序列集,采用S-G(Savitzky-Golay)滤波对时序集进行去噪,最后利用随机森林方法对冬小麦种植面积进行提取。结果表明:优化后的融合模型鲁棒性较好,预测影像与真实影像R^(2)均在0.92以上。研究区小麦面积提取与统计面积的一致性为97.3%,结果可靠。因此,优化后的模型能较好地融合出中高分辨率影像,是一种有效的补充缺失影像的技术手段,构建的时序集能较为准确地提取县域小麦种植面积。 展开更多
关键词 多源遥感 时空融合 卷积神经网络 分类 种植面积
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