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题名SVM在基因微阵列癌症数据分类中的应用
被引量:2
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作者
孟范静
刘毅慧
王洪国
成金勇
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机构
山东轻工业学院信息科学与技术学院
山东省科学技术厅
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2007年第34期246-248,共3页
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文摘
在总结二分类支持向量机应用的基础上,提出了利用t-验证方法和Wilcoxon验证方法进行特征选取,以支持向量机(SVM)为分类器,针对基因微阵列癌症数据进行分析的新方法,通过对白血病数据集和结肠癌数据集的分类实验,证明提出的方法不但识别率高,而且需要选取的特征子集小,分类速度快,提高了分类的准确性与分类速度。
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关键词
微阵列数据
支持向量机
癌症数据分类
特征选取
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Keywords
microarray data
Support Vector Machine(SVM )
cancer classification
feature selection
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分类号
TP391
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名遗传优化算法在基因数据分类中的应用
被引量:2
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作者
孟范静
刘毅慧
王洪国
成金勇
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机构
山东轻工业学院
山东省科学技术厅
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出处
《生物信息学》
2008年第3期119-122,共4页
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基金
山东省自然科学基金
Y2006C96
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文摘
本文提出了一种基于遗传算法的基因微阵列数据特征提取方法。首先对原始数据进行标准化,然后利用方差分析方法对数据进行降低维数处理,最后利用遗传算法对数据进行优化。针对基因数据对遗传算子和适应度函数进行设置,优化数据集选取特征基因,得到较小的特征子集。为了验证选取的特征,利用样本划分法通过判别分析建立分类器进行判定。实验论证此方法具有理想的分类效果,算法稳定、效率高。
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关键词
基因数据
数据预处理
特征选取
遗传算法
分类评价
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Keywords
Microarrays data
Data pre-processing
Feature selection
Genetic Algorithm
Linear Diserirainant Analysis
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分类号
Q617
[生物学—生物物理学]
TP391
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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