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题名面向异质基因数据的智能层次聚类算法研究
被引量:4
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作者
季姜帅
裴颂文
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机构
上海理工大学光电信息与计算机工程学院
复旦大学上海市数据科学重点实验室
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出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2022年第9期1808-1813,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(61975124)资助
上海市自然科学基金项目(20ZR1438500)资助
+1 种基金
上海市科委科技行动计划专项基金项目(19DZ2301100,20DZ2303500)资助
上海市数据科学重点实验室开放课题项目(2020090600003)资助.
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文摘
随着对基因致病理论研究的深入,产生了大量的异质基因表达量数据,且这些基因数据普遍存在高维度、非对称和高噪声等特性,因此通用的聚类算法面向异质基因数据的聚类精度不高.本文提出了一种面向异质基因数据的智能层次聚类算法(HCIGA).构建了融合精英保留法与轮盘赌的选择算子,并通过优化适应度函数和小生境策略保持种群多样性,加快收敛速度,提升聚类精度.HCIGA的有效性在脑肿瘤、肺癌、肾脏癌和乳腺癌数据集上进行测试,结果表明,与层次聚类算法(AGNES)、遗传K-Means算法(GKA)、DPeak和谱聚类算法相比,HCIGA算法的聚类精确度在五种算法中均为最佳,本文并将HCIGA算法应用于头颈部鳞状细胞癌(HNSC)数据集,成功识别出6种癌症亚型.
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关键词
聚类分析
遗传算法
基因表达量
数据挖掘
小生境技术
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Keywords
cluster analysis
genetic algorithm
gene expression level
data mining
niche technique
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分类号
TP391
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名屠“龙”计划
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作者
季姜帅
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机构
江苏省海门市树勋中心小学四年三班
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出处
《小作家选刊(小学生版)》
2005年第7期8-8,共1页
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文摘
我舅舅“江湖”人称——龙的传人!(这是我给取的)这可不是传统概念中“炎黄子孙,龙的传人!”而是因为舅舅有一大嗜好——吞云吐雾。欲知详细情节, 且听我慢慢道来!
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关键词
龙的传人
详细情节
炎黄子孙
嗜好
江湖
最严厉的惩罚
江苏省海门市
指导教师
犯罪嫌疑
嫌疑人
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分类号
G624.2
[文化科学—教育学]
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