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基于重测序开发的InDel标记定位陆地棉矮化突变体
被引量:
5
1
作者
季高翔
何守朴
+6 位作者
潘兆娥
龚文芳
贾银华
王立如
王朋朋
耿晓丽
杜雄明
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2018年第6期448-454,共7页
【目的】利用重测序开发的InDel标记实现陆地棉矮化突变体基因AS98的定位。【方法】利用1个极端矮化材料AS98与其野生型LHF10构建F2群体,根据突变体及其野生型的重测序数据开发InDel标记,并利用新开发的分子标记对矮化性状进行定位。【...
【目的】利用重测序开发的InDel标记实现陆地棉矮化突变体基因AS98的定位。【方法】利用1个极端矮化材料AS98与其野生型LHF10构建F2群体,根据突变体及其野生型的重测序数据开发InDel标记,并利用新开发的分子标记对矮化性状进行定位。【结果】挑选新开发的位于初步定位区间内的InDel标记114对,用2个材料进行标记多态性检测,筛选出具有多态性的标记20对;利用多态性标记在包含223个单株的F2群体中进行聚合酶链式反应,结合表型把矮化基因AS98定位于染色体D12上,与其最近的分子标记是InDel-50,遗传距离为6.9 cM。【结论】本试验证实了利用重测序数据开发InDel标记,并在陆地棉矮化材料衍生的分离群体中进行基因定位的可行性,为进一步精细定位及分子辅助选择育种提供参考。
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关键词
陆地棉
INDEL
矮化
定位
下载PDF
职称材料
题名
基于重测序开发的InDel标记定位陆地棉矮化突变体
被引量:
5
1
作者
季高翔
何守朴
潘兆娥
龚文芳
贾银华
王立如
王朋朋
耿晓丽
杜雄明
机构
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2018年第6期448-454,共7页
基金
国家自然科学基金(31671746)
文摘
【目的】利用重测序开发的InDel标记实现陆地棉矮化突变体基因AS98的定位。【方法】利用1个极端矮化材料AS98与其野生型LHF10构建F2群体,根据突变体及其野生型的重测序数据开发InDel标记,并利用新开发的分子标记对矮化性状进行定位。【结果】挑选新开发的位于初步定位区间内的InDel标记114对,用2个材料进行标记多态性检测,筛选出具有多态性的标记20对;利用多态性标记在包含223个单株的F2群体中进行聚合酶链式反应,结合表型把矮化基因AS98定位于染色体D12上,与其最近的分子标记是InDel-50,遗传距离为6.9 cM。【结论】本试验证实了利用重测序数据开发InDel标记,并在陆地棉矮化材料衍生的分离群体中进行基因定位的可行性,为进一步精细定位及分子辅助选择育种提供参考。
关键词
陆地棉
INDEL
矮化
定位
Keywords
Gossypium hirsutum
InDel
dwarf
mapping
分类号
S562.024 [农业科学—作物学]
Q343.17 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于重测序开发的InDel标记定位陆地棉矮化突变体
季高翔
何守朴
潘兆娥
龚文芳
贾银华
王立如
王朋朋
耿晓丽
杜雄明
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2018
5
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