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文冠果种子发育基因表达分析内参基因的选择
1
作者
李麟坤
梁重钧
+4 位作者
宁楚龙
张薇
姜国维
张鑫
王利兵
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2024年第3期79-85,共7页
[目的]验证ACT基因是否适用于文冠果种子发育的相关基因表达分析,并筛选出在文冠果基因表达分析中最稳定的内参基因。[方法]本研究采用了4种数学算法(ΔCT、BestKeeper、NormFinder、geNorm)评估12个候选内参基因的表达稳定性,并利用在...
[目的]验证ACT基因是否适用于文冠果种子发育的相关基因表达分析,并筛选出在文冠果基因表达分析中最稳定的内参基因。[方法]本研究采用了4种数学算法(ΔCT、BestKeeper、NormFinder、geNorm)评估12个候选内参基因的表达稳定性,并利用在线工具RefFinder综合评价。[结果]在文冠果不同发育时期种子内参基因综合评分排名为PP2A>Tip41> EF-1α>18r>UCE>β-TUB>UBQ>α-TUB>CYP>SAM>ACT>GADPH;在文冠果不同组织内参基因综合评分排名为PP2A>Tip41>CYP>18r>UBQ>SAM>EF-1α>UCE>GADPH>α-TUB>ACT>β-TUB。[结论] PP2A和Tip41基因是文冠果基因表达分析最稳定的内参基因。
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关键词
文冠果
内参基因
基因表达
种子发育
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题名
文冠果种子发育基因表达分析内参基因的选择
1
作者
李麟坤
梁重钧
宁楚龙
张薇
姜国维
张鑫
王利兵
机构
中国林业科学研究院林业研究所
西北农林科技大学林学院
出处
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2024年第3期79-85,共7页
基金
国家自然科学基金(31870594)
西北农林科技大学高层次人才科研经费。
文摘
[目的]验证ACT基因是否适用于文冠果种子发育的相关基因表达分析,并筛选出在文冠果基因表达分析中最稳定的内参基因。[方法]本研究采用了4种数学算法(ΔCT、BestKeeper、NormFinder、geNorm)评估12个候选内参基因的表达稳定性,并利用在线工具RefFinder综合评价。[结果]在文冠果不同发育时期种子内参基因综合评分排名为PP2A>Tip41> EF-1α>18r>UCE>β-TUB>UBQ>α-TUB>CYP>SAM>ACT>GADPH;在文冠果不同组织内参基因综合评分排名为PP2A>Tip41>CYP>18r>UBQ>SAM>EF-1α>UCE>GADPH>α-TUB>ACT>β-TUB。[结论] PP2A和Tip41基因是文冠果基因表达分析最稳定的内参基因。
关键词
文冠果
内参基因
基因表达
种子发育
Keywords
Xanthoceras sorbifolium
reference gene
gene expression
seed development
分类号
S727.32 [农业科学—林木遗传育种]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
文冠果种子发育基因表达分析内参基因的选择
李麟坤
梁重钧
宁楚龙
张薇
姜国维
张鑫
王利兵
《林业科学研究》
CSCD
北大核心
2024
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