北京地区不同分娩方式婴幼儿肠道菌群分析

婴幼儿时期肠道菌群的定殖是肠道菌群形成的关键时期,影响未来生长发育和健康状况。旨在探讨不同分娩方式婴幼儿肠道菌群多样性差异。选取258例0~3岁北京地区健康婴幼儿肠道粪便样品,其中包括97例剖宫产样品、161例自然分娩样品。通过高通量测序技术分析表明,某些细菌的相对丰度发生显著改变。与剖宫产婴幼儿相比,自然分娩婴幼儿肠道中的放线菌门(优势菌,13.92%VS 16.86%)和酸杆菌门(劣势菌,0%VS 0.00204%)的相对丰度显著升高(P<0.05);而厚壁菌门(优势菌,67.17%VS 61.16%)和柔膜菌门(劣势菌,0.074%VS 0.051%)的相对丰度明显下降(P<0.05)。在属水平上,优势菌中的双歧杆菌属(13.01%VS 15.74%)在自然分娩婴幼儿肠道粪便中的含量显著升高,而梭菌属(2.25%VS 1.53%)显著降低。

糖抗原sTn是Ⅰ型子宫内膜癌的新型标记物(英文)

Sialyl-Tn(sTn)是肿瘤相关糖抗原的一种,在多种上皮来源的肿瘤组织中都存在sTn的过表达.但是,关于sTn在子宫内膜癌中的表达情况目前研究得很少,而且仅有的报道也互相矛盾.为了阐明这一问题,我们选取了111例临床样本,其中包括82例子宫内膜癌,16例非典型增生内膜,13例正常内膜,利用免疫组化的方法分析了sTn的表达情况.结果表明,sTn在子宫内膜癌中高表达,但仅限于Ⅰ型子宫内膜癌(80%),而在Ⅱ型子宫内膜癌中表达率仅为45%,二者具有显著性差异(P<0.05).这是我们首次报道sTn特异性与Ⅰ型子宫内膜癌相关,有利于解释过去前后不一的矛盾结果.在非典型组织中,sTn的表达率较正常组织高,分别为31%(正常组织)和44%(非典型组织).这说明sTn参与了子宫内膜癌的发生发展.同时,我们的结果表明,sTn的表达与肿瘤的组织分级具有相关性,其在高、中分化的肿瘤组织中表达率明显高于低分化的肿瘤组织.这预示着sTn可能与子宫内膜癌的良好预后相关.我们的研究为诊断Ⅰ型子宫内膜癌提供了一个新的标记物和诊断试剂,同时提示我们,将来对于子宫内膜癌的研究,有必要对Ⅰ型子宫内膜癌和Ⅱ型子宫内膜癌区别对待.

我国新育成葡萄品种SSR指纹图谱的建立

【目的】建立我国近年来新育成葡萄品种的指纹图谱,明确他们之间的亲缘关系。【方法】收集了国内新育成的24个葡萄品种,采用6对国际通用的SSR荧光标记引物对其进行扩增,通过毛细管电泳进行基因分型。【结果】这6个标记不仅可以明确的区分每一个供试品种,而且能很好鉴定葡萄品种的倍性,同时这些标记也可以用于品种间亲缘关系的鉴定,区分不同亲本、不同种群及不同亚属的葡萄品种。【结论】该SSR指纹图谱的建立可以完善我国葡萄品种数据库,为品种鉴定、植物品种权保护及亲缘关系分析提供很好的参考依据。

传统馒头发酵酵子中一株优势乳酸菌CGMCC 10624的分离与鉴定

目的对分离自传统馒头发酵酵子中的一株优势乳酸菌CGMCC 10624进行多相分类学鉴定与分析。方法从馒头发酵酵子中分离、纯化得到乳酸菌CGMCC 10624,综合利用细菌形态学观察、基于细菌16S rRNA基因序列的系统发育学分析以及基于碳源代谢利用情况的生理生化特征鉴定方法,对其分类地位进行研究。结果乳酸菌菌株CGMCC 10624被鉴定为食窦魏斯氏菌(Weissella cibaria)。结论本研究分离、鉴定得到传统馒头发酵酵子中的一株优势乳酸菌,为该菌的生物学功能研究及制作包含乳酸菌和酵母菌的复合发酵菌剂奠定了资源基础。

毛兰素抗肿瘤活性研究进展

毛兰素是从石斛中提取的天然产物,近年来发现毛兰素在体外和体内表现出抗癌活性,诱导多种肿瘤细胞生长抑制。目前报道的毛兰素抗肿瘤效应与多个信号通路相关。通过激活细胞凋亡的内部线粒体途径和死亡受体介导的外部凋亡途径诱导凋亡;通过ROS/JNK信号通路诱导细胞周期G2/M期停滞,凋亡和自噬;通过调节促迁移蛋白和迁移抑制蛋白的表达抑制肿瘤细胞的迁移;通过阻断JAK2/STAT3的磷酸化抑制血管生成等。本文针对抗肿瘤活性的研究进行简要综述。

免疫磁分离-两重荧光定量PCR法快速检测鲜猪肉中金葡菌和志贺氏菌

本研究建立了一种6h内从鲜猪肉中富集、提取和检测金黄色葡萄球菌和志贺氏菌的方法。对鲜猪肉样品进行3h增菌后,在37℃条件下使用金黄色葡萄球菌和志贺氏菌的免疫磁球,从250mL体系中快速捕获两种目标致病菌,快速提取核酸后,结合特异性引物及探针,使用两重荧光定量PCR法进行检测。结果显示金黄色葡萄球菌和志贺氏菌的检测限分别达到2.52CFU/g和1.36CFU/g。方法总体灵敏度、特异性和准确度均达到100%,适用于鲜猪肉中金黄色葡萄球菌和志贺氏菌的快速检测。

北京老年人KCNJ11基因(rs5219)和CYP2C8基因(rs10509681)多态性与2型糖尿病的关联

目的探讨北京地区老年人KCNJ11(rs5219)和CYP2C8(rs10509681)多态性与2型糖尿病(type 2 diabetesmellitus,T2DM)的关联。方法选取2019年1—12月北京市新居里社区、北下关社区、牡丹园东里社区、大柳树社区等多个社区65岁以上老年人321例,分组为T2DM组(161例)和健康组(160例)。采用Mass ARRAY核酸质谱方法,检测KC-NJ11(rs5219)和CYP2C8(rs10509681)基因多态性,并分析其基因型频率和等位基因频率,进行比较。探讨隐性、显性或加性基因型模式与T2DM的关联。结果KCNJ11 rs5219的次要等位基因频率(minor allele frequency,MAF)在T2DM组为49.38%、健康组为39.06%,差异有统计学意义(P<0.05);KCNJ11 rs5219的隐性(CC比TC+TT,P=0.037)、显性(TT比TC+CC,P=0.027)和加性(TC比TT+CC,P=0.008)模型与T2DM有关。CYP2C8(rs10509681)的MAF在T2DM组为4.66%、健康组为1.25%,差异有统计学意义(P<0.05);CYP2C8(rs10509681)隐性(TT比CT+CC,P=0.018)模型与T2DM有关,而显性模型(CC比CT+TT,P=0.115)和加性(CT比TT+CC,P=0.058)模型与T2DM无关。结论KCNJ11(rs5219)和CYP2C8(rs10509681)基因多态性均与T2DM显著相关。

北京地区不同喂养方式婴幼儿肠道菌群多样性分析

目的探讨不同喂养方式对0~3岁婴幼儿肠道微生物的影响,以及喂养方式引起的肠道菌群变化与婴幼儿的年龄和分娩方式之间的相关性。方法选取221例0~3岁北京地区健康婴幼儿肠道粪便样品,按照哺乳方式,将这些样品分为4组:纯母乳组(B),纯奶粉组(F),以母乳为主、奶粉和辅食为辅组(BP),以奶粉为主、辅食为辅(NB)。其中B组44例、F组29例、BP组108例、NB组40例。利用16S微生物多样性测序技术分析了不同喂养方式对婴幼儿肠道微生物的丰度影响。结果在物种组成上,没有摄入母乳的NB组,门水平上优势菌的含量变化明显。厚壁菌门、变形菌门、放线菌门和拟杆菌门4大优势菌的总含量明显低于B组、BP组和F组。在属水平上B组、BP组和F组相互比较, F组双歧杆菌属和拟杆菌属的含量显著下降,但粪杆菌属、罕见小球菌属等厌氧菌的含量升高。主成分分析的结果表明, NB组和B组的距离最远, F组与BP组的距离最近。F组与B组的差异要大于BP组与B组的差异,说明,与纯母乳喂养的婴幼儿相比,奶粉喂养的婴幼儿其肠道微生物的变化要大于辅以母乳摄入的婴幼儿。同时,关联性分析表明分娩方式与喂养方式和婴幼儿年龄在影响肠道菌群的丰富度上密切相关。结论出生前3年的饮食组成和模式会显著影响肠道微生物群的多样性,这种多样性变化与婴幼儿的年龄和分娩方式均具有密切的相关性。

Syntaxin 8蛋白在胃癌组织中的表达及临床意义

目的:探讨突触融合蛋白8(STX8)在胃癌组织中的表达及其临床意义。方法:收集62例胃癌患者术后胃癌及癌旁组织,采用免疫组织化学染色和Western blot方法检测STX8的蛋白表达,并分析STX8表达与胃癌临床病理的关系。结果:免疫组织化学结果显示,STX8在胃癌组织中阳性表达,在大部分癌旁胃组织中为阴性表达,差异有统计学意义(P<0.05);Western blot检测发现胃癌组织中STX8蛋白表达水平明显高于癌旁组织。相关分析发现syntaxin 8在胃癌组织中的高表达与患者性别、年龄、肿瘤大小、TNM分期及胃癌侵袭转移无关,但与发生远处转移相关。结论:STX8在胃癌组织中异常高表达,可能与胃癌的发生发展相关,也可能是潜在的胃癌分子诊疗靶点。

海马神经元初级纤毛染色技术探索

为了建立体外原代培养的大鼠海马神经元初级纤毛的染色标记方法,以体外原代培养的18 d胎鼠的海马神经元为研究材料,应用荧光免疫细胞化学实验技术,分别在不同的时间点,应用不同的初级纤毛蛋白标记物的抗体[抗ADP核糖基化因子相似蛋白-13B(ARL13B)抗体,抗III型腺苷酸环化酶(ACIII)抗体]对海马神经元初级纤毛进行染色,然后应用倒置荧光显微镜观察记录染色结果。从免疫荧光图像中看出,anti-ARL13B抗体和anti-ACIII抗体都能较好地标记海马神经元初级纤毛,但anti-ARL13B抗体的染色效果更佳。随着体外原代培养天数的增加,初级纤毛长度逐步增加(anti-ACIII抗体标记组:纤毛生长从第1天的3.3μm到第14天的8.5μm逐渐增加;antiARL13B抗体标记组:纤毛生长从第1天的4.4μm到第14天的9.1μm逐渐增加)。对星型胶质细胞的ACIII和ARL13B进行免疫荧光染色,也能较好地标记其初级纤毛。ARL13B和ACIII都能作为大鼠海马神经元初级纤毛的标记物,但ARL13B体现出更好的特异性。初级纤毛会伴随着海马神经元的发育成熟而生长,提示初级纤毛在海马神经元的发育过程中可能发挥着重要作用。ARL13B和ACIII也可以作为星型胶质细胞初级纤毛的染色标志。

AmphiSox1/2/3-like基因的系统进化学分析和在文昌鱼胚胎发育中的表达

为了研究文昌鱼胚胎发育中神经管发育的分子机制和脊椎动物中枢神经系统的起源,我们筛选和分析了与佛罗里达文昌鱼AmphiSox1/2/3基因同源的青岛文昌鱼AmphiSox1/2/3-like 基因,对其推测的氨基酸序列与17个脊椎动物和无脊椎动物的同源基因进行了系统的进化学分析,并利用胚胎整体原位杂交技术结合系列组织学切片技术,对该基因在青岛文昌鱼胚胎发育中的时空表达模式进行了系统的研究.AmphiSox1/2/3-like在原肠胚早中期开始在背部上胚层和预定神经外胚层中明显表达.在神经胚早期其表达定位于神经板.此后,表达区域位于形成中的神经管和胚胎中、后部分化中的神经管的两侧,其表达的水平从前向后逐渐下调和终止.此外,该基因在神经胚晚期和幼虫期的消化道壁中也有明显表达.研究结果显示,该基因与文昌鱼的神经分化和消化道分化密切相关.

子痫前期孕妇血浆循环游离微小RNA表达的分析

妊娠20周后出现高血压[收缩压≥140mmHg（1mmHg=0．133kPa）和（或）舒张压〉90mmHg]、蛋白尿（24h尿蛋白量〉0．3g），称为子痫前期（pre-eclampsia，PE）；PE的发病率为2％～8％，是导致孕产妇死亡的主要原因之一。目前，尽管已经证实，胎盘生长因子、胎盘蛋白13、可溶性内皮因子等可被用于监测PE的发生和发展，但其敏感度和特异度均较差。因此，临床上亟待新的诊断标志物的开发和应用。

PCR扩增循环数对细菌群落多样性测序分析的影响

运用高通量测序技术分析复杂样品中微生物群落组成及变化趋势,已经成为目前微生物研究领域的热点之一。本研究以复杂土壤样品和应用范围较广的瘤胃食糜样品为对象,选取20、25和30三个扩增循环数分别对样品的16S r RNA基因的V3区进行扩增,然后进行文库构建和测序。最后通过数据分析比较不同的扩增循环数对细菌多样性测定结果的影响。结果表明,扩增循环数越多,捕获到的细菌数量和种类越多;但并非循环数越多,群落中的微生物组成比例最优。整体来看,当扩增循环数为25时,样品中物种的数量和组成是最优的。

DNA提取对微生物多样性测序分析的影响

运用高通量测序技术分析复杂样品中微生物种群的变化情况,已经成为目前微生物研究领域的热点问题之一。而微生物的样品准备,如DNA提取和16S可变区的扩增等,对于测序完成后的数据分析以及微生物原始群落组成的影响是至关重要的。采用国产试剂盒(天根土壤微生物基因组提取试剂盒)和进口试剂盒(MOBIO土壤微生物基因组提取试剂盒)分别对土壤样品和羊瘤胃食糜样品进行DNA提取。然后选取总DNA起始量为25ng,对16S V3可变区进行PCR扩增和文库构建,最后通过数据分析比较不同试剂盒提取的DNA对微生物多样性变化的影响,包括OTU数目、稀释曲线、微生物数量及物种种类等。研究发现,在相同DNA模板量和PCR条件下,进口试剂盒提取的DNA能够获得更多的微生物种类。

环状RNA在子痫前期中的研究进展

子痫前期是1种多因素、多机制及多通路致病的疾病,是妊娠期特发疾病,可影响机体的各个器官及系统。子痫前期的发生率约占全部妊娠者的3.9%,是造成孕产妇和围产儿死亡的主要原因之一,每年约有76000例孕产妇和500000例围产儿死于妊娠期高血压疾病[1-2]。

癌症基因组测序方案制定的研究进展

癌症的基因组测序对于癌症的预防、诊断、预后、治疗以及基础生物学研究都有巨大的潜在的应用价值,正是由于其方向广泛,所以基因组测序的方案制定对于实现特定的研究目标,就显得尤为重要。同时,了解了基因组测序方案制定的规则,也有助于评估如今快速增长的发表文献的正确性和重要性。主要论述高通量测序技术在癌症基因组测序中的实际应用,并讨论癌症基因组测序在方案设计和方法学上如何调整,才能更好地实现特定的研究目的。

利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估

活禽贸易和H7N9禽流感病毒传播之间存在关联,应用大数据技术分析活禽交易网络数据,可进行疫情溯源并预测未来传播趋势。从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,构建系统进化树推断2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市间的传播情况,并与大数据推断结果进行对比分析。结果表明,系统进化树推断结果更为准确,但大数据分析能够提供更多地区的信息且具有更好的时效性,同时推断的传播模型准确度较高,在H7N9疫情的应对中具有较高的应用价值。

文昌鱼Rbx1同源基因的克隆,进化分析和表达图式的研究(英文)

在青岛文昌鱼中首次克隆到一个RINGbox同源基因,对其进行了序列特征和系统进化学分析,并且研究了该基因的胚胎发育和成体表达图式。AmphiRbx1演绎的蛋白序列与已知其他无脊椎动物和脊椎动物的同源分子表现出很高的相似性。利用原位杂交和RT-PCR技术研究该基因的表达,结果显示AmphiRbx1在胚胎发育各期均有表达,特别是在卵裂期胚胎和有高速分裂细胞的组织中有很强的表达。实验结果表明,Rbx1基因在进化中相当保守,AmphiRbx1可能在细胞分裂的调节中发挥作用。

循环microRNA在人类疾病诊断标志物筛选中的研究进展

目前,疾病的诊断需要结合临床表现（病史、症状和体征）、实验室检查、影像学检查等结果进行综合判断,涉及流行病学、病理生理学、免疫学、微生物学、生化学和遗传学等多学科内容。随着人类寿命延长和环境因素的变化,疾病的诊断模式和诊断方法也更加多样化,临床实践对诊断手段的实用性、准确性及预见性也提出了更高的要求。研究者对作为疾病分子诊断标志物的蛋白质、

法医物证学miRNA分析的研究进展

在种属和体液鉴定及降解检材等特殊案件的分析时,转录水平的miRNA所具有的生物属性及表达特点,使其能够发挥基因组DNA所不具备的价值。本文通过概述法医物证学miRNA研究的现状,对法医miRNA分析的研究策略和法医物证学应用前景进行了综述,以期为法医miRNA分析的应用研究提供借鉴。