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杧果叶片响应胶孢炭疽病菌侵染的转录组分析 被引量:1
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作者 叶子 孙宇 +6 位作者 刘志鑫 刘晓妹 蒲金基 张贺 黄海 宋锦佳 安仕芹 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第3期772-782,共11页
为探讨杧果抵御胶孢炭疽病菌的分子机制,分别以感病和未感病的‘贵妃杧’叶片为材料开展转录组测定和分析。本研究以‘贵妃杧’幼嫩叶片为材料,胶孢炭疽菌接种杧果叶片24 h后,转录组分析(RNA-seq)感病和未感病叶片之间的基因表达差异,... 为探讨杧果抵御胶孢炭疽病菌的分子机制,分别以感病和未感病的‘贵妃杧’叶片为材料开展转录组测定和分析。本研究以‘贵妃杧’幼嫩叶片为材料,胶孢炭疽菌接种杧果叶片24 h后,转录组分析(RNA-seq)感病和未感病叶片之间的基因表达差异,共得到序列46 733个,110个差异表达基因中,67个基因表达为上调,43个基因表达为下调。利用GO数据库对差异表达基因进行聚类分析,发现差异表达基因主要聚类在细胞及细胞组分、代谢过程、催化活性等方面。利用KEGG数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现,胶孢炭疽菌侵染主要影响了牛磺酸和牛磺酸代谢、淀粉、蔗糖代谢等途径中关键基因的表达水平。Autophagy-related protein 8C-like等11个基因的RT-qPCR验证与RNA-seq数据一致,且这些基因在6、12、24 h均能迅速响应胶孢炭疽菌的侵染。另外,三羧酸循环(TCA)过程中琥珀酸脱氢酶的4个亚基也参与了胶孢炭疽菌侵染杧果的过程。本研究从转录组水平上分析了杧果响应胶孢炭疽菌侵染过程中的一些关键基因,也从胶孢炭疽菌的角度分析了琥珀酸脱氢酶4个亚基参与了胶孢炭疽菌的侵染过程,有助于丰富杧果抗炭疽病菌的调控机制以及病原菌TCA循环在侵染过程中作用。 展开更多
关键词 杧果 胶孢炭疽菌 琥珀酸脱氢酶 转录组分析 差异表达基因
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木薯MeRsp基因克隆与原核表达 被引量:3
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作者 程潇 宋锦佳 +2 位作者 安仕芹 叶子 韦运谢 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第11期3517-3523,共7页
剪切因子在RNA剪接过程中发挥着重要作用,为更好地了解剪切因子RS亚家族Rsp的基因结构和特征,以进一步探究其在木薯抗逆境胁迫中的功能。本研究从木薯中克隆并验证了一个MeRsp基因,通过构建原核表达载体pET28a-MeRsp以分析不同温度对原... 剪切因子在RNA剪接过程中发挥着重要作用,为更好地了解剪切因子RS亚家族Rsp的基因结构和特征,以进一步探究其在木薯抗逆境胁迫中的功能。本研究从木薯中克隆并验证了一个MeRsp基因,通过构建原核表达载体pET28a-MeRsp以分析不同温度对原核表达菌株生长的影响,从而探究最适该蛋白的诱导表达条件。结果表明,在供试温度中,该蛋白的最适表达温度为37℃。探索木薯中剪切因子Rsp的功能,有利于为植物抗逆境胁迫的研究提供基础,开拓新思路。 展开更多
关键词 木薯(Manihot esculenta Crantz) 剪切因子 基因克隆 原核表达
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