目的运用甲基化DNA免疫共沉淀联合高通量测序(methylated DNA immunoprecipitation coupled with next-generation sequencing,MeDIP-seq)技术初步构建伴迟发性运动障碍(tardive dyskinesia,TD)精神分裂症患者的基因甲基化谱。方...目的运用甲基化DNA免疫共沉淀联合高通量测序(methylated DNA immunoprecipitation coupled with next-generation sequencing,MeDIP-seq)技术初步构建伴迟发性运动障碍(tardive dyskinesia,TD)精神分裂症患者的基因甲基化谱。方法人组伴TD精神分裂症患者5例(TD组)、不伴TD精神分裂症患者5例(非TD组)及健康志愿者5名(对照组),提取外周血全基因组DNA,制备MeDIP.seq文库。采用Agilent2100生物分析仪质控评估MeDIP.seq文库后使用Illumina HiSeq2000测序平台进行高通量测序。依次使用Off-Line Basecaller V1.8、BOWTIEV2.1.0及MACSV2对测序结果进行分析处理,再通过MACSV2识别每个样本的全部MeDIP峰,统计阈值设为富集倍数〉2,同时q〈10^-5。人口学及临床资料统计检验水准为α〈0.05。结果3组年龄((F=O.13)、受教育年限(F=0.23)、性别(X^2=10^-13)差异均无统计学意义(均P〉0.05);TD组与非TD组病程(t=-0.39)、用药时长(t=-O.68)差异均无统计学意义(均P〉0.05)。TD组、非TD组和对照组启动子区MeDIP峰相关基因数分别为1731、1673和1728个,TD组与对照组差异基因数为161个,与非TD组的差异基因数为372个,其中161个为TD组与非TD组及对照组的共同差异基因数。结论本研究初步构建了伴TD精神分裂症患者的基因甲基化谱,为后续研究限定目标基因范围提供了一定依据,但DNA甲基化在TD发生中的具体作用还需要进一步研究。展开更多