基于m5C相关基因构建三阴性乳腺癌预后预测模型及药物敏感性分析

为了探讨5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,m5C)相关基因在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)患者治疗及预后中的潜在价值,构建了基于m5C相关基因的预后预测模型,用于评估TNBC患者的预后和生存状况。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)数据库和癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载TNBC基因表达谱和相应的临床数据。通过Pearson分析确定了99个m5C相关基因,进一步采用单因素Cox分析鉴定出5个与预后有关的m5C相关基因(SLC6A14、BCL11A、UGT8、LMO4、PSAT1)并构建了风险评分(risk score)预测模型,根据风险评分中位值将患者划分为高风险组和低风险组。使用Kaplan-Meier(K-M)生存分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、多变量Cox回归分析、构建列线图和校准曲线评估了模型的预测效能。训练集和验证集的K-M生存曲线、受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)分析均验证了模型具有良好的预测能力。多变量Cox回归分析显示,风险评分可作为独立的预后生物标志物。使用ssGSEA、免疫评分分析和化疗药物对高低风险组患者的半最大抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)值差异分析显示,免疫细胞和免疫检查点基因以及大多数化疗药物的IC50值在不同风险组之间的表达存在显著差异。研究结果构建了基于5个m5C相关基因的风险评分预后预测模型,这将有助于阐明TNBC中m5C相关基因的作用机制,进而提供更有价值的预后及诊断的生物标志物和潜在的治疗靶点,为TNBC患者临床个性化治疗提供理论指导。

基于肿瘤相关成纤维细胞基因构建乳腺癌预后预测模型及免疫浸润分析

乳腺癌的转移和恶性进展与肿瘤微环境密切相关。肿瘤相关成纤维细胞(cancerassociatedfibroblasts,CAFs)是肿瘤微环境中比较重要的细胞,可影响肿瘤的进展及治疗。从基因表达综合数据库获得乳腺癌单细胞测序数据,对肿瘤微环境细胞进行分簇,再利用WGCNA识别CAF相关的关键基因,用该基因在TCGA-BRCA数据库中构建风险评分模型,进行生存分析、Cox回归分析、ROC曲线、构建列线图预测模型性能;通过GO和KEGG分析模型相关通路;利用体细胞突变、免疫浸润分析、干性指数分析以及药物敏感性分析探讨风险评分与临床特征及肿瘤微环境的关系。研究构建了基于10个CAF基因的乳腺癌预后预测模型,根据风险评分将患者分为高低风险组并进行验证,其中高风险组患者的预后更差,列线图和ROC曲线也显示模型具有良好的预测效能,乳腺癌病人免疫浸润水平更低、干性指数更高,且高风险组病人对紫杉醇及拉帕替尼这2种药物的敏感性更高。结果表明,10个CAF相关基因的风险评分可独立预测乳腺癌的预后及治疗效果,为明确CAF相关基因在乳腺癌中的作用机制提供了思路,也为乳腺癌易感基因患者的临床个体化治疗提供了理论依据。

Piezo1在癌症中的作用研究进展

Piezo1是机械敏感压电离子通道家族的成员,能够将各种机械刺激转换为电化学信号。在几种恶性肿瘤中Piezo1作为致癌介质起重要作用,它通过多种机制介导多种癌细胞的增殖、迁移和侵袭。多项研究表明,Piezo1的表达与衰老和癌症患者的临床特征有关,使Piezo1有望成为一种新的生物标志物。综述了Piezol的结构、Piezol通道的动力学特性及其在癌症中的作用,以期为Piezo1用于多种癌症的诊断和预后判断以及作为肿瘤生物标志物和治疗靶点提供参考依据。

联合检测Survivin与Egr-1在食管鳞癌中的表达及临床意义

目的探讨Survivin和Egr-1在食管鳞癌组织和正常食管组织中的表达情况,分析Survivin和Egr-1与食管鳞癌临床病理特征和预后的相关性。方法采用免疫组织化学染色方法检测2012年1月—2014年6月方便收集的80例食管鳞癌组织和20例正常食管组织中Survivin和Egr-1的蛋白表达水平,统计分析Survivin和Egr-1与临床病理特征和生存预后之间的关系。结果Survivin在食管鳞癌组织中阳性表达率为68.8%(55/80),高于在正常组织中的阳性表达率5.0%(1/20)(χ^2=26.39,P<0.05)。Egr-1在食管鳞癌中的低表达率为66.3%(53/80),高于正常组织中的15.0%(3/20)(χ^2=17.06,P<0.05)。Survivin蛋白在食管鳞癌中阳性高表达与患者的性别、年龄以及肿瘤的分化程度,差异无统计学意义(P>0.05),与食管鳞癌患者TNM分期、肿瘤的浸润深度、肿瘤大小以及淋巴结是否转移,差异有统计学意义(P<0.05)。Egr-1蛋白在食管鳞癌中阳性低表达与患者性别、肿瘤大小以及肿瘤浸润深度,差异无统计学意义(P>0.05),与食管鳞癌患者年龄、TNM分期、肿瘤分化程度以及淋巴结是否转移,差异有统计学意义(P<0.05)。随访结果显示食管鳞癌患者5年生存率为48.9%,中位生存时间为53.1个月。结论Survivin和Egr-1在食管鳞癌的发生发展中起重要作用,联合检测两者对判断食管鳞癌的预后有一定的指导意义,Survivin和Egr-1有望作为食管鳞癌的治疗或者预后预测靶标。