基于机器学习筛选食管鳞状细胞癌的特征基因与免疫细胞浸润分析及中药预测

目的:探索食管鳞状细胞癌(ESCC)可能的作用靶点及其发病机制,并利用生物信息学技术预测潜在治疗ESCC的中药。方法:通过检索GEO数据库获取ESCC的基因芯片,从中筛选出差异基因。利用R软件包“ColorsESCCE、Stringi、GGplot2、Bioconductor”对基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行差异基因的富集分析。使用R软件包“E1071,PreProcessCore”将获得的差异基因基于CiberSort算法对22个免疫细胞进行浸润分析,了解免疫浸润细胞与特征基因之间的相关性。通过Coremine和Herb数据库检索特征基因治疗ESCC的潜在中药。结果:得到UBL3、KIF4A、KIF14、GPX3共4个食管鳞状细胞癌特征基因。免疫细胞浸润分析结果显示,在食管鳞状细胞癌患者体内CD4^(+)T细胞、M0巨噬细胞、M2巨噬细胞、活化的树突状细胞显著上调;静息的肥大细胞、活化的肥大细胞显著下调。丹参、香橼、西红花、枸杞子、茯苓、人参、鳖甲等中药是潜在治疗食管鳞状细胞癌的药物。结论:特征基因与ESCC的病程进展相关,并预测丹参、香橼、西红花、枸杞子、茯苓、人参、鳖甲等中药是ESCC潜在靶向特征基因的治疗药物,为ESCC的临床诊治和药物开发提供了新的方向,同时也为ESCC患者提供了更多的治疗方法和途径。

中医药调控相关信号通路治疗胃食管反流病的研究进展

胃食管反流病(GERD)是临床上常见的消化系统疾病,因其易反复、迁延难愈等特点严重地影响了患者的生活质量及身心健康。当前,西医常用质子泵抑制剂、胃肠动力药来治疗该病,然而长期使用效果不佳且不良反应多。中医药在改善GERD患者生活质量、降低复发率等方面具有显著疗效。中医药可通过调控多种信号通路恢复食管下括约肌功能,调节食管上皮细胞增殖凋亡情况,改善食管内脏高敏感,修复食管黏膜、减轻炎症。本文通过梳理中医药治疗GERD的实验研究,系统总结了中医药治疗GERD的主要相关信号通路,以期为GERD后续科学研究和临床治疗提供参考。

东白令海刺黄盖鲽(Limanda aspera)年龄与生长的调查研究

刺黄盖鲽是黄盖鲽属中最重要的经济鱼种,也是东白令海鲽科鱼类中产量最高的鱼种。其分布于北美南部海岸到不列颠哥仑比亚北部水域,但它在阿拉斯加湾未能形成商业性渔业。在太平洋西北部水域,则分布于从阿纳德尔湾(Gulf of Anadyr)至朝鲜东海岸附近,并且在堪察加半岛西海岸及鄂霍茨克海的一些海域形成商业性渔场。过去美国、苏联、日本等国的渔业科学家对该鱼做了不少研究,但在国内除了对黄盖鲽(Pseudoplcuronectes yokokamae)开展过生物学研究外,对刺黄盖鲽还未进行过调查研究。故笔者拟将参加“烟运二号”生产实践和考察中搜集的刺黄盖鲽资料整理如下,以供参考。

东白令海的刺黄盖鲽渔场海洋学与渔业生物学特征

本文概述了东白令海形成刺黄盖鲽渔场的海洋学特征,并结合现场调查的标样侧重分析了刺黄盖鲽的渔业生物学特征,本文还概略地讨论了该鱼与渔业资源的关系。