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石油烃厌氧降解基因masD和bamA实时荧光定量PCR方法的建立及应用 被引量:3
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作者 宋本如 甄梅楠 +1 位作者 刘小妹 唐景春 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期207-213,共7页
masD和bamA基因分别是烷烃和芳烃厌氧降解的关键基因。本研究建立了这两种基因的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法。通过参考相关石油烃厌氧降解菌株的Gen Bank序列,利用Primer express软件设计烷烃和芳烃厌氧降解基因的扩增引物ma... masD和bamA基因分别是烷烃和芳烃厌氧降解的关键基因。本研究建立了这两种基因的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法。通过参考相关石油烃厌氧降解菌株的Gen Bank序列,利用Primer express软件设计烷烃和芳烃厌氧降解基因的扩增引物masD-f、masD-r和bamA-f、bamA-r。经过常规PCR扩增分别得到片段大小为389和354 bp扩增产物,经测序并在NCBI数据库查询,确定为masD和bamA片段。通过实时荧光定量PCR构建测定这两种基因的标准曲线。优化后的扩增体系(25μL)为:12.5μL 2×Trans Start Top Green qPCR Super Mix,引物浓度为0. 2μmol/L,masD和bamA基因最适退火温度分别为52℃和56℃。建立的两种基因的实时荧光定量PCR检测方法具有非常好的重复性,其灵敏度比传统PCR技术高100倍。对于氧化石墨烯促进石油烃的厌氧降解体系中厌氧基因的定量检测显示,添加不同浓度的石墨烯均促进了bamA拷贝数的增加,但对masD的拷贝数无显著影响。 展开更多
关键词 石油烃 厌氧降解基因 masD基因 bamA基因 实时荧光定量聚合酶链式反应
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5种沉水植物对斜生栅藻的化感作用 被引量:9
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作者 闫志强 宋本如 +7 位作者 刘黾 刘燕 吴小业 李洁珊 林燕珍 冯翊果 陈章和 赵建刚 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期75-79,共5页
为了解不同湿地植物和不同处理方式下化感作用的差异,在实验室条件下,研究5种常见的沉水植物黑藻(Hydrilla verticillata)、伊乐藻(Elodea nuttallii)、狐尾藻(Myriophyllum spicatum)、苦草(Vallisneria natans)和皇冠草(Echinodorus a... 为了解不同湿地植物和不同处理方式下化感作用的差异,在实验室条件下,研究5种常见的沉水植物黑藻(Hydrilla verticillata)、伊乐藻(Elodea nuttallii)、狐尾藻(Myriophyllum spicatum)、苦草(Vallisneria natans)和皇冠草(Echinodorus amazonicus)与斜生栅藻(Scenedesmus obliquus)共培养以及用这5种植物的种植水、浸提液培养斜生栅藻时藻细胞数量及叶绿素a浓度的变化.结果显示,5种植物与斜生栅藻共培养时抑藻效果最明显(1.6×108 cells L-1),其斜生栅藻细胞数量显著低于种植水(6.2×108 cells L-1)和浸提液组(4.5×108 cells L-1)(P<0.05),但5种植物间的差异不显著;除黑藻外,其他4种植物的浸提液培养斜生栅藻时均表现出对斜生栅藻明显的抑制效果,斜生栅藻的相对生长率显著低于对照组和黑藻组(P<0.05);5种植物的种植水培养斜生栅藻时则表现出相对较弱的抑藻效果,且植物间差异不显著.本研究表明,沉水植物对藻类的化感作用因不同植物和不同处理而有着显著不同. 展开更多
关键词 沉水植物 斜生栅藻 化感作用 显微计数
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