基于分子对接探究熊果酸衍生物H21对引起炎症的关键蛋白的作用

利用分子对接方法,探究H21对分泌炎症因子的关键蛋白的影响.从引起炎症的经典通路中选取关键靶蛋白,通过Glide分子对接,将H21和原配体、靶蛋白对接.通过二者对接得到分值,筛选与H21结合较好的靶蛋白及关键氨基酸,并分析其二者的相互作用.结果显示:H21与Toll-like通路中关键蛋白IRAK1蛋白结合较好,Glide-gscore为-9.873,优于原配体,H21与IRAK1结合的关键氨基酸为Ile218;理论数据表明:抗炎药物H21可能作用于IRAK1蛋白,通过影响IRAK1蛋白的表达,从而发挥抗炎作用,为揭示H21的抗炎机制和作用靶点提供了理论依据.

基于分子对接技术筛选低聚壳聚糖作为抗COVID-19潜在性药物

目的以SARS-CoV-2的Spike蛋白(S蛋白),血管紧张素转化酶-2(ACE2)和SARS-CoV-2的3CLpro水解酶为靶标,以壳聚糖为小分子,利用分子对接筛选S蛋白、ACE2阻断剂和3CLpro抑制剂,且指导以低聚壳聚糖作为SARS-CoV-2潜在的阻断剂和抑制剂的药物的研发。方法软件预测S蛋白,ACE2和3CLpro晶体结构模型上的活性位点,利用Glide分子对接技术虚拟筛选不同聚合度的壳聚糖,通过结合打分值以及与靶蛋白受体的相互作用模式,获得具有抗SARS-CoV-2潜在活性的低聚壳聚糖。结果壳二糖,壳三糖,壳四糖和壳五糖的理论数据确定低聚壳聚糖(聚合度≤5)与S蛋白,ACE2及3CLpro结合效果都较好,可作为COVID-19潜在的阻断剂和抑制剂。其与S蛋白,ACE2和3CLpro主要氨基酸以氢键和盐桥作用结合,聚合度>5的壳聚糖与S蛋白,ACE2及3CLpro没有结合。结论聚合度在2-5的壳聚糖作为S蛋白与ACE2结合阻断剂和3CLpro抑制剂具有潜在的抗COVID-19作用,揭示了S蛋白,ACE2和3CLpro与不同低聚壳聚糖结合的结合位点和作用形式,为后续以不同低聚壳聚糖作为COVID-19潜在的阻断剂和抑制剂的研究奠定坚实的理论基础。

分子对接技术筛选沉香中抗新型冠状病毒活性成分

从沉香中筛选潜在的抗新型冠状病毒活性成分,指导以沉香小分子作为SARS-CoV-2潜在阻断剂和抑制剂药物的研发。根据沉香已知的化学成分,采用分子对接的方法,以血管紧张素转化酶-2(ACE2)、SARS-CoV-2的3CL水解酶(3CLpro)为靶标,通过结合打分值以及与靶蛋白受体的相互作用模式,获得沉香中具有潜在抗SARS-CoV-2活性的化学成分。分子对接结果表明:共有6种化学成分可作为ACE2结合阻断剂,有4种化学成分可作为3CLpro抑制剂,且均为2-(2-苯乙基)色酮类化合物;主要作用方式为氢键、疏水、π-π共轭作用力,其中5,6,7,8-四羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯乙基)-5,6,7,8-四氢-4H-色原烯与靶标蛋白形成的氢键数目最多,分子对接效果最优。基于分子对接的虚拟筛选方法可快速筛选沉香中潜在的抗新型冠状病毒活性成分,其中5,6,7,8-四羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯乙基)-5,6,7,8-四氢-4H-色原烯可优选作为后续抗SARS-CoV-2药物的研究。研究结果可指导以沉香小分子为前体的COVID-19的新药研发。

柠檬酸交联魔芋葡甘聚糖多孔材料的制备及机械性能

采用来源广泛且廉价的魔芋葡甘聚糖(KGM)为原料,通过不同温度(5~85℃)使柠檬酸(CA)与KGM形成交联的CA-KGM多孔材料。分别考察了KGM加入量、CA加入量、反应温度及反应时间对CA-KGM机械性能的影响;以这3个因素为考察对象进行正交优化实验;通过扫描电子显微镜观察产品形貌。结果表明:合适的KGM和CA加入量、温度及反应时间才能得到黏度适宜、吸水率较好、机械性能强的CA-KGM多孔材料。通过优化实验条件,在KGM质量浓度10 g/L、CA质量浓度10 g/L、反应温度65℃、反应时间2 h条件下得到的CA-KGM拉伸强度为0.95 MPa、断裂伸长率为16.7%。