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基于SNP芯片分析徽县青泥黑猪遗传多样性和遗传结构
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作者 宋科林 闫尊强 +5 位作者 王鹏飞 程文昊 李杰 白雅琴 孙国虎 滚双宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期995-1006,共12页
旨在分析徽县青泥黑猪遗传多样性和遗传结构,为其作为新遗传资源申报、保护与利用提供参考。本研究以甘肃省2个已知地方猪种(八眉猪、合作猪各20头)和待鉴定新猪种(徽县青泥黑猪28头)共68头猪为研究对象,利用“中芯一号”50K SNP芯片检... 旨在分析徽县青泥黑猪遗传多样性和遗传结构,为其作为新遗传资源申报、保护与利用提供参考。本研究以甘肃省2个已知地方猪种(八眉猪、合作猪各20头)和待鉴定新猪种(徽县青泥黑猪28头)共68头猪为研究对象,利用“中芯一号”50K SNP芯片检测全基因组范围内单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs),采用多种软件分析徽县青泥黑猪遗传多样性、遗传结构、群体分化指数及亲缘关系。结果显示:共检测到55 156个SNPs,质控后剩余49 279个SNPs;徽县青泥黑猪的有效群体含量(N_(e))、期望杂合度(H_(e))、观察杂合度(H_(o))、多态标记比例(PN)和核苷酸多样性(Pi)分别为2.2、0.370 7、0.386 4、0.915 7、0.378 6,均高于合作猪和八眉猪,且徽县青泥黑猪的连锁不平衡系数较低,衰减速度较快;PCA显示,3个群体分别聚类,根据PC1(PC1>0)可将HX群体和HZ、BM群体区分开,进化树分析发现徽县青泥黑猪独自聚为一支,八眉猪和合作猪聚为另一大支,随后逐渐分离,群体结构显示,当K=3时,徽县青泥黑猪呈现出与八眉猪、合作猪不同的进化路线,但徽县青泥黑猪血缘较为混杂;徽县青泥黑猪与八眉猪、合作猪之间的群体分化指数分别为0.123 6和0.159 8,表明各猪种之间存在一定程度的遗传分化;IBS矩阵和G矩阵分析发现,徽县青泥黑猪大部分个体之间亲缘关系较远,少数个体亲缘关系较近。本研究基于“中芯一号”50K SNP芯片数据分析了徽县青泥黑猪的遗传多样性及遗传结构,发现徽县青泥黑猪遗传多样性高于八眉猪和合作猪,独立聚类,且与八眉猪、合作猪之间有明显的遗传分化,初步认为是甘肃地方新猪种,徽县青泥黑猪部分个体之间存在近交风险,需要加强保种,该研究为深入挖掘徽县青泥黑猪新遗传资源及合理保种利用提供参考。 展开更多
关键词 徽县青泥黑猪 SNP芯片 遗传多样性 遗传结构 亲缘关系
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全株青贮玉米粉对育肥猪生长性能、血清生化指标、抗氧化能力及免疫指标的影响
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作者 程文昊 徐裕 +4 位作者 宋科林 石海霞 闫尊强 王鹏飞 滚双宝 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1021-1030,共10页
【目的】研究添加不同比例全株青贮玉米粉对育肥猪生长性能、血清生化指标、抗氧化能力及免疫指标的影响,并确定最佳添加比例。【方法】选取平均体重(39.03±5.53)kg的“杜×长×大”育肥猪40头,随机分为4组,每组10头。对... 【目的】研究添加不同比例全株青贮玉米粉对育肥猪生长性能、血清生化指标、抗氧化能力及免疫指标的影响,并确定最佳添加比例。【方法】选取平均体重(39.03±5.53)kg的“杜×长×大”育肥猪40头,随机分为4组,每组10头。对照组饲喂基础饲粮(不添加全株青贮玉米粉),试验组分别饲喂添加5%(Ⅰ组)、10%(Ⅱ组)和15%(Ⅲ组)全株青贮玉米粉试验饲粮,正试期90 d。测定每头猪初始体重、终末体重,记算平均日采食量;试验结束后,每组随机选取3头体重相近的猪,前腔静脉采血10 mL,测定血清生化指标、抗氧化指标及免疫指标。【结果】(1)与对照组相比,Ⅱ组猪料重比(F/G)显著降低(P<0.05),Ⅲ组终末体重(FBW)、平均日增重(ADG)极显著或显著降低(P<0.01;P<0.05)。(2)与对照组相比,Ⅱ组猪血清球蛋白(GLB)和Ⅲ组血清甘油三酯(TG)含量均显著提高(P<0.05),Ⅰ和Ⅱ组血清谷草转氨酶(AST)含量均显著降低(P<0.05)。(3)与对照组相比,Ⅱ和Ⅲ组猪血清超氧化物歧化酶(SOD)活性极显著提高(P<0.01),Ⅰ和Ⅱ组血清总抗氧化能力(T-AOC)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性均极显著提高(P<0.01),Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组血清丙二醛(MDA)含量均极显著降低(P<0.01)。(4)与对照组相比,Ⅱ组猪血清IgG、IgM含量均显著提高(P<0.05);Ⅱ组血清IL-1β含量较对照组、Ⅰ和Ⅲ组显著或极显著降低(P<0.05;P<0.01)。【结论】饲粮中添加10%全株青贮玉米粉能降低育肥猪料重比,提高抗氧化能力,增强机体免疫力。 展开更多
关键词 全株青贮玉米粉 育肥猪 生长性能 血清生化指标 抗氧化指标 免疫指标
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合作猪SIRT 3基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
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作者 闫尊强 梁毓豪 +2 位作者 宋科林 滚双宝 王鹏飞 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1390-1399,共10页
【目的】克隆合作猪沉默信息调节因子3(silence information regulator 3,SIRT3)基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析,探究SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达水平,为研究SIRT 3基因功能奠定基础。【方法】试验选择3月龄合作猪公猪... 【目的】克隆合作猪沉默信息调节因子3(silence information regulator 3,SIRT3)基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析,探究SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达水平,为研究SIRT 3基因功能奠定基础。【方法】试验选择3月龄合作猪公猪3头,采集心脏、睾丸、肺脏等组织,采用PCR扩增、Sanger测序等方法获取SIRT 3基因CDS区序列,并通过Mega 7.0软件构建系统进化树;通过生物信息学在线软件分析SIRT3蛋白结构和功能;采用实时荧光定量PCR检测SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达量。【结果】合作猪SIRT 3基因CDS区长774 bp,共编码257个氨基酸。系统进化树结果显示,合作猪与家猪亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远。SIRT3蛋白的分子质量为28.68 ku,理论等电点为5.81,不稳定系数为37.92,为稳定性亲水蛋白;该蛋白不存在跨膜区域,无信号肽,但存在2个低复杂度结构域,主要分布于内质网中;SIRT3蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三级结构模型预测结果与二级结构基本一致。实时荧光定量PCR结果显示,SIRT 3基因在合作猪不同组织中均有表达,在心脏中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),其次是睾丸、肺脏、肝脏组织。【结论】本研究成功克隆合作猪SIRT 3基因CDS区序列,探究了SIRT 3基因在合作猪不同组织中的表达水平并初步分析了其编码蛋白的生物学功能,为进一步研究合作猪SIRT 3基因功能提供了参考。 展开更多
关键词 合作猪 SIRT 3基因 克隆 生物信息学分析 组织表达
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电视媒体形象广告研究
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作者 宋科林 李慢黎 张晓萍 《西部广播电视》 2018年第2期68-69,71,共3页
进入21世纪以来,媒体间的竞争日趋白热化,为了增强自身实力,赢得一席之地,媒体行业不断创新,积极利用广告塑造自身形象,进而获取观众的关注。本文结合已有对媒体形象广告的研究,不断探索、分析,把视角放在电视媒体形象广告上,对电视媒... 进入21世纪以来,媒体间的竞争日趋白热化,为了增强自身实力,赢得一席之地,媒体行业不断创新,积极利用广告塑造自身形象,进而获取观众的关注。本文结合已有对媒体形象广告的研究,不断探索、分析,把视角放在电视媒体形象广告上,对电视媒体形象广告发展的现状、电视媒体形象广告是如何融入CIS识别系统以及在操作过程中产生的误区进行探究。 展开更多
关键词 电视广告 媒体形象 CIS
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初探传统媒体与新媒体的融合现状与困境——以广安市广播电视台手机客户端、微信为例 被引量:3
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作者 杨子会 吴一龙 +1 位作者 张晓萍 宋科林 《西部广播电视》 2018年第4期178-179,181,共3页
随着中央全面深化改革领导小组《关于推动传统媒体和新兴媒体融合发展的指导意见》获得审议通过,传统媒体和新媒体的融合发展,再度成为人们关注的焦点。近年来,随着数字技术和移动互联网迅猛发展,"人人都有麦克风""人人... 随着中央全面深化改革领导小组《关于推动传统媒体和新兴媒体融合发展的指导意见》获得审议通过,传统媒体和新媒体的融合发展,再度成为人们关注的焦点。近年来,随着数字技术和移动互联网迅猛发展,"人人都有麦克风""人人都是自媒体"的技术环境不断冲击着传统媒体的影响力。鉴于这一形势,许多市级广播电视台纷纷开始寻求与新媒体的融合发展。这一过程中,市级广播电视台既取得了成绩,也暴露出了许多问题。本文尝试对广安市广播电视台新媒体发展作客观全面的分析思考,探寻传统媒体与新媒体的融合现状与困境。 展开更多
关键词 传统媒体 新媒体 市级电视台 融合发展
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