甜瓜黄绿叶色性状的遗传分析及其初步定位

为了研究叶色突变对甜瓜光合性能的影响并定位调控叶色的基因,对厚皮甜瓜黄绿叶色材料M68和叶色正常材料M465进行叶绿素荧光动力参数测定。结果显示,与M465相比,M68暗适应后的最小荧光值Fo、最大荧光值Fm及可变荧光值Fv均显著降低,而Fv/Fm比值显著升高,表明M68叶绿素含量下降导致PSII电子传递的最大潜力及光化学反应能力显著下降,同时PSII最大光量子效率增强。利用M68和M465构建BC1群体,对控制甜瓜黄绿叶色的基因进行遗传规律分析和基因定位研究。结果表明,甜瓜黄绿叶色性状是由1对隐性单基因控制的,命名为yellow-green leaf(ygl)基因。利用分离群体分组分析法(bulked segregate analysis,BSA)对BC1群体中的绿色与黄绿叶色2个混池进行简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记筛选,初步将ygl基因定位在甜瓜第11染色体上。ygl基因与两侧最近的SSR标记分别相距0.6 cM(CmSSR25149)和0.3 cM(CmSSR25196),物理距离1180 kb。

西瓜全基因组SSR位点的特征及其在比较遗传作图和遗传多样性分析中的应用

目的与意义:随着新一代全基因组测序技术的快速发展,越来越多的物种开发了大量的覆盖全基因组的SSR标记.虽然在西瓜上也开发了一些SSR标记,并已经在连锁图谱和遗传多样性研究中得到应用,但仍存在多态性低、基因组覆盖率低等问题.本研究从西瓜全基因组水平分析了不同类型SSR序列的分布及频率.并开发了覆盖全基因组的SSR标记,同时通过电子PCR的方法确定了在甜瓜、黄瓜中通用的SSR分子标记,并利用这些通用SSR标记进一步明确了西瓜与黄瓜以及甜瓜3个物种之间的染色体共线性关系.本研究同时筛选了32对高多态性SSR标记对134份西瓜材料进行了遗传多样性及群体结构分析.

多重PCR在甜瓜种子纯度鉴定中的应用

为获得一种高效、低成本的甜瓜种子纯度鉴定方法,本研究采用碱裂解法从甜瓜叶片中提取基因组DNA,设计10个组合,采用10μL反应体系和Touch-down反应程序进行PCR扩增。结果表明多重PCR并不影响扩增结果;最适PCR产物片段差为60 bp及以上;同一反应体系中适宜添加的标记对数为2~3对。使用本研究方法可有效克服传统单一PCR在种子纯度鉴定中速率慢的缺陷,具有省时、省力、低成本、特异性好、准确性高等特点,能够简捷快速地获知甜瓜种子材料的纯度,以便于更有针对性地开展后续的种质资源分析和育种工作。