通过TCGA数据库研究干扰素调节因子7在肾透明细胞癌中的作用

目的通过TCGA数据库研究干扰素调节因子7(interferon regulatory factor 7,IRF7)在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中的表达,并分析其表达水平对ccRCC患者预后的影响,探讨与其表达相关的基因网络。方法利用Ualcan、GEPIA、人类蛋白质图谱(human protein atls,HPA)、TIMER 2.0等数据库分析ccRCC组织中IRF7 mRNA和蛋白质水平变化。运用Ualcan、GEPIA、HPA数据库研究IRF7表达与ccRCC临床病理学参数的关系及对预后的影响。在String-DB数据库中探索并验证IRF7基因在细胞信号转导通路中的位置以及与其关系密切的上下游基因。结果IRF7在ccRCC中的表达升高,差异有统计学意义(P<0.01),且与ccRCC的不良预后相关,差异有统计学意义(P<0.05),其表达与ccRCC的临床分期、有无淋巴结转移及ccRCC亚型相关;预后分析显示,IRF7高表达组患者较低表达组生存率降低,差异有统计学意义(P<0.01)。结论通过数据库信息挖掘发现,IRF7在ccRCC组织中呈高表达,且高表达是ccRCC患者预后的不利因素,为后续的ccRCC研究提供重要的理论依据。

基于TCGA数据库研究FKBP10在肾癌中的表达及与患者预后的相关性

目的探讨FKBP10在肾癌中的表达及与患者预后的关系。方法运用人类蛋白质表达图谱(The Human Protein Atlas,HPA)数据库发现与肾癌预后不良相关的基因FKBP10在肾癌中表达较高,运用Ualcan数据库和HPA分析FKBP10在肾癌组织中mRNA和蛋白质水平的变化,运用GEPIA数据库对FKBP10在肾癌表达情况及其与肾癌患者预后的相关性进行分析。结果 FKBP10在肾癌中的表达明显升高(P <0. 001)且与肾癌的不良预后相关,其表达与肾癌的病理细胞核分级以及临床分期相关(P <0. 001),而与患者性别无关。生存分析结果发现,FKBP10高表达组在无疾病进展生存期和总生存率较低表达组生存较差(P <0. 001)。结论通过数据库信息研究发现,FKBP10在肾癌组织中呈高表达,且其表达水平与肾患者的预后相关,将为后续的肾癌研究提供重要的理论依据。

应用生物信息学方法分析肾透明细胞癌中FKBP11的表达

目的探讨FK506结合蛋白11(FKBP11)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达,并分析FKBP11表达水平与患者临床病理特征之间的相关性。方法利用Ualcan、GEPIA数据库和HPA数据库分析FKBP11在ccRCC组织中mRNA和蛋白表达水平的变化、FKBP11表达与ccRCC临床及病理特征的相关性及其对患者预后的影响,通过这几个维度分析FKBP11在ccRCC中的作用。结果 FKBP11在ccRCC中mRNA的表达较正常肾组织升高,通过Ualcan数据库检测发现FKBP11在ccRCC病理分级中正常肾组织与Grade1、Grade2、Grade3、Grade4中表达差异分别为P=5.78E-05、P=1.62E-12、P=1.11E-16、P=1.63E-12,在ccRCC亚型(ccA和ccB)中正常与ccA及ccB中表达差异均为P=1.62E-12, TNM分期中正常与N0及N1分期各亚组之间的表达有差异(P<1E-12、P=8.26E-05),以上差异均具有统计学意义(P<0.05),且随着ccRCC病理分级的升高,FKBP11的表达存在上调趋势,其表达水平与ccRCC的进展相关,而FKBP11的表达水平与年龄、性别、人种各亚组之间相互比较差异均无统计学意义(P>0.05)。FKBP11高表达患者的总生存率较低表达组患者差异有统计学意义(P<0.01)。结论通过检索分析数据库信息发现FKBP11在ccRCC中呈高表达,其在ccRCC的不同分期、病理分级及亚型各亚组之间存在表达差异,较差的病理分级及分期FKBP11的表达较高,且高表达的FKBP11的ccRCC患者预后较差。

血浆纤维蛋白原与白蛋白比值对膀胱肿瘤诊断价值探讨

目的探讨恶性膀胱尿路上皮肿瘤血浆纤维蛋白原与白蛋白比值(FAR)的诊断价值。方法选择2007-06-01-2020-06-30曹县人民医院泌尿外科初诊为膀胱尿路上皮肿瘤且接受手术治疗的391例患者作为研究对象。对FAR与膀胱尿路上皮肿瘤病理特征的相关性进行分析,并应用ROC曲线评估FAR值鉴别恶性及进展性膀胱肿瘤的效果。结果391例患者中乳头状瘤25例(6.4%),低度恶性潜能尿路上皮肿瘤(PUNLMP)63例(16.1%),膀胱尿路上皮癌(BUC)303例(77.5%)。303例BUC患者中,低级别169例(55.8%),高级别134(44.2%);非肌层浸润性BUC(non-muscle-invasive bladder urothelial carcinoma,NMIBC)为T_(1)患者251例(82.8%),MIBC为T_(2)~T_(4)患者52例(17.2%)。391例患者的FAR平均值为0.074±0.022,与正常体检者的0.043±0.017比较,差异有统计学意义,t=22.385,P<0.001。BUC患者的FAR水平为0.076±0.023,高于乳头状瘤和PUNLMP患者的0.069±0.018,t=3.005,P=0.009;高级别BUC患者的FAR值为0.081±0.023,高于低级别BUC患者的0.071±0.022,t=3.832,P<0.001;高级别MIBC膀胱尿路上皮肿瘤患者的FAR值为0.087±0.025,高于低级别NMIBC患者的0.073±0.021,t=3.772,P<0.001。FAR值对于BUC、高级别BUC和MIBC的曲线下面积分别为0.59(95%CI为0.53~0.66)、0.65(95%CI为0.59~0.71)和0.69(95%CI为0.61~0.77)。结论FAR值可以为诊断恶性膀胱肿瘤以及预测进展性肿瘤提供参考依据。