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α类蛋白质折叠类型自动化分类研究
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作者 宗立平 李晓琴 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第5期381-388,共8页
蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容,折叠类型分类是折叠识别的基础。通过对ASTRAL-1.65数据库α类蛋白质所属折叠类型进行系统研究,建立蛋白质折叠类型模板数据库,提取反映折叠类型拓扑结构的模板特征参数,根据模板特征参数... 蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容,折叠类型分类是折叠识别的基础。通过对ASTRAL-1.65数据库α类蛋白质所属折叠类型进行系统研究,建立蛋白质折叠类型模板数据库,提取反映折叠类型拓扑结构的模板特征参数,根据模板特征参数和TM-align结构比对结果,建立基于特征参数的打分函数Fdscore,并实现α类蛋白质折叠类型自动化分类。使用相同数据集样本,将Fdscore分类方法与TM-score分类方法对比,Fdscore分类方法的平均敏感性、平均特异性、MCC值分别为71.86%、99.49%、0.69,均高于TM-score分类方法相对应结果。上述结果表明该分类方法可用于α类蛋白质折叠类型的自动化分类。 展开更多
关键词 α类蛋白质 折叠类型 打分函数 Fdscore 自动化分类
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孔隙含盐量对原油驱替效率的影响
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作者 张建 宗立平 《大庆石油地质与开发》 CAS CSCD 2001年第1期56-57,共2页
对储层中含有硬盐的凝析气田进行了孔隙含盐量与原油采收率影响关系的研究 ,论证了该储层的淡水驱替、毛管油驱替、聚合物驱替对原油采收率增值的影响 。
关键词 凝析油气田 含硬盐储层 淡水驱替 毛管油驱替 聚合物驱替 采收率 储层特征
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