人疱疹病毒6型感染HSB-2细胞的lncRNA表达谱变化分析

目的运用高通量测序技术检测人疱疹病毒6型(human herpesvirus 6,HHV-6)感染人淋巴细胞系HSB-2后长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的改变,探究lncRNA在HHV-6感染复制中的作用。方法HHV-6感染HSB-2细胞72 h后,提取对照细胞和病毒感染细胞的RNA进行测序,筛选差异表达的lncRNA;通过生物信息学方法对预测的lncRNA靶基因进行GO注释和KEGG信号通路分析,构建共表达网络图。qRT-PCR检测差异表达lncRNA的变化倍数。结果共筛选到612个显著差异表达lncRNA,其中420个为表达上调,192个表达下调。通过对lncRNA靶基因进行GO和KEGG富集分析显示,差异表达lncRNA的靶基因与表观染色体调控、免疫应答及细胞代谢等生物学过程密切相关。qRT-PCR确定10条上调IncRNAs表达变化趋势与高通量测序数据一致。结论本研究对HHV-6感染HSB-2细胞的lncRNA表达谱进行分析,为深入探索lncRNA在HHV-6复制增殖及相关疾病中的作用奠定基础。