侵染月季的香石竹潜隐病毒属新病毒鉴定及其全基因组序列分析

2019年7月,在北京市月季叶片上观察到了黄色斑驳症状,高通量测序(High-throughput sequencing, HTS)显示在感病样本中存在一种新的正义ssRNA病毒。该病毒全基因组序列除去3′末端poly(A)后由8 393个核苷酸(nucleotide, nt)组成,含5个开放阅读框(open reading frame, ORF)。其依赖于RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRp)在氨基酸水平上与已知乙型线状病毒科(Betaflexiviridae)成员具有35.87%-46.74%的序列一致性。系统发育分析表明,该新病毒与香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)的杨树花叶病毒(poplar mosaic virus, PopMV)亲缘关系最近。发生率调查显示该新病毒在北京地区分布较为广泛。根据Betaflexiviridae的划分标准,该病毒是Carlavirus的一个新种,暂时命名为月季C病毒(rose virus C)。